RNA–Protein interactions for RNA: YOR117W

RPT5, Transcript of ATPase of the 19S regulatory particle of the 26S proteasome, yeast

Gene RPT5, Length 1,305 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPT5	YOR117W	FUS2	Q05670	677 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RPT5	YOR117W	CLN3	P13365	580 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RPT5	YOR117W	CDC15	P27636	974 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RPT5	YOR117W	SUV3	P32580	737 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RPT5	YOR117W	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
RPT5	YOR117W	NPR3	P38742	1146 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RPT5	YOR117W	PGA2	P53903	129 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RPT5	YOR117W	SVF1	Q05515	481 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RPT5	YOR117W	CRD1	Q07560	283 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RPT5	YOR117W	PSR2	Q07949	397 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RPT5	YOR117W	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RPT5	YOR117W	YLR464W	P0CX17	216 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RPT5	YOR117W	YEL076C	P39971	216 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RPT5	YOR117W	NUP82	P40368	713 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RPT5	YOR117W	BRE2	P43132	505 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RPT5	YOR117W	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
RPT5	YOR117W	DIP5	P53388	608 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RPT5	YOR117W	YMR321C	Q04898	105 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RPT5	YOR117W	ICL2	Q12031	575 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RPT5	YOR117W	TRM11	Q12463	433 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RPT5	YOR117W	SRD1	P09007	221 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RPT5	YOR117W	SUP45	P12385	437 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
RPT5	YOR117W	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
RPT5	YOR117W	YUR1	P26725	428 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RPT5	YOR117W	TIM23	P32897	222 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RPT5	YOR117W	TVP38	P36164	337 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RPT5	YOR117W	SIP3	P38717	1229 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RPT5	YOR117W	RRM3	P38766	723 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RPT5	YOR117W	PSF2	P40359	213 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RPT5	YOR117W	MIP1	P15801	1254 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RPT5	YOR117W	FYV10	P40492	516 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RPT5	YOR117W	FIS1	P40515	155 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RPT5	YOR117W	TAF13	P11747	167 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RPT5	YOR117W	CLC1	P17891	233 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RPT5	YOR117W	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
RPT5	YOR117W	RAM2	P29703	316 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RPT5	YOR117W	PIH1	P38768	344 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RPT5	YOR117W	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RPT5	YOR117W	POX1	P13711	748 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RPT5	YOR117W	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
RPT5	YOR117W	GSY2	P27472	705 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RPT5	YOR117W	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
RPT5	YOR117W	RKM3	P38222	552 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RPT5	YOR117W	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
RPT5	YOR117W	GUP1	P53154	560 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RPT5	YOR117W	RSC1	P53236	928 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RPT5	YOR117W	MDR1	P53258	950 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RPT5	YOR117W	SEC5	P89102	971 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RPT5	YOR117W	YLL058W	Q12198	575 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RPT5	YOR117W	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
RPT5	YOR117W	YEL025C	P39991	1188 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RPT5	YOR117W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
RPT5	YOR117W	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
RPT5	YOR117W	YPR148C	Q06523	435 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RPT5	YOR117W	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
RPT5	YOR117W	ATE1	P16639	503 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RPT5	YOR117W	PPS1	P38148	807 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RPT5	YOR117W	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
RPT5	YOR117W	SCS3	P53012	380 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RPT5	YOR117W	LCD1	Q04377	747 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RPT5	YOR117W	TLG2	Q08144	397 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RPT5	YOR117W	SMC5	Q08204	1093 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RPT5	YOR117W	PDC1	P06169	563 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
RPT5	YOR117W	ATG19	P35193	415 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RPT5	YOR117W	GPT2	P36148	743 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RPT5	YOR117W	YJR107W	P47145	328 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RPT5	YOR117W	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
RPT5	YOR117W	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
RPT5	YOR117W	GPI13	Q07830	1017 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RPT5	YOR117W	AFT2	Q08957	416 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RPT5	YOR117W	SUT2	Q12286	268 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RPT5	YOR117W	DBP1	P24784	617 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
RPT5	YOR117W	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
RPT5	YOR117W	BCD1	P38772	366 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RPT5	YOR117W	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
RPT5	YOR117W	ULP1	Q02724	621 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RPT5	YOR117W	YOR131C	Q12486	218 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RPT5	YOR117W	MAS2	P11914	482 aa		10	□□□□□ -0.81
RPT5	YOR117W	PAH1	P32567	862 aa		10	□□□□□ -0.81
RPT5	YOR117W	BCS1	P32839	456 aa		10	□□□□□ -0.81
RPT5	YOR117W	MRPL10	P36520	322 aa		10	□□□□□ -0.81
RPT5	YOR117W	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
RPT5	YOR117W	FLR1	P38124	548 aa		10	□□□□□ -0.81
RPT5	YOR117W	YFL034W	P43564	1073 aa		10	□□□□□ -0.81
RPT5	YOR117W	YGR237C	P50089	785 aa		10	□□□□□ -0.81
RPT5	YOR117W	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
RPT5	YOR117W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
RPT5	YOR117W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
RPT5	YOR117W	PCK1	P10963	549 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RPT5	YOR117W	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
RPT5	YOR117W	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
RPT5	YOR117W	AIM21	P40563	679 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RPT5	YOR117W	SKP2	P42843	763 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RPT5	YOR117W	ROD1	Q02805	837 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RPT5	YOR117W	YML020W	Q03722	664 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RPT5	YOR117W	CUR1	Q06469	252 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RPT5	YOR117W	BMT6	Q12291	365 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RPT5	YOR117W	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
RPT5	YOR117W	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
RPT5	YOR117W	SNA3	P14359	133 aa		9.98	□□□□□ -0.81

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