RNA–Protein interactions for RNA: YOL006C

TOP1, Transcript of Topoisomerase I, yeast

Gene TOP1, Length 2,310 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TOP1	YOL006C	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
TOP1	YOL006C	CDC45	Q08032	650 aa		3.79	□□□□□ -1.8
TOP1	YOL006C	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
TOP1	YOL006C	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
TOP1	YOL006C	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
TOP1	YOL006C	SSM4	P40318	1319 aa		3.79	□□□□□ -1.8
TOP1	YOL006C	INO1	P11986	533 aa		3.79	□□□□□ -1.8
TOP1	YOL006C	SFL1	P20134	766 aa		3.79	□□□□□ -1.8
TOP1	YOL006C	MSN1	P22148	382 aa		3.79	□□□□□ -1.8
TOP1	YOL006C	RAD53	P22216	821 aa		3.79	□□□□□ -1.8
TOP1	YOL006C	DAL3	P32459	195 aa		3.79	□□□□□ -1.8
TOP1	YOL006C	DPH2	P32461	534 aa		3.79	□□□□□ -1.8
TOP1	YOL006C	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
TOP1	YOL006C	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
TOP1	YOL006C	YEL1	P34225	687 aa		3.79	□□□□□ -1.8
TOP1	YOL006C	HXT13	P39924	564 aa		3.79	□□□□□ -1.8
TOP1	YOL006C	JEM1	P40358	645 aa		3.79	□□□□□ -1.8
TOP1	YOL006C	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
TOP1	YOL006C	RET2	P43621	546 aa		3.79	□□□□□ -1.8
TOP1	YOL006C	ISM1	P48526	1002 aa		3.79	□□□□□ -1.8
TOP1	YOL006C	NUT1	P53114	1132 aa		3.79	□□□□□ -1.8
TOP1	YOL006C	HXT17	P53631	564 aa		3.79	□□□□□ -1.8
TOP1	YOL006C	HXT15	P54854	567 aa		3.79	□□□□□ -1.8
TOP1	YOL006C	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
TOP1	YOL006C	MPC54	Q08550	464 aa		3.79	□□□□□ -1.8
TOP1	YOL006C	ISU2	Q12056	156 aa		3.79	□□□□□ -1.8
TOP1	YOL006C	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
TOP1	YOL006C	DPH6	Q12429	685 aa		3.79	□□□□□ -1.8
TOP1	YOL006C	ENT1	Q12518	454 aa		3.79	□□□□□ -1.8
TOP1	YOL006C	CDC9	P04819	755 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TOP1	YOL006C	BIT2	P38346	545 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TOP1	YOL006C	DYS1	P38791	387 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TOP1	YOL006C	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
TOP1	YOL006C	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
TOP1	YOL006C	TAF11	Q04226	346 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TOP1	YOL006C	YKU80	Q04437	629 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TOP1	YOL006C	TDA9	Q04545	1251 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TOP1	YOL006C	BRE4	Q07660	1125 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TOP1	YOL006C	SMC6	Q12749	1114 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TOP1	YOL006C	MCM1	P11746	286 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TOP1	YOL006C	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
TOP1	YOL006C	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
TOP1	YOL006C	FUN30	P31380	1131 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TOP1	YOL006C	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
TOP1	YOL006C	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.78	□□□□□ -1.8	not detected
TOP1	YOL006C	RRF1	P38771	230 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TOP1	YOL006C	MBP1	P39678	833 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TOP1	YOL006C	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
TOP1	YOL006C	PAC1	P39946	494 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
TOP1	YOL006C	YIL166C	P40445	542 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TOP1	YOL006C	SAE2	P46946	345 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TOP1	YOL006C	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
TOP1	YOL006C	MRPL19	P53875	158 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TOP1	YOL006C	SIW14	P53965	281 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TOP1	YOL006C	CIA1	Q05583	330 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TOP1	YOL006C	BLS1	Q06071	122 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TOP1	YOL006C	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
TOP1	YOL006C	AAC3	P18238	307 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TOP1	YOL006C	PAH1	P32567	862 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TOP1	YOL006C	DOM34	P33309	386 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TOP1	YOL006C	YBR284W	P38150	797 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TOP1	YOL006C	PAN5	P38787	379 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TOP1	YOL006C	PEX28	P38848	579 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TOP1	YOL006C	EMP65	P40085	556 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TOP1	YOL006C	HXT10	P43581	546 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TOP1	YOL006C	CTR9	P89105	1077 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TOP1	YOL006C	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
TOP1	YOL006C	MSH6	Q03834	1242 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TOP1	YOL006C	ARA2	Q04212	335 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TOP1	YOL006C	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
TOP1	YOL006C	GUD1	Q07729	489 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TOP1	YOL006C	TAH18	Q12181	623 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TOP1	YOL006C	TY1A-DR4	O74302	440 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TOP1	YOL006C	COB	P00163	385 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TOP1	YOL006C	TY1A-H	P0C2I4	478 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
TOP1	YOL006C	TY1A-A	P0CX57	440 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TOP1	YOL006C	TY1A-PR1	P0CX58	440 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TOP1	YOL006C	TY1A-OR	P0CX59	440 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TOP1	YOL006C	TY1A-PR2	P0CX60	440 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TOP1	YOL006C	TY1A-DR5	P0CX65	440 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TOP1	YOL006C	TY1A-ER2	P0CX66	440 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TOP1	YOL006C	TY1A-GR3	P0CX67	440 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TOP1	YOL006C	TY1A-LR1	P0CX68	440 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TOP1	YOL006C	TY1A-MR2	P0CX69	440 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TOP1	YOL006C	YER152C	P10356	443 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TOP1	YOL006C	RED1	P14291	827 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TOP1	YOL006C	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
TOP1	YOL006C	SEG2	P34250	1132 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TOP1	YOL006C	YKL107W	P34251	309 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TOP1	YOL006C	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
TOP1	YOL006C	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
TOP1	YOL006C	SIT1	P39980	628 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TOP1	YOL006C	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
TOP1	YOL006C	RAD26	P40352	1085 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TOP1	YOL006C	IRC6	P43615	237 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TOP1	YOL006C	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
TOP1	YOL006C	TY1A-JR2	P47099	440 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TOP1	YOL006C	YGL140C	P53120	1219 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TOP1	YOL006C	ELP4	Q02884	456 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
TOP1	YOL006C	TY1A-DR1	Q03856	440 aa		3.77	□□□□□ -1.81

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