RNA–Protein interactions for RNA: YJL114W

YJL114W, Transcript of Retrotransposon TYA Gag gene co-transcribed with TYB Pol, yeast

Gene YJL114W, Length 681 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YJL114W	YJL114W	MXR1	P40029	184 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YJL114W	YJL114W	MSE1	P48525	536 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YJL114W	YJL114W	MSC2	Q03455	724 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YJL114W	YJL114W	GIS1	Q03833	894 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YJL114W	YJL114W	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YJL114W	YJL114W	ACM1	Q08981	209 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YJL114W	YJL114W	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YJL114W	YJL114W	CDC6	P09119	513 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YJL114W	YJL114W	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YJL114W	YJL114W	ACE2	P21192	770 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YJL114W	YJL114W	GEM1	P39722	662 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YJL114W	YJL114W	RRT14	P40470	206 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YJL114W	YJL114W	VPS62	P53285	467 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YJL114W	YJL114W	YAP6	Q03935	383 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YJL114W	YJL114W	YLR224W	Q05947	369 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YJL114W	YJL114W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YJL114W	YJL114W	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YJL114W	YJL114W	EMC1	P25574	760 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YJL114W	YJL114W	GCV2	P49095	1034 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YJL114W	YJL114W	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YJL114W	YJL114W	BI4	P03879	638 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YJL114W	YJL114W	FYV10	P40492	516 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YJL114W	YJL114W	HMI1	Q12039	706 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YJL114W	YJL114W	NTO1	Q12311	748 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YJL114W	YJL114W	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YJL114W	YJL114W	SVF1	Q05515	481 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YJL114W	YJL114W	AIM21	P40563	679 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YJL114W	YJL114W	SUN4	P53616	420 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YJL114W	YJL114W	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YJL114W	YJL114W	ENA1	P13587	1091 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YJL114W	YJL114W	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YJL114W	YJL114W	SLA2	P33338	968 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YJL114W	YJL114W	POA1	P38218	177 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YJL114W	YJL114W	ZRG8	P40021	1076 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YJL114W	YJL114W	MND2	P40577	368 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YJL114W	YJL114W	PHO23	P50947	330 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YJL114W	YJL114W	ENA2	Q01896	1091 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YJL114W	YJL114W	RMD1	Q03441	430 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YJL114W	YJL114W	ENA5	Q12691	1091 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YJL114W	YJL114W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YJL114W	YJL114W	DCG1	P32460	244 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YJL114W	YJL114W	LYP1	P32487	611 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YJL114W	YJL114W	PNT1	P38969	423 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YJL114W	YJL114W	PLB1	P39105	664 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YJL114W	YJL114W	IOC3	P43596	787 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YJL114W	YJL114W	HFM1	P51979	1187 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YJL114W	YJL114W	TPO1	Q07824	586 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YJL114W	YJL114W	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YJL114W	YJL114W	OSW2	Q12202	724 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YJL114W	YJL114W	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YJL114W	YJL114W	MET12	P46151	657 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YJL114W	YJL114W	TYW3	P53177	273 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YJL114W	YJL114W	CTF4	Q01454	927 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YJL114W	YJL114W	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YJL114W	YJL114W	RKM4	Q12504	494 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YJL114W	YJL114W	HIS5	P07172	385 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YJL114W	YJL114W	INO1	P11986	533 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YJL114W	YJL114W	PET112	P33893	541 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YJL114W	YJL114W	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YJL114W	YJL114W	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YJL114W	YJL114W	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
YJL114W	YJL114W	NAP1	P25293	417 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YJL114W	YJL114W	YKL107W	P34251	309 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YJL114W	YJL114W	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YJL114W	YJL114W	SLI1	P53304	468 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YJL114W	YJL114W	ADY3	Q07732	790 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YJL114W	YJL114W	CDC34	P14682	295 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YJL114W	YJL114W	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YJL114W	YJL114W	YGL176C	P46945	554 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YJL114W	YJL114W	MTC3	P53077	123 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YJL114W	YJL114W	SPO20	Q04359	397 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YJL114W	YJL114W	XYL2	Q07993	356 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YJL114W	YJL114W	YAP1801	P38856	637 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YJL114W	YJL114W	MSS4	P38994	779 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YJL114W	YJL114W	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YJL114W	YJL114W	YGR012W	P53206	393 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YJL114W	YJL114W	AIM39	Q08223	395 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YJL114W	YJL114W	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YJL114W	YJL114W	DUT1	P33317	147 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YJL114W	YJL114W	CHA4	P43634	648 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YJL114W	YJL114W	KIN4	Q01919	800 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YJL114W	YJL114W	YLL058W	Q12198	575 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YJL114W	YJL114W	MNR2	P35724	969 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YJL114W	YJL114W	CCC2	P38995	1004 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YJL114W	YJL114W	MAD1	P40957	749 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YJL114W	YJL114W	EEB1	Q02891	456 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YJL114W	YJL114W	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YJL114W	YJL114W	MDM38	Q08179	573 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YJL114W	YJL114W	YPL066W	Q12194	479 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YJL114W	YJL114W	HSF1	P10961	833 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YJL114W	YJL114W	SRP101	P32916	621 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YJL114W	YJL114W	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.8	□□□□□ -1.64	not detected
YJL114W	YJL114W	CHS7	P38843	316 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YJL114W	YJL114W	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YJL114W	YJL114W	SPE1	P08432	466 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YJL114W	YJL114W	CLN2	P20438	545 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YJL114W	YJL114W	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YJL114W	YJL114W	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YJL114W	YJL114W	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YJL114W	YJL114W	EXG2	P52911	562 aa		4.79	□□□□□ -1.64

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