RNA–Protein interactions for RNA: YNL057W

YNL057W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL057W, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL057W	YNL057W	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	5.14	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	MAK31	P23059	88 aa		5.13	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	SEC20	P28791	383 aa		5.13	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	TVP38	P36164	337 aa		5.13	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	CCC2	P38995	1004 aa		5.13	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	PTC2	P39966	464 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	BUD16	P39988	312 aa		5.13	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	GCV2	P49095	1034 aa		5.13	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	MUK1	Q02866	612 aa		5.13	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	YML082W	Q04533	649 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	OXR1	Q08952	273 aa		5.13	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	CCH1	P50077	2039 aa		5.13	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	CLB5	P30283	435 aa		5.12	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	YKL097C	P34245	136 aa		5.12	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	YEL025C	P39991	1188 aa		5.12	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	TPM2	P40414	161 aa		5.12	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	YFL052W	P43551	465 aa		5.12	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	NMA111	P53920	997 aa		5.12	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	STB3	Q12427	513 aa		5.12	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	RIF1	P29539	1916 aa		5.11	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	PEX1	P24004	1043 aa		5.11	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	PAN5	P38787	379 aa		5.11	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	MOB1	P40484	314 aa		5.11	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	YIR016W	P40572	265 aa		5.11	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	DSE3	Q08729	430 aa		5.11	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	ARP6	Q12509	438 aa		5.11	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	IRA2	P19158	3079 aa		5.11	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	KEX1	P09620	729 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	TIF1	P10081	395 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	RER2	P35196	286 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	SUL1	P38359	859 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	ARP1	P38696	384 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	PEX28	P38848	579 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	MAF1	P41910	395 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	YJL045W	P47052	634 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	ACF4	P47129	309 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	ASE1	P50275	885 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	YGL081W	P53156	320 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	MDR1	P53258	950 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	TFC6	Q06339	672 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	CRD1	Q07560	283 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	RRD2	Q12461	358 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	APE1	P14904	514 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	SEG2	P34250	1132 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	GCS1	P35197	352 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.09	□□□□□ -1.59	not detected
YNL057W	YNL057W	UBP11	P36026	717 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	ISW1	P38144	1129 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	ESL1	P40456	1118 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	YOR111W	Q99210	232 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	ACC1	Q00955	2233 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
YNL057W	YNL057W	BEM2	P39960	2167 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	YLR422W	Q06409	1932 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	MRPL7	P36519	292 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	UBX7	P38349	436 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	YHL026C	P38740	315 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	5.08	□□□□□ -1.6	not detected
YNL057W	YNL057W	ALT2	P52892	507 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	PCD1	Q12524	340 aa		5.08	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	CIT1	P00890	479 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	IMP2'	P32351	346 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	PEX2	P32800	271 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	CSE2	P33308	149 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	COY1	P34237	679 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	ALG2	P43636	503 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	TPO2	P53283	614 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	ORC4	P54791	529 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	MFB1	Q04922	465 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	MNL2	Q12205	849 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	RLF2	Q12495	606 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	RAM1	P22007	431 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	ESS1	P22696	170 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	HCM1	P25364	564 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	BUD2	P33314	1104 aa		5.06	□□□□□ -1.6

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 69.7 ms