RNA–Protein interactions for RNA: YPR178W

PRP4, Transcript of Splicing factor, yeastyeast

Gene PRP4, Length 1,398 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP4YPR178W PRO3P32263 286 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
PRP4YPR178W ZUO1P32527 433 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
PRP4YPR178W MDL2P33311 773 aa11.13□□□□□ -0.63
PRP4YPR178W SAS3P34218 831 aa11.13□□□□□ -0.63
PRP4YPR178W JNM1P36224 373 aa11.13□□□□□ -0.63
PRP4YPR178W YNL320WP42840 284 aa11.13□□□□□ -0.63
PRP4YPR178W SMD2Q06217 110 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
PRP4YPR178W CMS1Q07897 291 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
PRP4YPR178W LAM6Q08001 693 aa11.13□□□□□ -0.63
PRP4YPR178W DSE3Q08729 430 aa11.13□□□□□ -0.63
PRP4YPR178W YPL260WQ08977 551 aa11.13□□□□□ -0.63
PRP4YPR178W RIM15P43565 1770 aa11.12□□□□□ -0.63
PRP4YPR178W ERG11P10614 530 aa11.12□□□□□ -0.63
PRP4YPR178W SMC1P32908 1225 aa11.12□□□□□ -0.63
PRP4YPR178W PIP2P52960 996 aa11.12□□□□□ -0.63
PRP4YPR178W TAD1P53065 400 aa11.12□□□□□ -0.63
PRP4YPR178W YGR021WP53212 290 aa11.12□□□□□ -0.63
PRP4YPR178W DSE4P53753 1117 aa11.12□□□□□ -0.63
PRP4YPR178W SEC5P89102 971 aa11.12□□□□□ -0.63
PRP4YPR178W HOT1Q03213 719 aa11.12□□□□□ -0.63
PRP4YPR178W ADY4Q05955 493 aa11.12□□□□□ -0.63
PRP4YPR178W PIG1Q06216 648 aa11.12□□□□□ -0.63
PRP4YPR178W NOB1Q08444 459 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
PRP4YPR178W ISY1P21374 235 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
PRP4YPR178W MRPS28P21771 286 aa11.11□□□□□ -0.63
PRP4YPR178W SPT5P27692 1063 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
PRP4YPR178W XRS2P33301 854 aa11.11□□□□□ -0.63
PRP4YPR178W NIP100P33420 868 aa11.11□□□□□ -0.63
PRP4YPR178W HEK2P38199 381 aaKnown RBP RIP-Chip data11.11□□□□□ -0.63not detected
PRP4YPR178W MMM1P41800 426 aa11.11□□□□□ -0.63
PRP4YPR178W YFL034WP43564 1073 aa11.11□□□□□ -0.63
PRP4YPR178W YFH7P43591 353 aa11.11□□□□□ -0.63
PRP4YPR178W TOS3P43637 560 aa11.11□□□□□ -0.63
PRP4YPR178W YJR142WP47173 342 aa11.11□□□□□ -0.63
PRP4YPR178W SYF1Q04048 859 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
PRP4YPR178W TSR1Q07381 788 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
PRP4YPR178W ILV6P25605 309 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
PRP4YPR178W RPL8BP29453 256 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
PRP4YPR178W SMY1P32364 656 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
PRP4YPR178W ATG32P40458 529 aa11.1□□□□□ -0.63
PRP4YPR178W SAP185P40856 1058 aa11.1□□□□□ -0.63
PRP4YPR178W GTR1Q00582 310 aa11.1□□□□□ -0.63
PRP4YPR178W VPS30Q02948 557 aa11.1□□□□□ -0.63
PRP4YPR178W CSM3Q04659 317 aa11.1□□□□□ -0.63
PRP4YPR178W YLR177WQ06251 628 aa11.1□□□□□ -0.63
PRP4YPR178W PSF3Q12146 194 aa11.1□□□□□ -0.63
PRP4YPR178W NCA2Q12374 616 aa11.1□□□□□ -0.63
PRP4YPR178W NIP1P32497 812 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
PRP4YPR178W MCD4P36051 919 aa11.09□□□□□ -0.63
PRP4YPR178W RCK2P38623 610 aa11.09□□□□□ -0.63
PRP4YPR178W YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data11.09□□□□□ -0.63not detected
PRP4YPR178W ASE1P50275 885 aa11.09□□□□□ -0.63
PRP4YPR178W BNI5P53890 448 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
PRP4YPR178W CBK1P53894 756 aa11.09□□□□□ -0.63
PRP4YPR178W SUB1P54000 292 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
PRP4YPR178W TFB2Q02939 513 aa11.09□□□□□ -0.63
PRP4YPR178W IRC4Q03036 179 aa11.09□□□□□ -0.63
PRP4YPR178W DIG1Q03063 452 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
PRP4YPR178W VPS16Q03308 798 aa11.09□□□□□ -0.63
PRP4YPR178W USA1Q03714 838 aa11.09□□□□□ -0.63
PRP4YPR178W MAG2Q06436 670 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
PRP4YPR178W SEY1Q99287 776 aa11.09□□□□□ -0.63
PRP4YPR178W ADH4P10127 382 aa11.08□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W PRP9P19736 530 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W LCB1P25045 558 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W NAM7P30771 971 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W YME1P32795 747 aa11.08□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W SEC26P41810 973 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W URB2P47108 1174 aa11.08□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W RPT4P53549 437 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W MDM1Q01846 1127 aa11.08□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W DPL1Q05567 589 aa11.08□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W FRA1Q07825 749 aa11.08□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W HXT8P40886 569 aa11.07□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W EMP47P43555 445 aa11.07□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W TMA22P47089 198 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W YPL109CQ02981 657 aa11.07□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W TAF9Q05027 157 aa11.07□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W MDM38Q08179 573 aa11.07□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W PRP4P20053 465 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W BUD14P27637 709 aa11.06□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W CDC11P32458 415 aa11.06□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W YME2P32843 850 aa11.06□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W SMX2P40204 77 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W SDS3P40505 327 aa11.06□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W CIT3P43635 486 aa11.06□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W SPO19Q03029 223 aa11.06□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W AIM41Q12032 185 aa11.06□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W SPO21Q12411 609 aa11.06□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W ARG82P07250 355 aa11.05□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W YEL076C-AP0CX16 216 aa11.05□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W YLR464WP0CX17 216 aa11.05□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W SNF3P10870 884 aa11.05□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W KTR2P33550 425 aa11.05□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W SAK1P38990 1142 aa11.05□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W UBP5P39944 805 aa11.05□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W YEL076CP39971 216 aa11.05□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W TDA10P42938 290 aa11.05□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W MDR1P53258 950 aa11.05□□□□□ -0.64
PRP4YPR178W CPR6P53691 371 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
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