RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000172142.7

Nisch-222, Transcript of Nischarin, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nisch, Length 2,780 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nisch-222ENSMUST00000172142 Col16a1Q8BLX7 1580 aa27.3■■□□□ 1.96
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ncbp1Q3UYV9 790 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
Nisch-222ENSMUST00000172142 Bend3Q6PAL0 825 aa27.3■■□□□ 1.96
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ddx11Q6AXC6 880 aa27.3■■□□□ 1.96
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ptgs1P22437 602 aa27.29■■□□□ 1.96
Nisch-222ENSMUST00000172142 NaspQ99MD9 773 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
Nisch-222ENSMUST00000172142 Wdr24Q8CFJ9 790 aa27.29■■□□□ 1.96
Nisch-222ENSMUST00000172142 Nap1l3Q794H2 544 aa27.28■■□□□ 1.96
Nisch-222ENSMUST00000172142 Arap3Q8R5G7 1538 aa27.28■■□□□ 1.96
Nisch-222ENSMUST00000172142 Igbp1bQ9QZ29 343 aa27.28■■□□□ 1.96
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gm10563F6WIE4 79 aa27.27■■□□□ 1.96
Nisch-222ENSMUST00000172142 1700006A11RikB9EHI3 544 aa27.27■■□□□ 1.96
Nisch-222ENSMUST00000172142 Fkbp4P30416 458 aa27.27■■□□□ 1.96
Nisch-222ENSMUST00000172142 CgnP59242 1191 aa27.27■■□□□ 1.96
Nisch-222ENSMUST00000172142 Cspp1B2RX88 1205 aa27.26■■□□□ 1.96
Nisch-222ENSMUST00000172142 Snx13Q6PHS6 957 aa27.26■■□□□ 1.96
Nisch-222ENSMUST00000172142 Eif4a1P60843 406 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
Nisch-222ENSMUST00000172142 Abcc10Q8R4P9 1501 aa27.26■■□□□ 1.95
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ccdc162pQ0VG85 912 aa27.26■■□□□ 1.95
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ccdc66Q6NS45 935 aa27.26■■□□□ 1.95
Nisch-222ENSMUST00000172142 Phlpp1Q8CHE4 1687 aa27.25■■□□□ 1.95
Nisch-222ENSMUST00000172142 Cdca7lQ922M5 438 aa27.25■■□□□ 1.95
Nisch-222ENSMUST00000172142 Cd22P35329 862 aa27.25■■□□□ 1.95
Nisch-222ENSMUST00000172142 D430041D05RikF6ZGR6 1678 aa27.24■■□□□ 1.95
Nisch-222ENSMUST00000172142 Taf5lQ91WQ5 589 aa27.24■■□□□ 1.95
Nisch-222ENSMUST00000172142 Usp25P57080 1055 aa27.24■■□□□ 1.95
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gm973E9Q295 1059 aa27.23■■□□□ 1.95
Nisch-222ENSMUST00000172142 Sgsm2Q80U12 1005 aa27.23■■□□□ 1.95
Nisch-222ENSMUST00000172142 Amotl1Q9D4H4 968 aa27.23■■□□□ 1.95
Nisch-222ENSMUST00000172142 Cnnm3Q32NY4 713 aa27.23■■□□□ 1.95
Nisch-222ENSMUST00000172142 Tgfb1i1Q62219 461 aa27.23■■□□□ 1.95
Nisch-222ENSMUST00000172142 Mybbp1aQ7TPV4 1344 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
Nisch-222ENSMUST00000172142 Thsd7aQ69ZU6 1645 aa27.22■■□□□ 1.95
Nisch-222ENSMUST00000172142 Zkscan7E9PVW1 718 aa27.22■■□□□ 1.95
Nisch-222ENSMUST00000172142 Fyb1O35601 819 aa27.22■■□□□ 1.95
Nisch-222ENSMUST00000172142 Nucb2P81117 420 aa27.22■■□□□ 1.95
Nisch-222ENSMUST00000172142 Inpp5bQ8K337 993 aa27.22■■□□□ 1.95
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gys2Q8VCB3 704 aa27.22■■□□□ 1.95
Nisch-222ENSMUST00000172142 Tpm3P21107 285 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
Nisch-222ENSMUST00000172142 Pa2g4P50580 394 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gm45140A0A0N4SUM8 220 aa27.21■■□□□ 1.95
Nisch-222ENSMUST00000172142 Fam228bQ497Q6 232 aa27.21■■□□□ 1.95
Nisch-222ENSMUST00000172142 Wdr33Q8K4P0 1330 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
Nisch-222ENSMUST00000172142 Rbm8a2A0A0N4SUH6 174 aa27.21■■□□□ 1.95
Nisch-222ENSMUST00000172142 MecomP14404 1042 aa27.21■■□□□ 1.95
Nisch-222ENSMUST00000172142 Serpina10Q8R121 448 aa27.21■■□□□ 1.95
Nisch-222ENSMUST00000172142 Rbm8aQ9CWZ3 174 aa27.21■■□□□ 1.95
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ahnak2E9PYB0 1738 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
