RNA–Protein interactions for RNA: YHR048W

YHK8, Transcript of Presumed antiporter of the major facilitator superfamily, yeastyeast

Gene YHK8, Length 1,545 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHK8YHR048W GPT2P36148 743 aa7.24□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W SIP3P38717 1229 aa7.24□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W WHI4Q07655 649 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W YLL058WQ12198 575 aa7.24□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W TRM11Q12463 433 aa7.24□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W TRS33Q99394 268 aa7.24□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W ECM29P38737 1868 aa7.24□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W TCP1P12612 559 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W VPS35P34110 944 aa7.23□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W RPN3P40016 523 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W PSF2P40359 213 aa7.23□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W FIS1P40515 155 aa7.23□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W VMS1Q04311 632 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W LCD1Q04377 747 aa7.23□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W GFD1Q04839 188 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W ADY4Q05955 493 aa7.23□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W SMC5Q08204 1093 aa7.23□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W MIP1P15801 1254 aa7.22□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W ESS1P22696 170 aa7.22□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W RAM2P29703 316 aa7.22□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W ATG19P35193 415 aa7.22□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W EBP2P36049 427 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W YEL025CP39991 1188 aa7.22□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W RSC1P53236 928 aa7.22□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W YML020WQ03722 664 aa7.22□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W TLG2Q08144 397 aa7.22□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W YEL076C-AP0CX16 216 aa7.22□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W YLR464WP0CX17 216 aa7.22□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W SUP45P12385 437 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W SNA3P14359 133 aa7.22□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W PFK1P16861 987 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W ISY1P21374 235 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W PRP22P24384 1145 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W RPC53P25441 422 aa7.22□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W GSY2P27472 705 aa7.22□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W UBP11P36026 717 aa7.22□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W RKM3P38222 552 aa7.22□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W BCD1P38772 366 aa7.22□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W NOC2P39744 710 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W YEL076CP39971 216 aa7.22□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W YFL034WP43564 1073 aa7.22□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W CUR1Q06469 252 aa7.22□□□□□ -1.25
YHK8YHR048W PCK1P10963 549 aa7.21□□□□□ -1.26
YHK8YHR048W POX1P13711 748 aa7.21□□□□□ -1.26
YHK8YHR048W OM45P16547 393 aa7.21□□□□□ -1.26
YHK8YHR048W AFT1P22149 690 aa7.21□□□□□ -1.26
YHK8YHR048W CDC48P25694 835 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
YHK8YHR048W RME1P32338 300 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
YHK8YHR048W DBP7P36120 742 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
YHK8YHR048W MRPL10P36520 322 aa7.21□□□□□ -1.26
YHK8YHR048W ADE17P38009 592 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
YHK8YHR048W PIH1P38768 344 aa7.21□□□□□ -1.26
YHK8YHR048W YJR107WP47145 328 aa7.21□□□□□ -1.26
YHK8YHR048W NCS2P53923 493 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
YHK8YHR048W DBP5P20449 482 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
YHK8YHR048W MRF1P30775 413 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
YHK8YHR048W RIM101P33400 625 aa7.2□□□□□ -1.26
YHK8YHR048W MIC60P36112 540 aa7.2□□□□□ -1.26
YHK8YHR048W UBP13P38187 747 aa7.2□□□□□ -1.26
YHK8YHR048W BRE2P43132 505 aa7.2□□□□□ -1.26
YHK8YHR048W PSP2P50109 593 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
YHK8YHR048W VID30P53076 958 aa7.2□□□□□ -1.26
YHK8YHR048W GUP1P53154 560 aa7.2□□□□□ -1.26
YHK8YHR048W DIP5P53388 608 aa7.2□□□□□ -1.26
YHK8YHR048W PDC1P06169 563 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
YHK8YHR048W MAK16P10962 306 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
YHK8YHR048W ATE1P16639 503 aa7.19□□□□□ -1.26
YHK8YHR048W YUR1P26725 428 aa7.19□□□□□ -1.26
YHK8YHR048W KNS1P32350 737 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
YHK8YHR048W PPS1P38148 807 aa7.19□□□□□ -1.26
YHK8YHR048W YMR321CQ04898 105 aa7.19□□□□□ -1.26
YHK8YHR048W SPP382Q06411 708 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
YHK8YHR048W HFI1Q12060 488 aa7.19□□□□□ -1.26
YHK8YHR048W HIF1Q12373 385 aa7.19□□□□□ -1.26
YHK8YHR048W CDC37P06101 506 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
YHK8YHR048W PAH1P32567 862 aa7.18□□□□□ -1.26
YHK8YHR048W SAP190P36123 1033 aa7.18□□□□□ -1.26
YHK8YHR048W AIM21P40563 679 aa7.18□□□□□ -1.26
YHK8YHR048W YGL039WP53183 348 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
YHK8YHR048W GPI13Q07830 1017 aa7.18□□□□□ -1.26
YHK8YHR048W OSW2Q12202 724 aa7.18□□□□□ -1.26
YHK8YHR048W MED1Q12321 566 aa7.18□□□□□ -1.26
YHK8YHR048W UBC1P21734 215 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
YHK8YHR048W COT1P32798 439 aa7.17□□□□□ -1.26
YHK8YHR048W YKL091CP33324 310 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
YHK8YHR048W RPS7BP48164 190 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
YHK8YHR048W AFT2Q08957 416 aa7.17□□□□□ -1.26
YHK8YHR048W YPL277CQ08989 487 aa7.17□□□□□ -1.26
YHK8YHR048W YOR131CQ12486 218 aa7.17□□□□□ -1.26
YHK8YHR048W PHO8P11491 566 aa7.17□□□□□ -1.26
YHK8YHR048W MAS2P11914 482 aa7.17□□□□□ -1.26
YHK8YHR048W IRE1P32361 1115 aa7.17□□□□□ -1.26
YHK8YHR048W LEO1P38439 464 aa7.17□□□□□ -1.26
YHK8YHR048W GUA1P38625 525 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
YHK8YHR048W EAF5P39995 279 aa7.17□□□□□ -1.26
YHK8YHR048W FYV8P46949 817 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
YHK8YHR048W JJJ3P47138 172 aa7.17□□□□□ -1.26
YHK8YHR048W COS5P47187 383 aa7.17□□□□□ -1.26
YHK8YHR048W CCM1P48237 864 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
YHK8YHR048W YGR237CP50089 785 aa7.17□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 68.7 ms