RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564630.5

CCNDBP1-205, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 2,079 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-205ENST00000564630 IGSF1Q8N6C5 1336 aa25.04■■□□□ 1.6
CCNDBP1-205ENST00000564630 NLRP2Q9NX02 1062 aa25.04■■□□□ 1.6
CCNDBP1-205ENST00000564630 MIS18AQ9NYP9 233 aa25.04■■□□□ 1.6
CCNDBP1-205ENST00000564630 LRRC37A3O60309 1634 aa25.04■■□□□ 1.6
CCNDBP1-205ENST00000564630 MEIS3Q99687 375 aa25.03■■□□□ 1.6
CCNDBP1-205ENST00000564630 TSPYL4Q9UJ04 414 aa25.03■■□□□ 1.6
CCNDBP1-205ENST00000564630 RRP9O43818 475 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
CCNDBP1-205ENST00000564630 RAB3GAP1Q15042 981 aa25.02■■□□□ 1.6
CCNDBP1-205ENST00000564630 EYA1Q99502 592 aa25.02■■□□□ 1.6
CCNDBP1-205ENST00000564630 CLEC17AQ6ZS10 378 aa25.01■■□□□ 1.59
CCNDBP1-205ENST00000564630 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
CCNDBP1-205ENST00000564630 GAS2L2Q8NHY3 880 aa25.01■■□□□ 1.59
CCNDBP1-205ENST00000564630 GBP4Q96PP9 640 aa25.01■■□□□ 1.59
CCNDBP1-205ENST00000564630 BRWD3Q6RI45 1802 aa25.01■■□□□ 1.59
CCNDBP1-205ENST00000564630 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa25.01■■□□□ 1.59
CCNDBP1-205ENST00000564630 SEPT12Q8IYM1 358 aa25.01■■□□□ 1.59
CCNDBP1-205ENST00000564630 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
CCNDBP1-205ENST00000564630 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
CCNDBP1-205ENST00000564630 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
CCNDBP1-205ENST00000564630 ESPNB1AK53 854 aa25■■□□□ 1.59
CCNDBP1-205ENST00000564630 CARD10Q9BWT7 1032 aa25■■□□□ 1.59
CCNDBP1-205ENST00000564630 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
CCNDBP1-205ENST00000564630 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa25■■□□□ 1.59
CCNDBP1-205ENST00000564630 WNK3Q9BYP7 1800 aa24.99■■□□□ 1.59
CCNDBP1-205ENST00000564630 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
CCNDBP1-205ENST00000564630 G2E3Q7L622 706 aa24.98■■□□□ 1.59
CCNDBP1-205ENST00000564630 USHBP1Q8N6Y0 703 aa24.98■■□□□ 1.59
CCNDBP1-205ENST00000564630 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
CCNDBP1-205ENST00000564630 CACNA1FO60840 1977 aa24.97■■□□□ 1.59
CCNDBP1-205ENST00000564630 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
CCNDBP1-205ENST00000564630 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
CCNDBP1-205ENST00000564630 CCT4P50991 539 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
CCNDBP1-205ENST00000564630 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
CCNDBP1-205ENST00000564630 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
CCNDBP1-205ENST00000564630 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
CCNDBP1-205ENST00000564630 NBPF6Q5VWK0 638 aa24.96■■□□□ 1.59
CCNDBP1-205ENST00000564630 BARGINQ6ZT62 677 aa24.96■■□□□ 1.59
CCNDBP1-205ENST00000564630 NBPF4Q96M43 638 aa24.96■■□□□ 1.59
CCNDBP1-205ENST00000564630 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
CCNDBP1-205ENST00000564630 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
