RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 PDIA6Q15084 440 aa28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-207ENST00000589146 C8orf37Q96NL8 207 aa28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-207ENST00000589146 ITGB4P16144 1822 aa28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-207ENST00000589146 TMOD3Q9NYL9 352 aa28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-207ENST00000589146 DDB1Q16531 1140 aa28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-207ENST00000589146 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa28.71■■■□□ 2.19
CAPNS1-207ENST00000589146 ERBB4Q15303 1308 aa28.7■■■□□ 2.19
CAPNS1-207ENST00000589146 ATP10DQ9P241 1426 aa28.69■■■□□ 2.18
CAPNS1-207ENST00000589146 PROSER3Q2NL68 480 aa28.69■■■□□ 2.18
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC4A10Q6U841 1118 aa28.69■■■□□ 2.18
CAPNS1-207ENST00000589146 BCL9O00512 1426 aa28.69■■■□□ 2.18
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CAPNS1-207ENST00000589146 USP16Q9Y5T5 823 aa28.68■■■□□ 2.18
CAPNS1-207ENST00000589146 ADCY9O60503 1353 aa28.67■■■□□ 2.18
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CAPNS1-207ENST00000589146 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
CAPNS1-207ENST00000589146 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa28.64■■■□□ 2.18
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CAPNS1-207ENST00000589146 BEND3Q5T5X7 828 aa28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-207ENST00000589146 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
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CAPNS1-207ENST00000589146 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa28.61■■■□□ 2.17
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CAPNS1-207ENST00000589146 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
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CAPNS1-207ENST00000589146 ALDH1L1O75891 902 aa28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-207ENST00000589146 CEP85Q6P2H3 762 aa28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-207ENST00000589146 GCC1Q96CN9 775 aa28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-207ENST00000589146 ASAP1Q9ULH1 1129 aa28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-207ENST00000589146 GNAI2P04899 355 aa28.58■■■□□ 2.17
CAPNS1-207ENST00000589146 SKAP1Q86WV1 359 aa28.58■■■□□ 2.17
CAPNS1-207ENST00000589146 USP44Q9H0E7 712 aa28.58■■■□□ 2.17
CAPNS1-207ENST00000589146 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa28.58■■■□□ 2.17
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CAPNS1-207ENST00000589146 PDE4AP27815 886 aa28.44■■■□□ 2.14
CAPNS1-207ENST00000589146 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-207ENST00000589146 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-207ENST00000589146 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-207ENST00000589146 ACSBG1Q96GR2 724 aa28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF831Q5JPB2 1677 aa28.42■■■□□ 2.14
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