RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568810.5

PPP4C-213, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 2

Gene PPP4C, Length 1,080 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-213	ENST00000568810	ZPR1	O75312	459 aa		32.99	■■■□□ 2.87
PPP4C-213	ENST00000568810	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		32.99	■■■□□ 2.87
PPP4C-213	ENST00000568810	FKBP8	Q14318	412 aa		32.98	■■■□□ 2.87
PPP4C-213	ENST00000568810	MCM10	Q7L590	875 aa		32.98	■■■□□ 2.87
PPP4C-213	ENST00000568810	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	32.96	■■■□□ 2.87
PPP4C-213	ENST00000568810	TGFB2	P61812	414 aa		32.95	■■■□□ 2.87
PPP4C-213	ENST00000568810	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		32.95	■■■□□ 2.87
PPP4C-213	ENST00000568810	NARF	Q9UHQ1	456 aa		32.95	■■■□□ 2.87
PPP4C-213	ENST00000568810	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		32.94	■■■□□ 2.86
PPP4C-213	ENST00000568810	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	32.94	■■■□□ 2.86
PPP4C-213	ENST00000568810	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		32.94	■■■□□ 2.86
PPP4C-213	ENST00000568810	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	32.93	■■■□□ 2.86
PPP4C-213	ENST00000568810	DCTN1	Q14203	1278 aa		32.92	■■■□□ 2.86
PPP4C-213	ENST00000568810	KCNQ3	O43525	872 aa		32.91	■■■□□ 2.86
PPP4C-213	ENST00000568810	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	32.91	■■■□□ 2.86
PPP4C-213	ENST00000568810	DDR1	Q08345	913 aa		32.91	■■■□□ 2.86
PPP4C-213	ENST00000568810	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		32.91	■■■□□ 2.86
PPP4C-213	ENST00000568810	TM4SF1	P30408	202 aa		32.9	■■■□□ 2.86
PPP4C-213	ENST00000568810	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	32.9	■■■□□ 2.86
PPP4C-213	ENST00000568810		A0A087WZG4	1122 aa		32.89	■■■□□ 2.86
PPP4C-213	ENST00000568810	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		32.88	■■■□□ 2.85
PPP4C-213	ENST00000568810	NFE2L2	Q16236	605 aa		32.88	■■■□□ 2.85
PPP4C-213	ENST00000568810	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		32.88	■■■□□ 2.85
PPP4C-213	ENST00000568810	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	32.87	■■■□□ 2.85
PPP4C-213	ENST00000568810	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	32.87	■■■□□ 2.85
PPP4C-213	ENST00000568810	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		32.87	■■■□□ 2.85
PPP4C-213	ENST00000568810	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	32.86	■■■□□ 2.85
PPP4C-213	ENST00000568810	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	32.86	■■■□□ 2.85
PPP4C-213	ENST00000568810		A0A0G2JLW4	131 aa		32.85	■■■□□ 2.85
PPP4C-213	ENST00000568810	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		32.84	■■■□□ 2.85
PPP4C-213	ENST00000568810	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	32.83	■■■□□ 2.85
PPP4C-213	ENST00000568810	NFIX	Q14938	502 aa		32.83	■■■□□ 2.85
PPP4C-213	ENST00000568810	A1BG	P04217	495 aa		32.82	■■■□□ 2.84
PPP4C-213	ENST00000568810	DPEP1	P16444	411 aa		32.82	■■■□□ 2.84
PPP4C-213	ENST00000568810	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	32.82	■■■□□ 2.84
PPP4C-213	ENST00000568810	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	32.82	■■■□□ 2.84
PPP4C-213	ENST00000568810	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	32.81	■■■□□ 2.84
PPP4C-213	ENST00000568810	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	32.81	■■■□□ 2.84
PPP4C-213	ENST00000568810	USP16	Q9Y5T5	823 aa		32.81	■■■□□ 2.84
PPP4C-213	ENST00000568810	SCN7A	Q01118	1682 aa		32.79	■■■□□ 2.84
PPP4C-213	ENST00000568810	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	32.78	■■■□□ 2.84
PPP4C-213	ENST00000568810	BCS1L	Q9Y276	419 aa		32.78	■■■□□ 2.84
PPP4C-213	ENST00000568810	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		32.77	■■■□□ 2.84
PPP4C-213	ENST00000568810	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		32.77	■■■□□ 2.84
PPP4C-213	ENST00000568810	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		32.77	■■■□□ 2.84
PPP4C-213	ENST00000568810	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	32.77	■■■□□ 2.84
PPP4C-213	ENST00000568810	KCNA3	P22001	575 aa		32.76	■■■□□ 2.83
PPP4C-213	ENST00000568810	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		32.76	■■■□□ 2.83
PPP4C-213	ENST00000568810	SERPINB2	P05120	415 aa		32.75	■■■□□ 2.83
PPP4C-213	ENST00000568810	PIM2	Q9P1W9	311 aa		32.75	■■■□□ 2.83
