RNA–Protein interactions for RNA: YJL134W

LCB3, Transcript of Long-chain base-1-phosphate phosphatase, yeastyeast

Gene LCB3, Length 1,230 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCB3YJL134W YLH47Q06493 454 aa6.96□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W TLG2Q08144 397 aa6.96□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W YRR1Q12172 810 aa6.96□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W TUB2P02557 457 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W PDC1P06169 563 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W TRM1P15565 570 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W HPR1P17629 752 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W RAD53P22216 821 aa6.95□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W GSY1P23337 708 aa6.95□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W PEP12P32854 288 aa6.95□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W MAC1P35192 417 aa6.95□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W BCD1P38772 366 aa6.95□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W SPT8P38915 602 aa6.95□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W VTC2P43585 828 aa6.95□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W OSW7P43611 510 aa6.95□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W CIT3P43635 486 aa6.95□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W LSC2P53312 427 aa6.95□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W SPP382Q06411 708 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W YCG1Q06680 1035 aa6.95□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W PHO13P19881 312 aa6.94□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W MSH3P25336 1018 aa6.94□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W SRO9P25567 434 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W MRC1P25588 1096 aa6.94□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W PWP2P25635 923 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W MOT2P34909 587 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W YGR237CP50089 785 aa6.94□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W CBK1P53894 756 aa6.94□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W AIM33Q04516 312 aa6.94□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W SUE1Q06524 206 aa6.94□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W MCM16Q12262 181 aa6.94□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W CBP1P07252 654 aa6.93□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W PSO2P30620 661 aa6.93□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W YET1P35723 206 aa6.93□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W PET10P36139 283 aa6.93□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W ERG7P38604 731 aa6.93□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W KEL1P38853 1164 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W GAA1P39012 614 aa6.93□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W THI6P41835 540 aa6.93□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W FYV8P46949 817 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W JSN1P47135 1091 aaKnown RBP RIP-Chip data6.93□□□□□ -1.3not detected
LCB3YJL134W TBF1Q02457 562 aa6.93□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W MFM1Q02783 413 aa6.93□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W HOS3Q02959 697 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W ADY4Q05955 493 aa6.93□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W UTP4Q06679 776 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W APL4Q12028 832 aa6.93□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W WSC3Q12215 556 aa6.93□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W NOP58Q12499 511 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W CSR2Q12734 1121 aa6.93□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W FOB1O13329 566 aa6.92□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W OM45P16547 393 aa6.92□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W CKA2P19454 339 aa6.92□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W SEC65P29478 273 aa6.92□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W APE3P37302 537 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W SUL1P38359 859 aa6.92□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W CTM1P38818 585 aa6.92□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W TIF4631P39935 952 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W NIT1P40447 199 aa6.92□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W STR2P47164 639 aa6.92□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W EBS1Q03466 884 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W BUL2Q03758 920 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W MPC54Q08550 464 aa6.92□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W ISU2Q12056 156 aa6.92□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W SMC6Q12749 1114 aa6.92□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W GAL2P13181 574 aa6.91□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W MIP1P15801 1254 aa6.91□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W RRN6P32786 894 aa6.91□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W TPS3P38426 1054 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W PAN5P38787 379 aa6.91□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W RTT107P38850 1070 aa6.91□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W ROG3P43602 733 aa6.91□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W AIP1P46680 615 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W TCB2P48231 1178 aa6.91□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W SOL4P53315 255 aa6.91□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W OYE2Q03558 400 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W RBA50Q04418 439 aa6.91□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W YAP7Q08182 245 aa6.91□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W OXR1Q08952 273 aa6.91□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W ILV1P00927 576 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W PET123P17558 318 aa6.9□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W RDS2P19541 446 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W RRP43P25359 394 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W YKL091CP33324 310 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W CAB3P36076 571 aa6.9□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W MIP6P38760 659 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W NDT80P38830 627 aa6.9□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W ACA1P39970 489 aa6.9□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W FMS1P50264 508 aa6.9□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W VPS38Q05919 439 aa6.9□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W YPL216WQ08964 1102 aa6.9□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W SFI1Q12369 946 aa6.9□□□□□ -1.3
LCB3YJL134W FKS1P38631 1876 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W YEL076C-AP0CX16 216 aa6.89□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W YLR464WP0CX17 216 aa6.89□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W RPS6AP0CX37 236 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W RPS6BP0CX38 236 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W KEX2P13134 814 aa6.89□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W KRS1P15180 591 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W SPO11P23179 398 aa6.89□□□□□ -1.31
LCB3YJL134W RPC25P35718 212 aa6.89□□□□□ -1.31
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