RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488990.5

TRDMT1-210, Transcript of tRNA aspartic acid methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRDMT1, Length 1,301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1-210ENST00000488990 RAB33BQ9H082 229 aa7.17□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 RETREG1Q9H6L5 497 aa7.17□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 ZWILCHQ9H900 591 aa7.17□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 FAM114A2Q9NRY5 505 aa7.17□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP7.17□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 MKS1Q9NXB0 559 aa7.17□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa7.17□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 FZD10Q9ULW2 581 aa7.17□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa7.17□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 TENM3Q9P273 2699 aa7.17□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 EML6Q6ZMW3 1958 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 ILVBLA1L0T0 632 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 TSPAN11A1L157 253 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 TMEM150CB9EJG8 249 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 RASGRF2O14827 1237 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 LIASO43766 372 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 SOX30O94993 753 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 GAS8O95995 478 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 HRGP04196 525 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 SLC2A3P11169 496 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 ACP5P13686 325 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 CCR1P32246 355 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 PTGER1P34995 402 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 ACVRL1P37023 503 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 NR2C2P49116 596 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 PTH2RP49190 550 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 SULT1E1P49888 294 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 DR1Q01658 176 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 RAD51Q06609 339 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 XRCC4Q13426 336 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 GPR18Q14330 331 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 NOMO1Q15155 1222 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 OASLQ15646 514 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 ZNF766Q5HY98 468 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 RAET1GQ6H3X3 334 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 C4orf22Q6V702 233 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 CCDC50Q8IVM0 306 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 ZNF683Q8IZ20 524 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 LRRC17Q8N6Y2 441 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 AVL9Q8NBF6 648 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 RAPGEF5Q92565 580 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
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TRDMT1-210ENST00000488990 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 RNF157Q96PX1 679 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 KRT12Q99456 494 aa7.16□□□□□ -1.26
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TRDMT1-210ENST00000488990 AP1M1Q9BXS5 423 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 TSPYL1Q9H0U9 437 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 FAM204AQ9H8W3 233 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 VIPAS39Q9H9C1 493 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 ARFGAP3Q9NP61 516 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 PIGVQ9NUD9 493 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 SOHLH2Q9NX45 425 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP7.16□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 AMACRQ9UHK6 382 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 ZNF180Q9UJW8 692 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 V9GYY5 206 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 ZNF407Q9C0G0 2248 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa7.16□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 MED12Q93074 2177 aa7.15□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa7.15□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 OR5H15A6NDH6 313 aa7.15□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 OR5K4A6NMS3 321 aa7.15□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 ZNF839A8K0R7 811 aa7.15□□□□□ -1.26
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TRDMT1-210ENST00000488990 ZNF749O43361 778 aa7.15□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 GRAP2O75791 330 aa7.15□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 CYP7B1O75881 506 aa7.15□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 IGSF6O95976 241 aa7.15□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 RHOXF2BP0C7M4 288 aa7.15□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
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TRDMT1-210ENST00000488990 PTGS2P35354 604 aa7.15□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 CDH6P55285 790 aa7.15□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 GNA12Q03113 381 aa7.15□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 CAV1Q03135 178 aa7.15□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 DEUP1Q05D60 604 aa7.15□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 ADCY2Q08462 1091 aa7.15□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 CDO1Q16878 200 aa7.15□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 TMTC4Q5T4D3 741 aa7.15□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 MANEALQ5VSG8 457 aa7.15□□□□□ -1.26
TRDMT1-210ENST00000488990 DENND2CQ68D51 928 aa7.15□□□□□ -1.26
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