RNA–Protein interactions for RNA: YPR175W

DPB2, Transcript of Second largest subunit of DNA polymerase II (DNA polymerase epsilon), yeastyeast

Gene DPB2, Length 2,070 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DPB2YPR175W GCV1P48015 400 aa7.32□□□□□ -1.24
DPB2YPR175W REI1P38344 393 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
DPB2YPR175W RAD18P10862 487 aa7.31□□□□□ -1.24
DPB2YPR175W PEX14P53112 341 aa7.31□□□□□ -1.24
DPB2YPR175W ATP4P05626 244 aa7.3□□□□□ -1.24
DPB2YPR175W ERS1P17261 260 aa7.3□□□□□ -1.24
DPB2YPR175W SFL1P20134 766 aa7.3□□□□□ -1.24
DPB2YPR175W CDC12P32468 407 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
DPB2YPR175W TFC4P33339 1025 aa7.3□□□□□ -1.24
DPB2YPR175W YAR028WP39548 234 aa7.3□□□□□ -1.24
DPB2YPR175W YJR096WP47137 282 aa7.3□□□□□ -1.24
DPB2YPR175W YGR045CP53229 120 aa7.29□□□□□ -1.24
DPB2YPR175W HRQ1Q05549 1077 aa7.29□□□□□ -1.24
DPB2YPR175W SPP382Q06411 708 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
DPB2YPR175W FPS1P23900 669 aa7.29□□□□□ -1.24
DPB2YPR175W YGR283CP53336 341 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
DPB2YPR175W LCD1Q04377 747 aa7.29□□□□□ -1.24
DPB2YPR175W QNS1P38795 714 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
DPB2YPR175W NPP2P39997 493 aa7.28□□□□□ -1.24
DPB2YPR175W PEA2P40091 420 aa7.28□□□□□ -1.24
DPB2YPR175W DAS1P47005 663 aa7.28□□□□□ -1.24
DPB2YPR175W LYS5P50113 272 aa7.28□□□□□ -1.24
DPB2YPR175W SST2P11972 698 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
DPB2YPR175W KIP1P28742 1111 aa7.28□□□□□ -1.24
DPB2YPR175W SLA2P33338 968 aa7.28□□□□□ -1.24
DPB2YPR175W GLY1P37303 387 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
DPB2YPR175W PCM1P38628 557 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
DPB2YPR175W GPB2P39717 880 aa7.28□□□□□ -1.24
DPB2YPR175W GIP2P40036 548 aa7.28□□□□□ -1.24
DPB2YPR175W TY1A-MR1Q04215 440 aa7.28□□□□□ -1.24
DPB2YPR175W YDR461C-AQ2V2P7 80 aa7.28□□□□□ -1.24
DPB2YPR175W NAR1P23503 491 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
DPB2YPR175W DAL3P32459 195 aa7.27□□□□□ -1.25
DPB2YPR175W MCD4P36051 919 aa7.27□□□□□ -1.25
DPB2YPR175W ROG3P43602 733 aa7.27□□□□□ -1.25
DPB2YPR175W ADE12P80210 433 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
DPB2YPR175W SYT1Q06836 1226 aa7.27□□□□□ -1.25
DPB2YPR175W RPA135P22138 1203 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
DPB2YPR175W RET1P22276 1149 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
DPB2YPR175W GSY1P23337 708 aa7.26□□□□□ -1.25
DPB2YPR175W MIH1P23748 554 aa7.26□□□□□ -1.25
DPB2YPR175W YRO2P38079 344 aa7.26□□□□□ -1.25
DPB2YPR175W TED1P40533 473 aa7.26□□□□□ -1.25
DPB2YPR175W LEM3P42838 414 aa7.26□□□□□ -1.25
DPB2YPR175W CAF16P43569 289 aa7.26□□□□□ -1.25
DPB2YPR175W YGR021WP53212 290 aa7.26□□□□□ -1.25
DPB2YPR175W YMR265CQ03508 461 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
DPB2YPR175W ATG16Q03818 150 aa7.26□□□□□ -1.25
DPB2YPR175W HFD1Q04458 532 aa7.26□□□□□ -1.25
