RNA–Protein interactions for RNA: Q0120

BI4, Transcript of Mitochondrial mRNA maturase, yeast

Gene BI4, Length 1,917 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BI4	Q0120	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
BI4	Q0120	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
BI4	Q0120	PBY1	P38254	753 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BI4	Q0120	PFD1	P46988	109 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BI4	Q0120	SRM1	P21827	482 aa		4.06	□□□□□ -1.76
BI4	Q0120	HFM1	P51979	1187 aa		4.06	□□□□□ -1.76
BI4	Q0120	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
BI4	Q0120	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
BI4	Q0120	RAD4	P14736	754 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BI4	Q0120	MRPL22	P53881	309 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BI4	Q0120	FMP25	Q08023	583 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BI4	Q0120	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
BI4	Q0120	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
BI4	Q0120	RNQ1	P25367	405 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BI4	Q0120	APL1	P27351	700 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BI4	Q0120	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
BI4	Q0120	RRT14	P40470	206 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BI4	Q0120	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.05	□□□□□ -1.76	not detected
BI4	Q0120	RSM24	Q03976	319 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BI4	Q0120	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
BI4	Q0120	YDR306C	Q06640	478 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BI4	Q0120	CDA2	Q06703	312 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BI4	Q0120	XYL2	Q07993	356 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BI4	Q0120	MDM38	Q08179	573 aa		4.05	□□□□□ -1.76
BI4	Q0120	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
BI4	Q0120	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
BI4	Q0120	NPP2	P39997	493 aa		4.04	□□□□□ -1.76
BI4	Q0120	NNF1	P47149	201 aa		4.04	□□□□□ -1.76
BI4	Q0120	ENV11	P53246	860 aa		4.04	□□□□□ -1.76
BI4	Q0120	PLB2	Q03674	706 aa		4.04	□□□□□ -1.76
BI4	Q0120	CMP2	P14747	604 aa		4.03	□□□□□ -1.76
BI4	Q0120	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
BI4	Q0120	IOC3	P43596	787 aa		4.03	□□□□□ -1.76
BI4	Q0120	SNO2	P53823	222 aa		4.03	□□□□□ -1.76
BI4	Q0120	GAL10	P04397	699 aa		4.03	□□□□□ -1.76
BI4	Q0120	ELM1	P32801	640 aa		4.03	□□□□□ -1.76
BI4	Q0120	OCA5	P38738	679 aa		4.03	□□□□□ -1.76
BI4	Q0120	GIC1	P38785	314 aa		4.03	□□□□□ -1.76
BI4	Q0120	YJL049W	P47048	450 aa		4.03	□□□□□ -1.76
BI4	Q0120	HUL5	P53119	910 aa		4.03	□□□□□ -1.76
BI4	Q0120	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
BI4	Q0120	SRT1	Q03175	343 aa		4.03	□□□□□ -1.76
BI4	Q0120	MSC2	Q03455	724 aa		4.03	□□□□□ -1.76
BI4	Q0120	UBX5	Q06682	500 aa		4.03	□□□□□ -1.76
BI4	Q0120	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.03	□□□□□ -1.76	not detected
BI4	Q0120	YLL058W	Q12198	575 aa		4.03	□□□□□ -1.76
BI4	Q0120	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
BI4	Q0120	AFR1	P33304	620 aa		4.02	□□□□□ -1.77
BI4	Q0120	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
BI4	Q0120	ALR2	P43553	858 aa		4.02	□□□□□ -1.77
BI4	Q0120	TIM54	P47045	478 aa		4.02	□□□□□ -1.77
BI4	Q0120	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
BI4	Q0120	ROT1	Q03691	256 aa		4.02	□□□□□ -1.77
BI4	Q0120	SGD1	Q06132	899 aa		4.02	□□□□□ -1.77
BI4	Q0120	EAF1	Q06337	982 aa		4.02	□□□□□ -1.77
BI4	Q0120	SPO75	Q07798	868 aa		4.02	□□□□□ -1.77
BI4	Q0120	NPP1	P25353	742 aa		4.01	□□□□□ -1.77
BI4	Q0120	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
BI4	Q0120	LAM1	P38851	1228 aa		4.01	□□□□□ -1.77
BI4	Q0120	YAP1801	P38856	637 aa		4.01	□□□□□ -1.77
BI4	Q0120	SIZ1	Q04195	904 aa		4.01	□□□□□ -1.77
BI4	Q0120	NSE3	Q05541	303 aa		4.01	□□□□□ -1.77
BI4	Q0120	BDF2	Q07442	638 aa		4.01	□□□□□ -1.77
BI4	Q0120	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
BI4	Q0120	PPH3	P32345	308 aa		4.01	□□□□□ -1.77
BI4	Q0120	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
BI4	Q0120	NIT1	P40447	199 aa		4.01	□□□□□ -1.77
BI4	Q0120	SFB2	P53953	876 aa		4.01	□□□□□ -1.77
BI4	Q0120	OSW2	Q12202	724 aa		4.01	□□□□□ -1.77
BI4	Q0120	YOL098C	Q12496	1037 aa		4.01	□□□□□ -1.77
BI4	Q0120	ARE1	P25628	610 aa		4	□□□□□ -1.77
BI4	Q0120	ERT1	P38140	529 aa		4	□□□□□ -1.77
BI4	Q0120	YBR284W	P38150	797 aa		4	□□□□□ -1.77
BI4	Q0120	MEF2	P39677	819 aa		4	□□□□□ -1.77
BI4	Q0120	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
BI4	Q0120	YGR125W	P53273	1036 aa		4	□□□□□ -1.77
BI4	Q0120	FLC1	Q08967	793 aa		4	□□□□□ -1.77
BI4	Q0120	YPL277C	Q08989	487 aa		4	□□□□□ -1.77
BI4	Q0120	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
BI4	Q0120	FUN30	P31380	1131 aa		3.99	□□□□□ -1.77
BI4	Q0120	THI80	P35202	319 aa		3.99	□□□□□ -1.77
BI4	Q0120	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
BI4	Q0120	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
BI4	Q0120	SIT1	P39980	628 aa		3.99	□□□□□ -1.77
BI4	Q0120	ERP6	P53198	216 aa		3.99	□□□□□ -1.77
BI4	Q0120	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
BI4	Q0120	DUS4	Q06063	367 aa		3.99	□□□□□ -1.77
BI4	Q0120	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
BI4	Q0120	OSH2	Q12451	1283 aa		3.99	□□□□□ -1.77
BI4	Q0120	CIT1	P00890	479 aa		3.99	□□□□□ -1.77
BI4	Q0120	ADE8	P04161	214 aa		3.99	□□□□□ -1.77
BI4	Q0120	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
BI4	Q0120	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
BI4	Q0120	YRO2	P38079	344 aa		3.99	□□□□□ -1.77
BI4	Q0120	GYP7	P48365	746 aa		3.99	□□□□□ -1.77
BI4	Q0120	YDR132C	Q03900	495 aa		3.99	□□□□□ -1.77
BI4	Q0120	HBN1	Q96VH4	193 aa		3.99	□□□□□ -1.77
BI4	Q0120	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.98	□□□□□ -1.77	not detected
BI4	Q0120	CCC2	P38995	1004 aa		3.98	□□□□□ -1.77
BI4	Q0120	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 33.6 ms