RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 TNNQ9UQP3 1299 aa39.47■■■■□ 3.91
CAPNS1-206ENST00000588815 COG6Q9Y2V7 657 aa39.47■■■■□ 3.91
CAPNS1-206ENST00000588815 ERBB4Q15303 1308 aa39.45■■■■□ 3.91
CAPNS1-206ENST00000588815 FLIIQ13045 1269 aa39.45■■■■□ 3.91
CAPNS1-206ENST00000588815 CHPF2Q9P2E5 772 aa39.45■■■■□ 3.91
CAPNS1-206ENST00000588815 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP39.45■■■■□ 3.91
CAPNS1-206ENST00000588815 RGS12O14924 1447 aa39.44■■■■□ 3.9
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CAPNS1-206ENST00000588815 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP39.44■■■■□ 3.9
CAPNS1-206ENST00000588815 ASAP1Q9ULH1 1129 aa39.44■■■■□ 3.9
CAPNS1-206ENST00000588815 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP39.43■■■■□ 3.9
CAPNS1-206ENST00000588815 HYPKQ9NX55 129 aa39.43■■■■□ 3.9
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CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF831Q5JPB2 1677 aa39.43■■■■□ 3.9
CAPNS1-206ENST00000588815 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa39.43■■■■□ 3.9
CAPNS1-206ENST00000588815 G2E3Q7L622 706 aa39.42■■■■□ 3.9
CAPNS1-206ENST00000588815 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP39.42■■■■□ 3.9
CAPNS1-206ENST00000588815 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP39.4■■■■□ 3.9
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM57Q8N5G2 664 aa39.4■■■■□ 3.9
CAPNS1-206ENST00000588815 PXDNLA1KZ92 1463 aa39.39■■■■□ 3.9
CAPNS1-206ENST00000588815 ACSBG1Q96GR2 724 aa39.39■■■■□ 3.9
CAPNS1-206ENST00000588815 USP16Q9Y5T5 823 aa39.39■■■■□ 3.9
CAPNS1-206ENST00000588815 BTAF1O14981 1849 aa39.39■■■■□ 3.9
CAPNS1-206ENST00000588815 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP39.37■■■■□ 3.89
CAPNS1-206ENST00000588815 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP39.37■■■■□ 3.89
CAPNS1-206ENST00000588815 ITPRIPQ8IWB1 547 aa39.37■■■■□ 3.89
CAPNS1-206ENST00000588815 TJP1Q07157 1748 aa39.36■■■■□ 3.89
CAPNS1-206ENST00000588815 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP39.36■■■■□ 3.89
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CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC136Q96JN2 1154 aa39.34■■■■□ 3.89
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CAPNS1-206ENST00000588815 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP39.31■■■■□ 3.88
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CAPNS1-206ENST00000588815 STARD3NLO95772 234 aa39.29■■■■□ 3.88
CAPNS1-206ENST00000588815 KCNQ2O43526 872 aa39.28■■■■□ 3.88
CAPNS1-206ENST00000588815 DDX58O95786 925 aaKnown RBP39.28■■■■□ 3.88
CAPNS1-206ENST00000588815 PROSER3Q2NL68 480 aa39.28■■■■□ 3.88
CAPNS1-206ENST00000588815 KRT27Q7Z3Y8 459 aa39.27■■■■□ 3.88
CAPNS1-206ENST00000588815 PALLDQ8WX93 1383 aa39.27■■■■□ 3.88
CAPNS1-206ENST00000588815 ANXA1P04083 346 aa39.26■■■■□ 3.88
CAPNS1-206ENST00000588815 RXRBP28702 533 aa39.26■■■■□ 3.88
CAPNS1-206ENST00000588815 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa39.25■■■■□ 3.87
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM196AQ6ZSG2 479 aa39.24■■■■□ 3.87
CAPNS1-206ENST00000588815 LRP10Q7Z4F1 713 aa39.24■■■■□ 3.87
CAPNS1-206ENST00000588815 LY75O60449 1722 aa39.24■■■■□ 3.87
CAPNS1-206ENST00000588815 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP39.24■■■■□ 3.87
