RNA–Protein interactions for RNA: YHL009W-A

YHL009W-A, Transcript of Retrotransposon TYA Gag gene co-transcribed with TYB Pol, yeastyeast

Gene YHL009W-A, Length 1,242 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHL009W-AYHL009W-A UBA2P52488 636 aa4.97□□□□□ -1.61
YHL009W-AYHL009W-A YGR122WP53272 402 aa4.97□□□□□ -1.61
YHL009W-AYHL009W-A HXT17P53631 564 aa4.97□□□□□ -1.61
YHL009W-AYHL009W-A HXT15P54854 567 aa4.97□□□□□ -1.61
YHL009W-AYHL009W-A MRL1Q06815 381 aa4.97□□□□□ -1.61
YHL009W-AYHL009W-A HIS5P07172 385 aa4.96□□□□□ -1.62
YHL009W-AYHL009W-A ENA1P13587 1091 aa4.96□□□□□ -1.62
YHL009W-AYHL009W-A PFK1P16861 987 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
YHL009W-AYHL009W-A DBP5P20449 482 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
YHL009W-AYHL009W-A HRR25P29295 494 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
YHL009W-AYHL009W-A ENA2Q01896 1091 aa4.96□□□□□ -1.62
YHL009W-AYHL009W-A ENA5Q12691 1091 aa4.96□□□□□ -1.62
YHL009W-AYHL009W-A BI4P03879 638 aa4.95□□□□□ -1.62
YHL009W-AYHL009W-A SSF1P38789 453 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
YHL009W-AYHL009W-A ZRG8P40021 1076 aa4.95□□□□□ -1.62
YHL009W-AYHL009W-A RRT14P40470 206 aa4.95□□□□□ -1.62
YHL009W-AYHL009W-A ACM1Q08981 209 aa4.95□□□□□ -1.62
YHL009W-AYHL009W-A RAD2P07276 1031 aa4.94□□□□□ -1.62
YHL009W-AYHL009W-A MPH1P40562 993 aa4.94□□□□□ -1.62
YHL009W-AYHL009W-A HFM1P51979 1187 aa4.94□□□□□ -1.62
YHL009W-AYHL009W-A ADY3Q07732 790 aa4.94□□□□□ -1.62
YHL009W-AYHL009W-A RPL11AP0C0W9 174 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
YHL009W-AYHL009W-A GNP1P48813 663 aa4.93□□□□□ -1.62
YHL009W-AYHL009W-A RPL11BQ3E757 174 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
YHL009W-AYHL009W-A GCR1P07261 785 aa4.92□□□□□ -1.62
YHL009W-AYHL009W-A MCM7P38132 845 aa4.92□□□□□ -1.62
YHL009W-AYHL009W-A GEM1P39722 662 aa4.92□□□□□ -1.62
YHL009W-AYHL009W-A CHA4P43634 648 aa4.92□□□□□ -1.62
YHL009W-AYHL009W-A EXG2P52911 562 aa4.92□□□□□ -1.62
YHL009W-AYHL009W-A THS1P04801 734 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
YHL009W-AYHL009W-A RPP2AP05319 106 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
YHL009W-AYHL009W-A DBP2P24783 546 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
YHL009W-AYHL009W-A CYC8P14922 966 aa4.9□□□□□ -1.63
YHL009W-AYHL009W-A RPS26AP39938 119 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
YHL009W-AYHL009W-A RPS26BP39939 119 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
YHL009W-AYHL009W-A SNM1P40993 198 aa4.9□□□□□ -1.63
YHL009W-AYHL009W-A GNT1Q12096 491 aa4.9□□□□□ -1.63
YHL009W-AYHL009W-A SEC20P28791 383 aa4.89□□□□□ -1.63
YHL009W-AYHL009W-A SLA2P33338 968 aa4.89□□□□□ -1.63
YHL009W-AYHL009W-A TIF35Q04067 274 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
YHL009W-AYHL009W-A XYL2Q07993 356 aa4.89□□□□□ -1.63
YHL009W-AYHL009W-A KCS1Q12494 1050 aa4.89□□□□□ -1.63
YHL009W-AYHL009W-A RER2P35196 286 aa4.88□□□□□ -1.63
YHL009W-AYHL009W-A OSW2Q12202 724 aa4.88□□□□□ -1.63
YHL009W-AYHL009W-A RAD27P26793 382 aa4.87□□□□□ -1.63
YHL009W-AYHL009W-A SPP382Q06411 708 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
YHL009W-AYHL009W-A IPL1P38991 367 aa4.86□□□□□ -1.63
YHL009W-AYHL009W-A YGR012WP53206 393 aa4.86□□□□□ -1.63
