RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630499.2

SRRM2-231, Transcript of serine/arginine repetitive matrix 2, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene SRRM2, Length 1,207 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SRRM2-231	ENST00000630499	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		30.12	■■■□□ 2.41
SRRM2-231	ENST00000630499	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		30.12	■■■□□ 2.41
SRRM2-231	ENST00000630499	SBF1	O95248	1867 aa		30.11	■■■□□ 2.41
SRRM2-231	ENST00000630499	HSPA6	P17066	643 aa		30.11	■■■□□ 2.41
SRRM2-231	ENST00000630499	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		30.11	■■■□□ 2.41
SRRM2-231	ENST00000630499	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		30.11	■■■□□ 2.41
SRRM2-231	ENST00000630499	NARF	Q9UHQ1	456 aa		30.11	■■■□□ 2.41
SRRM2-231	ENST00000630499	PIM2	Q9P1W9	311 aa		30.1	■■■□□ 2.41
SRRM2-231	ENST00000630499	ZPR1	O75312	459 aa		30.07	■■■□□ 2.4
SRRM2-231	ENST00000630499	CHRNA5	P30532	468 aa		30.07	■■■□□ 2.4
SRRM2-231	ENST00000630499	NFIX	Q14938	502 aa		30.07	■■■□□ 2.4
SRRM2-231	ENST00000630499	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		30.07	■■■□□ 2.4
SRRM2-231	ENST00000630499	SCN7A	Q01118	1682 aa		30.05	■■■□□ 2.4
SRRM2-231	ENST00000630499	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	30.05	■■■□□ 2.4
SRRM2-231	ENST00000630499	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		30.04	■■■□□ 2.4
SRRM2-231	ENST00000630499	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	30.03	■■■□□ 2.4
SRRM2-231	ENST00000630499	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		30.02	■■■□□ 2.4
SRRM2-231	ENST00000630499	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	30.02	■■■□□ 2.4
SRRM2-231	ENST00000630499	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		30.01	■■■□□ 2.39
SRRM2-231	ENST00000630499	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		30.01	■■■□□ 2.39
SRRM2-231	ENST00000630499	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		30.01	■■■□□ 2.39
SRRM2-231	ENST00000630499	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		30.01	■■■□□ 2.39
SRRM2-231	ENST00000630499	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	30	■■■□□ 2.39
SRRM2-231	ENST00000630499	ZNF790	Q6PG37	636 aa		30	■■■□□ 2.39
SRRM2-231	ENST00000630499	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		30	■■■□□ 2.39
SRRM2-231	ENST00000630499	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		29.99	■■■□□ 2.39
SRRM2-231	ENST00000630499	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		29.99	■■■□□ 2.39
SRRM2-231	ENST00000630499	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		29.98	■■■□□ 2.39
SRRM2-231	ENST00000630499	TOMM70	O94826	608 aa		29.97	■■■□□ 2.39
SRRM2-231	ENST00000630499	SERPINB2	P05120	415 aa		29.97	■■■□□ 2.39
SRRM2-231	ENST00000630499	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	29.97	■■■□□ 2.39
SRRM2-231	ENST00000630499	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		29.97	■■■□□ 2.39
SRRM2-231	ENST00000630499	STARD3NL	O95772	234 aa		29.96	■■■□□ 2.39
SRRM2-231	ENST00000630499	TEF	Q10587	303 aa		29.95	■■■□□ 2.39
SRRM2-231	ENST00000630499	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	29.95	■■■□□ 2.39
SRRM2-231	ENST00000630499	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		29.95	■■■□□ 2.38
SRRM2-231	ENST00000630499	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	29.95	■■■□□ 2.38
SRRM2-231	ENST00000630499	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	29.93	■■■□□ 2.38
SRRM2-231	ENST00000630499	PRKAR2B	P31323	418 aa		29.92	■■■□□ 2.38
SRRM2-231	ENST00000630499	PRELP	P51888	382 aa		29.92	■■■□□ 2.38
SRRM2-231	ENST00000630499	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	29.92	■■■□□ 2.38
SRRM2-231	ENST00000630499	RNF181	Q9P0P0	153 aa		29.92	■■■□□ 2.38
SRRM2-231	ENST00000630499		A0A087WZG4	1122 aa		29.91	■■■□□ 2.38
SRRM2-231	ENST00000630499	KCNQ3	O43525	872 aa		29.9	■■■□□ 2.38
SRRM2-231	ENST00000630499	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	29.9	■■■□□ 2.38
SRRM2-231	ENST00000630499	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		29.9	■■■□□ 2.38
SRRM2-231	ENST00000630499	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		29.9	■■■□□ 2.38
SRRM2-231	ENST00000630499	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		29.89	■■■□□ 2.38