CAPNS1-206ENST00000588815 DNAJC10Q8IXB1 793 aa39.24■■■■□ 3.87
CAPNS1-206ENST00000588815 KSR2Q6VAB6 950 aa39.23■■■■□ 3.87
CAPNS1-206ENST00000588815 F6X3S4 739 aa39.22■■■■□ 3.87
CAPNS1-206ENST00000588815 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP39.22■■■■□ 3.87
CAPNS1-206ENST00000588815 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa39.22■■■■□ 3.87
CAPNS1-206ENST00000588815 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa39.22■■■■□ 3.87
CAPNS1-206ENST00000588815 RREB1Q92766 1687 aa39.22■■■■□ 3.87
CAPNS1-206ENST00000588815 ATP10DQ9P241 1426 aa39.21■■■■□ 3.87
CAPNS1-206ENST00000588815 MYL6BP14649 208 aa39.21■■■■□ 3.87
CAPNS1-206ENST00000588815 DNAAF4Q8WXU2 420 aa39.21■■■■□ 3.87
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC4A9Q96Q91 983 aa39.21■■■■□ 3.87
CAPNS1-206ENST00000588815 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa39.2■■■■□ 3.87
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CAPNS1-206ENST00000588815 SLC4A10Q6U841 1118 aa39.2■■■■□ 3.87
CAPNS1-206ENST00000588815 ADCY9O60503 1353 aa39.2■■■■□ 3.87
CAPNS1-206ENST00000588815 PI4KAP2A4QPH2 592 aa39.19■■■■□ 3.86
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CAPNS1-206ENST00000588815 NBPF14Q5TI25 921 aa39.17■■■■□ 3.86
CAPNS1-206ENST00000588815 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP39.17■■■■□ 3.86
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CAPNS1-206ENST00000588815 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP39.17■■■■□ 3.86
CAPNS1-206ENST00000588815 NUP188Q5SRE5 1749 aa39.17■■■■□ 3.86
CAPNS1-206ENST00000588815 A1BGP04217 495 aa39.17■■■■□ 3.86
CAPNS1-206ENST00000588815 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP39.17■■■■□ 3.86
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM182BQ5T319 152 aa39.17■■■■□ 3.86
CAPNS1-206ENST00000588815 COPS6Q7L5N1 327 aa39.17■■■■□ 3.86
CAPNS1-206ENST00000588815 XAGE3Q8WTP9 111 aa39.17■■■■□ 3.86
CAPNS1-206ENST00000588815 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP39.16■■■■□ 3.86
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CAPNS1-206ENST00000588815 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa39.13■■■■□ 3.85
CAPNS1-206ENST00000588815 TAF1LQ8IZX4 1826 aa39.13■■■■□ 3.85
CAPNS1-206ENST00000588815 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP39.12■■■■□ 3.85
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CAPNS1-206ENST00000588815 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa39.12■■■■□ 3.85
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CAPNS1-206ENST00000588815 BEND3Q5T5X7 828 aa39.1■■■■□ 3.85
CAPNS1-206ENST00000588815 ALDH1L1O75891 902 aa39.09■■■■□ 3.85
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CAPNS1-206ENST00000588815 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP39.06■■■■□ 3.84
CAPNS1-206ENST00000588815 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP39.05■■■■□ 3.84
CAPNS1-206ENST00000588815 PTF1AQ7RTS3 328 aa39.05■■■■□ 3.84
CAPNS1-206ENST00000588815 LINS1Q8NG48 757 aa39.05■■■■□ 3.84
CAPNS1-206ENST00000588815 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP39.05■■■■□ 3.84
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CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC87Q9NVE4 849 aa39.04■■■■□ 3.84
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