RNA–Protein interactions for RNA: YGR252W

GCN5, Transcript of Catalytic subunit of ADA and SAGA histone acetyltransferase complexes, yeast

Gene GCN5, Length 1,320 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GCN5	YGR252W	YPL109C	Q02981	657 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GCN5	YGR252W	HMI1	Q12039	706 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GCN5	YGR252W	PTC5	Q12511	572 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GCN5	YGR252W	BUD4	P47136	1447 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GCN5	YGR252W	MYO4	P32492	1471 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GCN5	YGR252W	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
GCN5	YGR252W	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
GCN5	YGR252W	NAP1	P25293	417 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
GCN5	YGR252W	SMC4	Q12267	1418 aa		5	□□□□□ -1.61
GCN5	YGR252W	MON2	P48563	1636 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
GCN5	YGR252W	RAD2	P07276	1031 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GCN5	YGR252W	CYC8	P14922	966 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GCN5	YGR252W	UGA4	P32837	571 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GCN5	YGR252W	SEC8	P32855	1065 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GCN5	YGR252W	FAA3	P39002	694 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GCN5	YGR252W	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
GCN5	YGR252W	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
GCN5	YGR252W	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
GCN5	YGR252W	ECM5	Q03214	1411 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GCN5	YGR252W	YPK9	Q12697	1472 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GCN5	YGR252W	DNA2	P38859	1522 aa		4.99	□□□□□ -1.61
GCN5	YGR252W	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GCN5	YGR252W	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GCN5	YGR252W	EST2	Q06163	884 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GCN5	YGR252W	ESP1	Q03018	1630 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GCN5	YGR252W	YOR1	P53049	1477 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GCN5	YGR252W	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
GCN5	YGR252W	STH1	P32597	1359 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GCN5	YGR252W	BPT1	P14772	1559 aa		4.98	□□□□□ -1.61
GCN5	YGR252W	GCV2	P49095	1034 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GCN5	YGR252W	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GCN5	YGR252W	SIZ1	Q04195	904 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GCN5	YGR252W	SVF1	Q05515	481 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GCN5	YGR252W	TOS4	Q06266	489 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GCN5	YGR252W	SCC2	Q04002	1493 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GCN5	YGR252W	SSM4	P40318	1319 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GCN5	YGR252W	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
GCN5	YGR252W	ENT3	P47160	408 aa		4.97	□□□□□ -1.61
GCN5	YGR252W	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GCN5	YGR252W	APL1	P27351	700 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GCN5	YGR252W	PEP7	P32609	515 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GCN5	YGR252W	ALG3	P38179	458 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GCN5	YGR252W	PLB1	P39105	664 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GCN5	YGR252W	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
GCN5	YGR252W	YGL140C	P53120	1219 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GCN5	YGR252W	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.96	□□□□□ -1.62	not detected
GCN5	YGR252W	YPL260W	Q08977	551 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GCN5	YGR252W	SVS1	Q12254	260 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GCN5	YGR252W	PAN1	P32521	1480 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCN5	YGR252W	MCM2	P29469	868 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCN5	YGR252W	FYV10	P40492	516 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCN5	YGR252W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GCN5	YGR252W	AIM39	Q08223	395 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GCN5	YGR252W	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GCN5	YGR252W	PIC2	P40035	300 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GCN5	YGR252W	YFL054C	P43549	646 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GCN5	YGR252W	IOC3	P43596	787 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GCN5	YGR252W	SPR28	Q04921	423 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GCN5	YGR252W	RKR1	Q04781	1562 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCN5	YGR252W	MNR2	P35724	969 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GCN5	YGR252W	SNQ2	P32568	1501 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GCN5	YGR252W	RAD27	P26793	382 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCN5	YGR252W	TOP2	P06786	1428 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GCN5	YGR252W	NUP170	P38181	1502 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GCN5	YGR252W	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GCN5	YGR252W	CLN2	P20438	545 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GCN5	YGR252W	PET112	P33893	541 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GCN5	YGR252W	SIW14	P53965	281 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GCN5	YGR252W	RTT10	Q08924	1013 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GCN5	YGR252W	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GCN5	YGR252W	RPO31	P04051	1460 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GCN5	YGR252W	GEA1	P47102	1408 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GCN5	YGR252W	SPT7	P35177	1332 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GCN5	YGR252W	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GCN5	YGR252W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GCN5	YGR252W	MSC2	Q03455	724 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GCN5	YGR252W	MRL1	Q06815	381 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GCN5	YGR252W	TSC11	P40061	1430 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCN5	YGR252W	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GCN5	YGR252W	STU2	P46675	888 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCN5	YGR252W	GCR1	P07261	785 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCN5	YGR252W	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
GCN5	YGR252W	ATG2	P53855	1592 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCN5	YGR252W	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GCN5	YGR252W	EXG2	P52911	562 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCN5	YGR252W	NOP7	P53261	605 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GCN5	YGR252W	ATG13	Q06628	738 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCN5	YGR252W	MAD1	P40957	749 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GCN5	YGR252W	GNP1	P48813	663 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GCN5	YGR252W	TPO1	Q07824	586 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GCN5	YGR252W	CDC34	P14682	295 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GCN5	YGR252W	MKK2	P32491	506 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GCN5	YGR252W	MND2	P40577	368 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GCN5	YGR252W	MET12	P46151	657 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GCN5	YGR252W	TMN2	Q04562	672 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GCN5	YGR252W	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
GCN5	YGR252W	MET10	P39692	1035 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GCN5	YGR252W	HXT13	P39924	564 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GCN5	YGR252W	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
GCN5	YGR252W	CNN1	P43618	361 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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