Nisch-222ENSMUST00000172142 Amotl2Q8K371 772 aa27.2■■□□□ 1.95
Nisch-222ENSMUST00000172142 Spata31d1bE9QA57 1361 aa27.2■■□□□ 1.95
Nisch-222ENSMUST00000172142 Esyt1Q3U7R1 1092 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gpatch11Q3UFS4 262 aa27.2■■□□□ 1.94
Nisch-222ENSMUST00000172142 Arhgef1Q61210 920 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
Nisch-222ENSMUST00000172142 Btbd11Q6GQW0 1109 aa27.2■■□□□ 1.94
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ccdc94Q9D6J3 314 aa27.2■■□□□ 1.94
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ak2Q9WTP6 239 aa27.2■■□□□ 1.94
Nisch-222ENSMUST00000172142 Bach1P97302 739 aa27.19■■□□□ 1.94
Nisch-222ENSMUST00000172142 Add3Q9QYB5 706 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
Nisch-222ENSMUST00000172142 Bcl2l13P59017 434 aa27.19■■□□□ 1.94
Nisch-222ENSMUST00000172142 Pkp1P97350 728 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
Nisch-222ENSMUST00000172142 Cfap157Q0VFX2 523 aa27.19■■□□□ 1.94
Nisch-222ENSMUST00000172142 Zbtb45Q52KG4 520 aa27.19■■□□□ 1.94
Nisch-222ENSMUST00000172142 Psma5Q9Z2U1 241 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
Nisch-222ENSMUST00000172142 Scn7aB1AYL1 1681 aa27.19■■□□□ 1.94
Nisch-222ENSMUST00000172142 Evi5lH3BKQ3 813 aa27.18■■□□□ 1.94
Nisch-222ENSMUST00000172142 Map3k2Q61083 619 aa27.18■■□□□ 1.94
Nisch-222ENSMUST00000172142 Adam1bQ8R534 806 aa27.18■■□□□ 1.94
Nisch-222ENSMUST00000172142 Arfgef2A2A5R2 1792 aa27.18■■□□□ 1.94
Nisch-222ENSMUST00000172142 Abcc4E9Q236 1325 aa27.18■■□□□ 1.94
Nisch-222ENSMUST00000172142 Zbtb3Q91X45 518 aa27.18■■□□□ 1.94
Nisch-222ENSMUST00000172142 Trim30aP15533 496 aa27.17■■□□□ 1.94
Nisch-222ENSMUST00000172142 Polr3gQ6NXY9 223 aa27.17■■□□□ 1.94
Nisch-222ENSMUST00000172142 C3P01027 1663 aa27.17■■□□□ 1.94
Nisch-222ENSMUST00000172142 Klhl34A2AI76 644 aa27.17■■□□□ 1.94
Nisch-222ENSMUST00000172142 Tnnt2P50752 301 aa27.17■■□□□ 1.94
Nisch-222ENSMUST00000172142 Oxsr1Q6P9R2 527 aa27.17■■□□□ 1.94
Nisch-222ENSMUST00000172142 Fbxo2Q80UW2 297 aa27.17■■□□□ 1.94
Nisch-222ENSMUST00000172142 Rbm42Q91V81 474 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
Nisch-222ENSMUST00000172142 Irx4Q9QY61 515 aa27.17■■□□□ 1.94
Nisch-222ENSMUST00000172142 PsapQ61207 557 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
Nisch-222ENSMUST00000172142 Tsr2Q8C8T8 191 aa27.16■■□□□ 1.94
Nisch-222ENSMUST00000172142 Mrpl50Q8VDT9 159 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ndufa8Q9DCJ5 172 aa27.16■■□□□ 1.94
Nisch-222ENSMUST00000172142 Nop14Q8R3N1 860 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
Nisch-222ENSMUST00000172142 Dhx30Q99PU8 1217 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
Nisch-222ENSMUST00000172142 Tns3Q5SSZ5 1440 aa27.16■■□□□ 1.94
Nisch-222ENSMUST00000172142 Adcy9P51830 1353 aa27.16■■□□□ 1.94
Nisch-222ENSMUST00000172142 Eif3aP23116 1344 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
Nisch-222ENSMUST00000172142 Leo1Q5XJE5 667 aa27.15■■□□□ 1.94
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ppp6r1Q7TSI3 856 aa27.15■■□□□ 1.94
Nisch-222ENSMUST00000172142 Fam13bQ8K2H3 851 aa27.15■■□□□ 1.94
Nisch-222ENSMUST00000172142 C5P06684 1680 aa27.15■■□□□ 1.94
Nisch-222ENSMUST00000172142 Kcnb2A6H8H5 907 aa27.15■■□□□ 1.94
Nisch-222ENSMUST00000172142 Brpf3B2KF05 1204 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
Nisch-222ENSMUST00000172142 Polr3dQ91WD1 398 aa27.15■■□□□ 1.94
Nisch-222ENSMUST00000172142 Tbc1d8Q9Z1A9 1134 aa27.15■■□□□ 1.94
Nisch-222ENSMUST00000172142 Eef2kO08796 724 aa27.14■■□□□ 1.94
Nisch-222ENSMUST00000172142 Tpd52l1O54818 204 aa27.14■■□□□ 1.94
Nisch-222ENSMUST00000172142 RdxP26043 583 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
Nisch-222ENSMUST00000172142 Rnf20Q5DTM8 973 aa27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 122.4 ms