PPP4C-213	ENST00000568810	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		32.75	■■■□□ 2.83
PPP4C-213	ENST00000568810	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	32.74	■■■□□ 2.83
PPP4C-213	ENST00000568810	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	32.73	■■■□□ 2.83
PPP4C-213	ENST00000568810	CAMTA2	O94983	1202 aa		32.71	■■■□□ 2.83
PPP4C-213	ENST00000568810	RIPK4	P57078	832 aa		32.71	■■■□□ 2.83
PPP4C-213	ENST00000568810	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		32.71	■■■□□ 2.83
PPP4C-213	ENST00000568810	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		32.71	■■■□□ 2.83
PPP4C-213	ENST00000568810	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	32.71	■■■□□ 2.83
PPP4C-213	ENST00000568810	ADCY9	O60503	1353 aa		32.7	■■■□□ 2.83
PPP4C-213	ENST00000568810	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	32.7	■■■□□ 2.83	1e-7	■■□□□ 13.3
PPP4C-213	ENST00000568810	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		32.7	■■■□□ 2.82
PPP4C-213	ENST00000568810	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		32.69	■■■□□ 2.82
PPP4C-213	ENST00000568810	CHRNA5	P30532	468 aa		32.69	■■■□□ 2.82
PPP4C-213	ENST00000568810	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	32.69	■■■□□ 2.82
PPP4C-213	ENST00000568810	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	32.69	■■■□□ 2.82
PPP4C-213	ENST00000568810	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		32.69	■■■□□ 2.82
PPP4C-213	ENST00000568810	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	32.69	■■■□□ 2.82
PPP4C-213	ENST00000568810	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		32.69	■■■□□ 2.82
PPP4C-213	ENST00000568810	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		32.69	■■■□□ 2.82
PPP4C-213	ENST00000568810	ATP10D	Q9P241	1426 aa		32.68	■■■□□ 2.82
PPP4C-213	ENST00000568810	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	32.67	■■■□□ 2.82
PPP4C-213	ENST00000568810	NBPF26	B4DH59	902 aa		32.66	■■■□□ 2.82
PPP4C-213	ENST00000568810	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	32.66	■■■□□ 2.82
PPP4C-213	ENST00000568810	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	32.66	■■■□□ 2.82
PPP4C-213	ENST00000568810	NBPF15	Q8N660	670 aa		32.66	■■■□□ 2.82
PPP4C-213	ENST00000568810	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		32.65	■■■□□ 2.82
PPP4C-213	ENST00000568810	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		32.65	■■■□□ 2.82
PPP4C-213	ENST00000568810	SETDB2	Q96T68	719 aa		32.65	■■■□□ 2.82
PPP4C-213	ENST00000568810	RUNDC1	Q96C34	613 aa		32.64	■■■□□ 2.82
PPP4C-213	ENST00000568810	RGL2	O15211	777 aa		32.63	■■■□□ 2.81
PPP4C-213	ENST00000568810	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		32.63	■■■□□ 2.81
PPP4C-213	ENST00000568810	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		32.63	■■■□□ 2.81
PPP4C-213	ENST00000568810	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		32.62	■■■□□ 2.81
PPP4C-213	ENST00000568810	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		32.62	■■■□□ 2.81
PPP4C-213	ENST00000568810	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		32.61	■■■□□ 2.81
PPP4C-213	ENST00000568810	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		32.61	■■■□□ 2.81
PPP4C-213	ENST00000568810	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		32.6	■■■□□ 2.81
PPP4C-213	ENST00000568810		H0YIN7	160 aa		32.59	■■■□□ 2.81
PPP4C-213	ENST00000568810	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		32.59	■■■□□ 2.81
PPP4C-213	ENST00000568810	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		32.59	■■■□□ 2.81
PPP4C-213	ENST00000568810	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		32.59	■■■□□ 2.81
PPP4C-213	ENST00000568810	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	32.59	■■■□□ 2.81
PPP4C-213	ENST00000568810	CNBD1	Q8NA66	436 aa		32.58	■■■□□ 2.81
PPP4C-213	ENST00000568810	PDE6B	P35913	854 aa		32.57	■■■□□ 2.8
PPP4C-213	ENST00000568810	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	32.57	■■■□□ 2.8
PPP4C-213	ENST00000568810	NPHP1	O15259	732 aa		32.56	■■■□□ 2.8
PPP4C-213	ENST00000568810	NEUROD2	Q15784	382 aa		32.56	■■■□□ 2.8
PPP4C-213	ENST00000568810	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		32.56	■■■□□ 2.8
PPP4C-213	ENST00000568810	TTLL6	Q8N841	843 aa		32.55	■■■□□ 2.8
PPP4C-213	ENST00000568810	C1QTNF8	P60827	252 aa		32.54	■■■□□ 2.8

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