RNA–Protein interactions for RNA: YPR116W

RRG8, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene RRG8, Length 834 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRG8	YPR116W	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RRG8	YPR116W	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RRG8	YPR116W	MXR1	P40029	184 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RRG8	YPR116W	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RRG8	YPR116W	UGA2	P38067	497 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRG8	YPR116W	PLB1	P39105	664 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRG8	YPR116W	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RRG8	YPR116W	BI4	P03879	638 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRG8	YPR116W	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RRG8	YPR116W	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RRG8	YPR116W	PEP7	P32609	515 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRG8	YPR116W	RER2	P35196	286 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRG8	YPR116W	MSS4	P38994	779 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRG8	YPR116W	RRT14	P40470	206 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRG8	YPR116W	MND2	P40577	368 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRG8	YPR116W	KIN4	Q01919	800 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRG8	YPR116W	ACM1	Q08981	209 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRG8	YPR116W	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RRG8	YPR116W	RAD53	P22216	821 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRG8	YPR116W	MCM2	P29469	868 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRG8	YPR116W	HFM1	P51979	1187 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRG8	YPR116W	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RRG8	YPR116W	TPO1	Q07824	586 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRG8	YPR116W	GNT1	Q12096	491 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRG8	YPR116W	SLA2	P33338	968 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRG8	YPR116W	GEM1	P39722	662 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRG8	YPR116W	MET12	P46151	657 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRG8	YPR116W	ADY3	Q07732	790 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRG8	YPR116W	HIS5	P07172	385 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRG8	YPR116W	MCM7	P38132	845 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRG8	YPR116W	PNT1	P38969	423 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRG8	YPR116W	CHA4	P43634	648 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRG8	YPR116W	MTC3	P53077	123 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRG8	YPR116W	POA1	P38218	177 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRG8	YPR116W	EXG2	P52911	562 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRG8	YPR116W	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RRG8	YPR116W	RAD27	P26793	382 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRG8	YPR116W	MGE1	P38523	228 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRG8	YPR116W	ZRG8	P40021	1076 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRG8	YPR116W	IOC3	P43596	787 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRG8	YPR116W	SPR28	Q04921	423 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRG8	YPR116W	XYL2	Q07993	356 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRG8	YPR116W	RTT10	Q08924	1013 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RRG8	YPR116W	SLD2	P34252	453 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRG8	YPR116W	YJR107W	P47145	328 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RRG8	YPR116W	ATE1	P16639	503 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RRG8	YPR116W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RRG8	YPR116W	ENA1	P13587	1091 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRG8	YPR116W	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RRG8	YPR116W	FYV10	P40492	516 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRG8	YPR116W	POL32	P47110	350 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRG8	YPR116W	ENA2	Q01896	1091 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRG8	YPR116W	YML122C	Q03207	126 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRG8	YPR116W	PPM2	Q08282	695 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRG8	YPR116W	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RRG8	YPR116W	ENA5	Q12691	1091 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRG8	YPR116W	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RRG8	YPR116W	OAR1	P35731	278 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRG8	YPR116W	YAP1801	P38856	637 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRG8	YPR116W	AIM39	Q08223	395 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRG8	YPR116W	KCS1	Q12494	1050 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRG8	YPR116W	MOH1	P38191	138 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRG8	YPR116W	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RRG8	YPR116W	OSW2	Q12202	724 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRG8	YPR116W	KOG1	P38873	1557 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRG8	YPR116W	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RRG8	YPR116W	LYP1	P32487	611 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRG8	YPR116W	DUT1	P33317	147 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRG8	YPR116W	YKL151C	P36059	337 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRG8	YPR116W	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RRG8	YPR116W	CDA1	Q06702	301 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRG8	YPR116W	YPL066W	Q12194	479 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRG8	YPR116W	YGR012W	P53206	393 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RRG8	YPR116W	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.83	□□□□□ -1.64	not detected
RRG8	YPR116W	LAS17	Q12446	633 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RRG8	YPR116W	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RRG8	YPR116W	EEB1	Q02891	456 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RRG8	YPR116W	YLL058W	Q12198	575 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RRG8	YPR116W	SPE1	P08432	466 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RRG8	YPR116W	INO1	P11986	533 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RRG8	YPR116W	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RRG8	YPR116W	HRQ1	Q05549	1077 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RRG8	YPR116W	MDM38	Q08179	573 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RRG8	YPR116W	ENB1	Q08299	606 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RRG8	YPR116W	RKM4	Q12504	494 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RRG8	YPR116W	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RRG8	YPR116W	NCS6	P53088	359 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RRG8	YPR116W	TYW3	P53177	273 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RRG8	YPR116W	NPC2	Q12408	173 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RRG8	YPR116W	SRP101	P32916	621 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RRG8	YPR116W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RRG8	YPR116W	YGL176C	P46945	554 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RRG8	YPR116W	BUL1	P48524	976 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RRG8	YPR116W	SRT1	Q03175	343 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RRG8	YPR116W	RMD1	Q03441	430 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RRG8	YPR116W	HSF1	P10961	833 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RRG8	YPR116W	KAR4	P25583	335 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RRG8	YPR116W	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RRG8	YPR116W	UBA2	P52488	636 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RRG8	YPR116W	CDC34	P14682	295 aa		4.77	□□□□□ -1.65

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