DPB2YPR175W RSA3Q05942 220 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
DPB2YPR175W RSC3Q06639 885 aa7.26□□□□□ -1.25
DPB2YPR175W PPH3P32345 308 aa7.26□□□□□ -1.25
DPB2YPR175W NAB3P38996 802 aaKnown RBP RIP-Chip data7.26□□□□□ -1.25not detected
DPB2YPR175W BOI2P39969 1040 aa7.25□□□□□ -1.25
DPB2YPR175W SPO21Q12411 609 aa7.25□□□□□ -1.25
DPB2YPR175W YEL1P34225 687 aa7.24□□□□□ -1.25
DPB2YPR175W TSL1P38427 1098 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
DPB2YPR175W RRP8P38961 392 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
DPB2YPR175W OAF1P39720 1047 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
DPB2YPR175W VPS53P47061 822 aa7.24□□□□□ -1.25
DPB2YPR175W AIM14P53109 570 aa7.24□□□□□ -1.25
DPB2YPR175W GIS4Q04233 774 aa7.24□□□□□ -1.25
DPB2YPR175W YDR338CQ05497 695 aa7.24□□□□□ -1.25
DPB2YPR175W YPL260WQ08977 551 aa7.24□□□□□ -1.25
DPB2YPR175W ENV7Q12003 364 aa7.24□□□□□ -1.25
DPB2YPR175W MDJ1P35191 511 aa7.24□□□□□ -1.25
DPB2YPR175W NMD3P38861 518 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
DPB2YPR175W KIP3P53086 805 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
DPB2YPR175W ELA1P53861 379 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
DPB2YPR175W ATP25Q03153 612 aa7.24□□□□□ -1.25
DPB2YPR175W CEF1Q03654 590 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
DPB2YPR175W TRE2Q08693 809 aa7.24□□□□□ -1.25
DPB2YPR175W GAL1P04385 528 aa7.23□□□□□ -1.25
DPB2YPR175W NFS1P25374 497 aa7.23□□□□□ -1.25
DPB2YPR175W PRP19P32523 503 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
DPB2YPR175W HSP78P33416 811 aa7.23□□□□□ -1.25
DPB2YPR175W NIT2P47016 307 aa7.23□□□□□ -1.25
DPB2YPR175W MTC3P53077 123 aa7.23□□□□□ -1.25
DPB2YPR175W MET14Q02196 202 aa7.23□□□□□ -1.25
DPB2YPR175W ATG33Q06485 197 aa7.23□□□□□ -1.25
DPB2YPR175W DPS1P04802 557 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
DPB2YPR175W YBR238CP38330 731 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
DPB2YPR175W CKB2P38930 258 aa7.23□□□□□ -1.25
DPB2YPR175W GPP2P40106 250 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
DPB2YPR175W SCW11P53189 542 aa7.23□□□□□ -1.25
DPB2YPR175W LCB5Q06147 687 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
DPB2YPR175W ELG1Q12050 791 aa7.23□□□□□ -1.25
DPB2YPR175W NYV1Q12255 253 aa7.23□□□□□ -1.25
DPB2YPR175W ADE8P04161 214 aa7.22□□□□□ -1.25
DPB2YPR175W HMG1P12683 1054 aa7.22□□□□□ -1.25
DPB2YPR175W REC104P33323 182 aa7.22□□□□□ -1.25
DPB2YPR175W HXT16P47185 567 aa7.22□□□□□ -1.25
DPB2YPR175W PIP2P52960 996 aa7.22□□□□□ -1.25
DPB2YPR175W GIN4Q12263 1142 aa7.22□□□□□ -1.25
DPB2YPR175W MET7Q08645 548 aa7.21□□□□□ -1.25
DPB2YPR175W LAP2Q10740 671 aa7.21□□□□□ -1.25
DPB2YPR175W TY4B-PA0A0B7P3V8 1104 aa7.21□□□□□ -1.26
DPB2YPR175W YEF3P16521 1044 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
DPB2YPR175W APA1P16550 321 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
DPB2YPR175W NKP1Q12493 238 aa7.21□□□□□ -1.26
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