YHL009W-AYHL009W-A SUL1P38359 859 aa4.85□□□□□ -1.63
YHL009W-AYHL009W-A PNT1P38969 423 aa4.85□□□□□ -1.63
YHL009W-AYHL009W-A YOL073CQ08232 322 aa4.85□□□□□ -1.63
YHL009W-AYHL009W-A EFT1P32324 842 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
YHL009W-AYHL009W-A YAP1801P38856 637 aa4.84□□□□□ -1.63
YHL009W-AYHL009W-A STU2P46675 888 aa4.84□□□□□ -1.63
YHL009W-AYHL009W-A MTC3P53077 123 aa4.84□□□□□ -1.63
YHL009W-AYHL009W-A YLR040CQ07988 224 aa4.84□□□□□ -1.63
YHL009W-AYHL009W-A ENB1Q08299 606 aa4.84□□□□□ -1.63
YHL009W-AYHL009W-A NPC2Q12408 173 aa4.84□□□□□ -1.63
YHL009W-AYHL009W-A BDF2Q07442 638 aa4.83□□□□□ -1.64
YHL009W-AYHL009W-A SPE1P08432 466 aa4.82□□□□□ -1.64
YHL009W-AYHL009W-A MCM2P29469 868 aa4.82□□□□□ -1.64
YHL009W-AYHL009W-A ATF1P40353 525 aa4.82□□□□□ -1.64
YHL009W-AYHL009W-A PSP2P50109 593 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
YHL009W-AYHL009W-A NPL3Q01560 414 aaKnown RBP RIP-Chip data4.82□□□□□ -1.64not detected
YHL009W-AYHL009W-A LAS17Q12446 633 aa4.82□□□□□ -1.64
YHL009W-AYHL009W-A SRP101P32916 621 aa4.81□□□□□ -1.64
YHL009W-AYHL009W-A CCC2P38995 1004 aa4.81□□□□□ -1.64
YHL009W-AYHL009W-A LGE1Q02796 332 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
YHL009W-AYHL009W-A TMN2Q04562 672 aa4.81□□□□□ -1.64
YHL009W-AYHL009W-A CDA1Q06702 301 aa4.81□□□□□ -1.64
YHL009W-AYHL009W-A MCH5Q08777 521 aa4.81□□□□□ -1.64
YHL009W-AYHL009W-A RTT10Q08924 1013 aa4.81□□□□□ -1.64
YHL009W-AYHL009W-A CAD1P24813 409 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
YHL009W-AYHL009W-A KAR4P25583 335 aa4.8□□□□□ -1.64
YHL009W-AYHL009W-A MGE1P38523 228 aa4.8□□□□□ -1.64
YHL009W-AYHL009W-A STB4P50104 949 aa4.8□□□□□ -1.64
YHL009W-AYHL009W-A NCS6P53088 359 aa4.8□□□□□ -1.64
YHL009W-AYHL009W-A YMR206WQ03695 313 aa4.8□□□□□ -1.64
YHL009W-AYHL009W-A HSF1P10961 833 aa4.79□□□□□ -1.64
YHL009W-AYHL009W-A KTR4P38131 464 aa4.79□□□□□ -1.64
YHL009W-AYHL009W-A QRI1P43123 477 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
YHL009W-AYHL009W-A ECM21P38167 1117 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
YHL009W-AYHL009W-A MDM38Q08179 573 aa4.78□□□□□ -1.64
YHL009W-AYHL009W-A TMA46Q12000 345 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
YHL009W-AYHL009W-A ERG4P25340 473 aa4.77□□□□□ -1.65
YHL009W-AYHL009W-A ATG19P35193 415 aa4.77□□□□□ -1.65
YHL009W-AYHL009W-A URM1P40554 99 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
YHL009W-AYHL009W-A BUL1P48524 976 aa4.77□□□□□ -1.65
YHL009W-AYHL009W-A SPR28Q04921 423 aa4.77□□□□□ -1.65
YHL009W-AYHL009W-A WHI4Q07655 649 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
YHL009W-AYHL009W-A GUP2Q08929 609 aa4.77□□□□□ -1.65
YHL009W-AYHL009W-A ACF2Q12168 779 aa4.77□□□□□ -1.65
YHL009W-AYHL009W-A SLD2P34252 453 aa4.76□□□□□ -1.65
YHL009W-AYHL009W-A MOT2P34909 587 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
YHL009W-AYHL009W-A CUE2P36075 443 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
YHL009W-AYHL009W-A TIM44Q01852 431 aa4.76□□□□□ -1.65
YHL009W-AYHL009W-A OMS1Q06668 471 aa4.76□□□□□ -1.65
YHL009W-AYHL009W-A IRC10Q08118 586 aa4.76□□□□□ -1.65
YHL009W-AYHL009W-A INO1P11986 533 aa4.75□□□□□ -1.65
YHL009W-AYHL009W-A LYP1P32487 611 aa4.75□□□□□ -1.65
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