RNA–Protein interactions for RNA: YOR197W

MCA1, Transcript of Ca2+-dependent cysteine protease, yeast

Gene MCA1, Length 1,299 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MCA1	YOR197W	ATG13	Q06628	738 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MCA1	YOR197W	ACM1	Q08981	209 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MCA1	YOR197W	CDC6	P09119	513 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MCA1	YOR197W	CTS1	P29029	562 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MCA1	YOR197W	MNR2	P35724	969 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MCA1	YOR197W	HFM1	P51979	1187 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MCA1	YOR197W	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MCA1	YOR197W	XYL2	Q07993	356 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MCA1	YOR197W	YLR358C	O13565	187 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MCA1	YOR197W	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MCA1	YOR197W	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MCA1	YOR197W	GCV2	P49095	1034 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MCA1	YOR197W	SIZ1	Q04195	904 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MCA1	YOR197W	YKL107W	P34251	309 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MCA1	YOR197W	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MCA1	YOR197W	GEM1	P39722	662 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MCA1	YOR197W	MTC3	P53077	123 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MCA1	YOR197W	YGR053C	P53234	283 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MCA1	YOR197W	GDE1	Q02979	1223 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MCA1	YOR197W	RKM4	Q12504	494 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MCA1	YOR197W	CDC20	P26309	610 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MCA1	YOR197W	TAT2	P38967	592 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MCA1	YOR197W	MSC2	Q03455	724 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MCA1	YOR197W	GPB1	Q08886	897 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MCA1	YOR197W	YKL151C	P36059	337 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MCA1	YOR197W	YAP6	Q03935	383 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MCA1	YOR197W	SPO20	Q04359	397 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MCA1	YOR197W	HRQ1	Q05549	1077 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MCA1	YOR197W	TMA10	Q06177	86 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MCA1	YOR197W	LST4	P34239	828 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MCA1	YOR197W	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MCA1	YOR197W	RRT14	P40470	206 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MCA1	YOR197W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MCA1	YOR197W	EMC1	P25574	760 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MCA1	YOR197W	DOM34	P33309	386 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MCA1	YOR197W	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
MCA1	YOR197W	VPS62	P53285	467 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MCA1	YOR197W	VPS16	Q03308	798 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MCA1	YOR197W	RXT3	Q07458	294 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MCA1	YOR197W	YKL069W	P36088	180 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MCA1	YOR197W	MBP1	P39678	833 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MCA1	YOR197W	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MCA1	YOR197W	HMI1	Q12039	706 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MCA1	YOR197W	PIN2	Q12057	282 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MCA1	YOR197W	AIM44	Q99299	758 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MCA1	YOR197W	NPP2	P39997	493 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MCA1	YOR197W	MND2	P40577	368 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MCA1	YOR197W	MAD1	P40957	749 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MCA1	YOR197W	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MCA1	YOR197W	YLR224W	Q05947	369 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MCA1	YOR197W	MDM38	Q08179	573 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MCA1	YOR197W	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MCA1	YOR197W	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MCA1	YOR197W	PRI2	P20457	528 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MCA1	YOR197W	ZRG8	P40021	1076 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MCA1	YOR197W	CWC24	P53769	259 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MCA1	YOR197W	TPO1	Q07824	586 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MCA1	YOR197W	INO80	P53115	1489 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MCA1	YOR197W	ENA1	P13587	1091 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MCA1	YOR197W	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
MCA1	YOR197W	GIC1	P38785	314 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MCA1	YOR197W	YAP1801	P38856	637 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MCA1	YOR197W	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MCA1	YOR197W	ENA2	Q01896	1091 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MCA1	YOR197W	OSW2	Q12202	724 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MCA1	YOR197W	ENA5	Q12691	1091 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MCA1	YOR197W	CLN2	P20438	545 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MCA1	YOR197W	SRP101	P32916	621 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MCA1	YOR197W	SRT1	Q03175	343 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MCA1	YOR197W	ADY3	Q07732	790 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MCA1	YOR197W	AGP1	P25376	633 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MCA1	YOR197W	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MCA1	YOR197W	VBA5	P36172	582 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MCA1	YOR197W	POA1	P38218	177 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MCA1	YOR197W	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MCA1	YOR197W	ORC1	P54784	914 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MCA1	YOR197W	CDA1	Q06702	301 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MCA1	YOR197W	OPI10	Q08202	246 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MCA1	YOR197W	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MCA1	YOR197W	PLB1	P39105	664 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MCA1	YOR197W	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MCA1	YOR197W	PHO23	P50947	330 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MCA1	YOR197W	SFB2	P53953	876 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MCA1	YOR197W	SVF1	Q05515	481 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MCA1	YOR197W	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MCA1	YOR197W	YLL058W	Q12198	575 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MCA1	YOR197W	STE11	P23561	717 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MCA1	YOR197W	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MCA1	YOR197W	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MCA1	YOR197W	MET12	P46151	657 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MCA1	YOR197W	YGR012W	P53206	393 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MCA1	YOR197W	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MCA1	YOR197W	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MCA1	YOR197W	SGS1	P35187	1447 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MCA1	YOR197W	HCM1	P25364	564 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MCA1	YOR197W	FUN30	P31380	1131 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MCA1	YOR197W	VAC8	P39968	578 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MCA1	YOR197W	HIS5	P07172	385 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MCA1	YOR197W	NTO1	Q12311	748 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MCA1	YOR197W	SPE1	P08432	466 aa		4.81	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 40.7 ms