SRRM2-231	ENST00000630499	WDR90	Q96KV7	1748 aa		29.88	■■■□□ 2.37
SRRM2-231	ENST00000630499	PPP2R1A	P30153	589 aa		29.88	■■■□□ 2.37
SRRM2-231	ENST00000630499	RASSF7	Q02833	373 aa		29.88	■■■□□ 2.37
SRRM2-231	ENST00000630499	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		29.88	■■■□□ 2.37
SRRM2-231	ENST00000630499	APLP1	P51693	650 aa		29.87	■■■□□ 2.37
SRRM2-231	ENST00000630499	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		29.87	■■■□□ 2.37
SRRM2-231	ENST00000630499	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	29.87	■■■□□ 2.37
SRRM2-231	ENST00000630499	A1BG	P04217	495 aa		29.86	■■■□□ 2.37
SRRM2-231	ENST00000630499	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		29.86	■■■□□ 2.37
SRRM2-231	ENST00000630499	TTLL6	Q8N841	843 aa		29.86	■■■□□ 2.37
SRRM2-231	ENST00000630499	CFAP53	Q96M91	514 aa		29.86	■■■□□ 2.37
SRRM2-231	ENST00000630499	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	29.86	■■■□□ 2.37
SRRM2-231	ENST00000630499	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		29.85	■■■□□ 2.37
SRRM2-231	ENST00000630499	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		29.85	■■■□□ 2.37
SRRM2-231	ENST00000630499	PCNT	O95613	3336 aa		29.84	■■■□□ 2.37
SRRM2-231	ENST00000630499	BTBD11	A6QL63	1104 aa		29.84	■■■□□ 2.37
SRRM2-231	ENST00000630499	CAMTA2	O94983	1202 aa		29.84	■■■□□ 2.37
SRRM2-231	ENST00000630499	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		29.84	■■■□□ 2.37
SRRM2-231	ENST00000630499	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		29.84	■■■□□ 2.37
SRRM2-231	ENST00000630499	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		29.83	■■■□□ 2.37
SRRM2-231	ENST00000630499		H0YIN7	160 aa		29.82	■■■□□ 2.36
SRRM2-231	ENST00000630499	NFKBIE	O00221	500 aa		29.82	■■■□□ 2.36
SRRM2-231	ENST00000630499	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	29.82	■■■□□ 2.36
SRRM2-231	ENST00000630499	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		29.82	■■■□□ 2.36
SRRM2-231	ENST00000630499	LMNB1	P20700	586 aa		29.81	■■■□□ 2.36
SRRM2-231	ENST00000630499	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		29.81	■■■□□ 2.36
SRRM2-231	ENST00000630499	USP16	Q9Y5T5	823 aa		29.81	■■■□□ 2.36
SRRM2-231	ENST00000630499	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		29.8	■■■□□ 2.36
SRRM2-231	ENST00000630499	NUDC	Q9Y266	331 aa		29.8	■■■□□ 2.36
SRRM2-231	ENST00000630499	IFFO2	Q5TF58	517 aa		29.79	■■■□□ 2.36
SRRM2-231	ENST00000630499	RRAGC	Q9HB90	399 aa		29.79	■■■□□ 2.36
SRRM2-231	ENST00000630499	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		29.79	■■■□□ 2.36
SRRM2-231	ENST00000630499	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	29.78	■■■□□ 2.36
SRRM2-231	ENST00000630499	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	29.78	■■■□□ 2.36	5e-8	■■□□□ 12.3
SRRM2-231	ENST00000630499	FSTL1	Q12841	308 aa		29.78	■■■□□ 2.36
SRRM2-231	ENST00000630499	MCM10	Q7L590	875 aa		29.78	■■■□□ 2.36
SRRM2-231	ENST00000630499	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		29.78	■■■□□ 2.36
SRRM2-231	ENST00000630499	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	29.77	■■■□□ 2.36
SRRM2-231	ENST00000630499	SLX4	Q8IY92	1834 aa		29.77	■■■□□ 2.36
SRRM2-231	ENST00000630499	CACNA1S	Q13698	1873 aa		29.76	■■■□□ 2.36
SRRM2-231	ENST00000630499	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		29.76	■■■□□ 2.35
SRRM2-231	ENST00000630499	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		29.75	■■■□□ 2.35
SRRM2-231	ENST00000630499	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	29.75	■■■□□ 2.35
SRRM2-231	ENST00000630499	PDE6B	P35913	854 aa		29.75	■■■□□ 2.35
SRRM2-231	ENST00000630499	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		29.75	■■■□□ 2.35
SRRM2-231	ENST00000630499	GLTPD2	A6NH11	291 aa		29.74	■■■□□ 2.35
SRRM2-231	ENST00000630499	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	29.74	■■■□□ 2.35
SRRM2-231	ENST00000630499	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	29.74	■■■□□ 2.35
SRRM2-231	ENST00000630499	DCTN1	Q14203	1278 aa		29.73	■■■□□ 2.35
SRRM2-231	ENST00000630499	SETDB2	Q96T68	719 aa		29.73	■■■□□ 2.35
SRRM2-231	ENST00000630499	NBPF26	B4DH59	902 aa		29.72	■■■□□ 2.35
SRRM2-231	ENST00000630499	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	29.72	■■■□□ 2.35

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