RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.63■■□□□ 1.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 MMP10P09238 476 aa22.63■■□□□ 1.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 NLGN2Q8NFZ4 835 aa22.63■■□□□ 1.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa22.61■■□□□ 1.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 COL15A1P39059 1388 aa22.61■■□□□ 1.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 DLG5Q8TDM6 1919 aa22.61■■□□□ 1.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZPR1O75312 459 aa22.6■■□□□ 1.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 DCTN1Q14203 1278 aa22.59■■□□□ 1.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.58■■□□□ 1.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 NARFQ9UHQ1 456 aa22.58■■□□□ 1.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 PARP3Q9Y6F1 533 aa22.58■■□□□ 1.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 A0A087WZG4 1122 aa22.57■■□□□ 1.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 GRIN3BO60391 1043 aa22.57■■□□□ 1.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 KIF13BQ9NQT8 1826 aa22.57■■□□□ 1.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 KCNQ3O43525 872 aa22.56■■□□□ 1.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 EIF5P55010 431 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 C10orf71Q711Q0 1435 aa22.56■■□□□ 1.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP22.55■■□□□ 1.21e-6■□□□□ 9
CCNDBP1-211ENST00000567434 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.55■■□□□ 1.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 FKBP8Q14318 412 aa22.55■■□□□ 1.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.54■■□□□ 1.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 TGFB2P61812 414 aa22.53■■□□□ 1.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 TM4SF1P30408 202 aa22.52■■□□□ 1.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 KDM3BQ7LBC6 1761 aa22.52■■□□□ 1.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMPOP42166 694 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
CCNDBP1-211ENST00000567434 RIPK4P57078 832 aa22.51■■□□□ 1.19
CCNDBP1-211ENST00000567434 RUNDC1Q96C34 613 aa22.51■■□□□ 1.19
CCNDBP1-211ENST00000567434 USP16Q9Y5T5 823 aa22.5■■□□□ 1.19
CCNDBP1-211ENST00000567434 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.49■■□□□ 1.19
CCNDBP1-211ENST00000567434 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
CCNDBP1-211ENST00000567434 A1BGP04217 495 aa22.49■■□□□ 1.19
CCNDBP1-211ENST00000567434 DDR1Q08345 913 aa22.49■■□□□ 1.19
CCNDBP1-211ENST00000567434 BABAM1Q9NWV8 329 aa22.49■■□□□ 1.19
CCNDBP1-211ENST00000567434 SCN7AQ01118 1682 aa22.49■■□□□ 1.19
CCNDBP1-211ENST00000567434 CEP350Q5VT06 3117 aa22.48■■□□□ 1.19
CCNDBP1-211ENST00000567434 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.48■■□□□ 1.19
CCNDBP1-211ENST00000567434 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.48■■□□□ 1.19
CCNDBP1-211ENST00000567434 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa22.48■■□□□ 1.19
CCNDBP1-211ENST00000567434 LAMB4A4D0S4 1761 aa22.48■■□□□ 1.19
CCNDBP1-211ENST00000567434 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
CCNDBP1-211ENST00000567434 MIS18AQ9NYP9 233 aa22.47■■□□□ 1.19
CCNDBP1-211ENST00000567434 NFIXQ14938 502 aa22.46■■□□□ 1.19
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.46■■□□□ 1.19
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.45■■□□□ 1.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 RGL2O15211 777 aa22.45■■□□□ 1.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 NRXN2Q9P2S2 1712 aa22.45■■□□□ 1.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 TSPYL4Q9UJ04 414 aa22.44■■□□□ 1.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 ATP10DQ9P241 1426 aa22.43■■□□□ 1.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa22.43■■□□□ 1.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 BCORQ6W2J9 1755 aa22.43■■□□□ 1.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 CAMTA2O94983 1202 aa22.42■■□□□ 1.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 CARMIL3Q8ND23 1372 aa22.41■■□□□ 1.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 A0A0G2JLW4 131 aa22.41■■□□□ 1.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 SERPINB2P05120 415 aa22.41■■□□□ 1.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 DPEP1P16444 411 aa22.41■■□□□ 1.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.41■■□□□ 1.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 NBPF26B4DH59 902 aa22.4■■□□□ 1.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 NEUROD2Q15784 382 aa22.4■■□□□ 1.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 NBPF15Q8N660 670 aa22.4■■□□□ 1.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22.4■■□□□ 1.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 ERBB4Q15303 1308 aa22.39■■□□□ 1.18
CCNDBP1-211ENST00000567434 ANP32CO43423 234 aa22.39■■□□□ 1.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22.39■■□□□ 1.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRIM35Q9UPQ4 493 aa22.39■■□□□ 1.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 SETDB2Q96T68 719 aa22.38■■□□□ 1.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 PIM2Q9P1W9 311 aa22.38■■□□□ 1.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 ADCY9O60503 1353 aa22.38■■□□□ 1.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 KCNA3P22001 575 aa22.37■■□□□ 1.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 BICDL1Q6ZP65 573 aa22.37■■□□□ 1.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 CHL1O00533 1208 aa22.36■■□□□ 1.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa22.36■■□□□ 1.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 BCS1LQ9Y276 419 aa22.36■■□□□ 1.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 WWC3Q9ULE0 1092 aa22.35■■□□□ 1.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa22.34■■□□□ 1.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 APAF1O14727 1248 aa22.33■■□□□ 1.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
CCNDBP1-211ENST00000567434 ERVV-1B6SEH8 477 aa22.32■■□□□ 1.16
CCNDBP1-211ENST00000567434 CHRNA5P30532 468 aa22.32■■□□□ 1.16
CCNDBP1-211ENST00000567434 CNBD1Q8NA66 436 aa22.32■■□□□ 1.16
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