RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488990.5

TRDMT1-210, Transcript of tRNA aspartic acid methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRDMT1, Length 1,301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1-210ENST00000488990 LIX1Q8N485 282 aa7.13□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 PQLC3Q8N755 202 aa7.13□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa7.13□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 STPG3Q8N7X2 389 aa7.13□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 OR5M3Q8NGP4 307 aa7.13□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 LINC01560Q8TB33 94 aa7.13□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 ACTL9Q8TC94 416 aa7.13□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 HCAR2Q8TDS4 363 aa7.13□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 HSPH1Q92598 858 aa7.13□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 P3H4Q92791 437 aa7.13□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 SNF8Q96H20 258 aa7.13□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 SHARPINQ9H0F6 387 aa7.13□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa7.13□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 WDCPQ9H6R7 721 aa7.13□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 SLC40A1Q9NP59 571 aa7.13□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa7.13□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 POT1Q9NUX5 634 aa7.13□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 LPAR3Q9UBY5 353 aa7.13□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 Q9UFV3 132 aa7.13□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 ZFP69BQ9UJL9 534 aa7.13□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 DNPEPQ9ULA0 475 aa7.13□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 SHOC2Q9UQ13 582 aa7.13□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa7.13□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 MROH6A6NGR9 719 aa7.12□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 TUBAL3A6NHL2 446 aa7.12□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 OR52A4PA6NMU1 304 aa7.12□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 E7EQ34 232 aa7.12□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 I6L893 689 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 SYT5O00445 386 aa7.12□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 TP73O15350 636 aa7.12□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 CELA2AP08217 269 aa7.12□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 CD63P08962 238 aa7.12□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 PRR35P0CG20 571 aa7.12□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 ITGA2P17301 1181 aa7.12□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 GPR1P46091 355 aa7.12□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 DCDP81605 110 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 VEZF1Q14119 521 aa7.12□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 MORF4L2Q15014 288 aa7.12□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 ACAP2Q15057 778 aa7.12□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 CA9Q16790 459 aa7.12□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 P3H1Q32P28 736 aa7.12□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa7.12□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 C4orf46Q504U0 113 aa7.12□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 RAB6CQ53S08 254 aa7.12□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa7.12□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 SCYL2Q6P3W7 929 aa7.12□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa7.12□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 PCGF5Q86SE9 256 aa7.12□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 RFX6Q8HWS3 928 aa7.12□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 C1orf54Q8WWF1 131 aa7.12□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa7.12□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 ATG4AQ8WYN0 398 aa7.12□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 LRRC45Q96CN5 670 aa7.12□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 DTD2Q96FN9 168 aa7.12□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 FMO2Q99518 471 aa7.12□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 FERMT1Q9BQL6 677 aa7.12□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 HEMGNQ9BXL5 484 aa7.12□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 FUT8Q9BYC5 575 aa7.12□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 TXLNGYQ9BZA5 131 aa7.12□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 RAB6CQ9H0N0 254 aa7.12□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 ATG10Q9H0Y0 220 aa7.12□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 GRHL1Q9NZI5 618 aa7.12□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa7.11□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa7.11□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 HPP00738 406 aa7.11□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 KNG1P01042 644 aa7.11□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 HBQ1P09105 142 aa7.11□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 ENPP1P22413 925 aa7.11□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 RPL21P46778 160 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 CARSP49589 748 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 MANFP55145 182 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 TPI1P60174 286 aa7.11□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 CDK16Q00536 496 aa7.11□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 CALCOCO2Q13137 446 aa7.11□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 NME3Q13232 169 aa7.11□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 SLMAPQ14BN4 828 aa7.11□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 PDK1Q15118 436 aa7.11□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 PPP1R7Q15435 360 aa7.11□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 CNGA3Q16281 694 aa7.11□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 RBBP7Q16576 425 aa7.11□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 ARMC3Q5W041 872 aa7.11□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 Q6ZVL8 140 aa7.11□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa7.11□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa7.11□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 AMER2Q8N7J2 671 aa7.11□□□□□ -1.27
TRDMT1-210ENST00000488990 NUDT10Q8NFP7 164 aa7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.3 ms