RNA–Protein interactions for RNA: YAL003W

EFB1, Transcript of Translation elongation factor 1 beta, yeast

Gene EFB1, Length 621 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
EFB1	YAL003W	HDA3	Q06623	655 aa		4.8	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	ELG1	Q12050	791 aa		4.8	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	CSR2	Q12734	1121 aa		4.8	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	TUS1	Q06412	1307 aa		4.79	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	BIK1	P11709	440 aa		4.79	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.79	□□□□□ -1.64	not detected
EFB1	YAL003W	CBP3	P21560	335 aa		4.79	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	SOH1	P38633	127 aa		4.79	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	BDH2	P39713	417 aa		4.79	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	NPA3	P47122	385 aa		4.79	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	CTF18	P49956	741 aa		4.79	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	FOL1	P53848	824 aa		4.79	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	YPL150W	Q12152	901 aa		4.79	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	MYO1	P08964	1928 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	NUC1	P08466	329 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	SSA4	P22202	642 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	CHS3	P29465	1165 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	ASF1	P32447	279 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	MSC7	P38694	644 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	AKR1	P39010	764 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	YIL089W	P40500	205 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	HRQ1	Q05549	1077 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	UTP13	Q05946	817 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	YPQ2	Q06328	317 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
EFB1	YAL003W	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
EFB1	YAL003W	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
EFB1	YAL003W	SEC20	P28791	383 aa		4.77	□□□□□ -1.65
EFB1	YAL003W	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
EFB1	YAL003W	MAC1	P35192	417 aa		4.77	□□□□□ -1.65
EFB1	YAL003W	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
EFB1	YAL003W	ACA1	P39970	489 aa		4.77	□□□□□ -1.65
EFB1	YAL003W	CSM2	P40465	213 aa		4.77	□□□□□ -1.65
EFB1	YAL003W	BUD6	P41697	788 aa		4.77	□□□□□ -1.65
EFB1	YAL003W	PEX14	P53112	341 aa		4.77	□□□□□ -1.65
EFB1	YAL003W	SOL4	P53315	255 aa		4.77	□□□□□ -1.65
EFB1	YAL003W	HST1	P53685	503 aa		4.77	□□□□□ -1.65
EFB1	YAL003W	FAR11	P53917	953 aa		4.77	□□□□□ -1.65
EFB1	YAL003W	VPS30	Q02948	557 aa		4.77	□□□□□ -1.65
EFB1	YAL003W	GDE1	Q02979	1223 aa		4.77	□□□□□ -1.65
EFB1	YAL003W	YPL034W	Q03083	165 aa		4.77	□□□□□ -1.65
EFB1	YAL003W	DSE3	Q08729	430 aa		4.77	□□□□□ -1.65
EFB1	YAL003W	LAP2	Q10740	671 aa		4.77	□□□□□ -1.65
EFB1	YAL003W	YOR111W	Q99210	232 aa		4.77	□□□□□ -1.65
EFB1	YAL003W	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
EFB1	YAL003W	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
EFB1	YAL003W	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
EFB1	YAL003W	ACE2	P21192	770 aa		4.76	□□□□□ -1.65
EFB1	YAL003W	OCT1	P35999	772 aa		4.76	□□□□□ -1.65
EFB1	YAL003W	MAL33	P38157	468 aa		4.76	□□□□□ -1.65
EFB1	YAL003W	RFC5	P38251	354 aa		4.76	□□□□□ -1.65
EFB1	YAL003W	RXT2	P38255	430 aa		4.76	□□□□□ -1.65
EFB1	YAL003W	GUA1	P38625	525 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
EFB1	YAL003W	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
EFB1	YAL003W	EPL1	P43572	832 aa		4.76	□□□□□ -1.65
EFB1	YAL003W	MDM1	Q01846	1127 aa		4.76	□□□□□ -1.65
EFB1	YAL003W	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
EFB1	YAL003W	GIN4	Q12263	1142 aa		4.76	□□□□□ -1.65
EFB1	YAL003W	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
EFB1	YAL003W	PER1	P25625	357 aa		4.75	□□□□□ -1.65
EFB1	YAL003W	ELM1	P32801	640 aa		4.75	□□□□□ -1.65
EFB1	YAL003W	VPS45	P38932	577 aa		4.75	□□□□□ -1.65
EFB1	YAL003W	PNT1	P38969	423 aa		4.75	□□□□□ -1.65
EFB1	YAL003W	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
EFB1	YAL003W	PCI8	P40512	444 aa		4.75	□□□□□ -1.65
EFB1	YAL003W	YGL138C	P53122	345 aa		4.75	□□□□□ -1.65
EFB1	YAL003W	LSB1	P53281	241 aa		4.75	□□□□□ -1.65
EFB1	YAL003W	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
EFB1	YAL003W	COG8	Q04632	607 aa		4.75	□□□□□ -1.65
EFB1	YAL003W	CEX1	Q12453	761 aa		4.75	□□□□□ -1.65
EFB1	YAL003W	CIT1	P00890	479 aa		4.74	□□□□□ -1.65
EFB1	YAL003W	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
EFB1	YAL003W	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
EFB1	YAL003W	CDC6	P09119	513 aa		4.74	□□□□□ -1.65
EFB1	YAL003W	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
EFB1	YAL003W	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
EFB1	YAL003W	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
EFB1	YAL003W	MSP1	P28737	362 aa		4.74	□□□□□ -1.65
EFB1	YAL003W	YBL036C	P38197	257 aa		4.74	□□□□□ -1.65
EFB1	YAL003W	BSD2	P38356	321 aa		4.74	□□□□□ -1.65
EFB1	YAL003W	VAB2	P40003	282 aa		4.74	□□□□□ -1.65
EFB1	YAL003W	ATG3	P40344	310 aa		4.74	□□□□□ -1.65
EFB1	YAL003W	TPM2	P40414	161 aa		4.74	□□□□□ -1.65
EFB1	YAL003W	LYS14	P40971	790 aa		4.74	□□□□□ -1.65
EFB1	YAL003W	NET1	P47035	1189 aa		4.74	□□□□□ -1.65
EFB1	YAL003W	ENT3	P47160	408 aa		4.74	□□□□□ -1.65
EFB1	YAL003W	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
EFB1	YAL003W	DCS2	Q12123	353 aa		4.74	□□□□□ -1.65
EFB1	YAL003W	SWI5	P08153	709 aa		4.73	□□□□□ -1.65
EFB1	YAL003W	FBP1	P09201	348 aa		4.73	□□□□□ -1.65
EFB1	YAL003W	HVG1	P0CE11	249 aa		4.73	□□□□□ -1.65

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