CCNDBP1-205ENST00000564630 HMMRO75330 724 aa24.95■■□□□ 1.58
CCNDBP1-205ENST00000564630 EP400Q96L91 3159 aa24.94■■□□□ 1.58
CCNDBP1-205ENST00000564630 F6X3S4 739 aa24.93■■□□□ 1.58
CCNDBP1-205ENST00000564630 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
CCNDBP1-205ENST00000564630 SLC4A10Q6U841 1118 aa24.93■■□□□ 1.58
CCNDBP1-205ENST00000564630 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
CCNDBP1-205ENST00000564630 SDSP20132 328 aa24.93■■□□□ 1.58
CCNDBP1-205ENST00000564630 APBB1O00213 710 aa24.92■■□□□ 1.58
CCNDBP1-205ENST00000564630 RABEP1Q15276 862 aa24.92■■□□□ 1.58
CCNDBP1-205ENST00000564630 STK31Q9BXU1 1019 aa24.92■■□□□ 1.58
CCNDBP1-205ENST00000564630 USP26Q9BXU7 913 aa24.92■■□□□ 1.58
CCNDBP1-205ENST00000564630 DISP2A7MBM2 1401 aa24.92■■□□□ 1.58
CCNDBP1-205ENST00000564630 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
CCNDBP1-205ENST00000564630 ERBB4Q15303 1308 aa24.91■■□□□ 1.58
CCNDBP1-205ENST00000564630 GNAT3A8MTJ3 354 aa24.91■■□□□ 1.58
CCNDBP1-205ENST00000564630 PPP1R9BQ96SB3 815 aa24.91■■□□□ 1.58
CCNDBP1-205ENST00000564630 FAM182BQ5T319 152 aa24.9■■□□□ 1.58
CCNDBP1-205ENST00000564630 CASC1Q6TDU7 716 aa24.9■■□□□ 1.58
CCNDBP1-205ENST00000564630 FOXD4L1Q9NU39 408 aa24.89■■□□□ 1.58
CCNDBP1-205ENST00000564630 TPM2P07951 284 aa24.89■■□□□ 1.57
CCNDBP1-205ENST00000564630 GAS2L3Q86XJ1 694 aa24.89■■□□□ 1.57
CCNDBP1-205ENST00000564630 GNAI2P04899 355 aa24.88■■□□□ 1.57
CCNDBP1-205ENST00000564630 CCDC30Q5VVM6 783 aa24.88■■□□□ 1.57
CCNDBP1-205ENST00000564630 KRT27Q7Z3Y8 459 aa24.88■■□□□ 1.57
CCNDBP1-205ENST00000564630 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa24.88■■□□□ 1.57
CCNDBP1-205ENST00000564630 MAP3K5Q99683 1374 aa24.88■■□□□ 1.57
CCNDBP1-205ENST00000564630 IL2RBP14784 551 aa24.87■■□□□ 1.57
CCNDBP1-205ENST00000564630 CCDC173Q0VFZ6 552 aa24.87■■□□□ 1.57
CCNDBP1-205ENST00000564630 OSBPL3Q9H4L5 887 aa24.87■■□□□ 1.57
CCNDBP1-205ENST00000564630 MEGF6O75095 1541 aa24.87■■□□□ 1.57
CCNDBP1-205ENST00000564630 FLIIQ13045 1269 aa24.87■■□□□ 1.57
CCNDBP1-205ENST00000564630 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
CCNDBP1-205ENST00000564630 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
CCNDBP1-205ENST00000564630 DDB1Q16531 1140 aa24.85■■□□□ 1.57
CCNDBP1-205ENST00000564630 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
CCNDBP1-205ENST00000564630 ARXQ96QS3 562 aa24.85■■□□□ 1.57
CCNDBP1-205ENST00000564630 BABAM1Q9NWV8 329 aa24.85■■□□□ 1.57
CCNDBP1-205ENST00000564630 IL17REQ8NFR9 667 aa24.84■■□□□ 1.57
CCNDBP1-205ENST00000564630 AK9Q5TCS8 1911 aa24.84■■□□□ 1.57
CCNDBP1-205ENST00000564630 PDE1AP54750 535 aa24.84■■□□□ 1.57
CCNDBP1-205ENST00000564630 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
CCNDBP1-205ENST00000564630 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
CCNDBP1-205ENST00000564630 GNAI3P08754 354 aa24.83■■□□□ 1.57
CCNDBP1-205ENST00000564630 KLHL40Q2TBA0 621 aa24.83■■□□□ 1.57
CCNDBP1-205ENST00000564630 REC8O95072 547 aa24.82■■□□□ 1.56
CCNDBP1-205ENST00000564630 TERF1P54274 439 aa24.82■■□□□ 1.56
CCNDBP1-205ENST00000564630 NCAPD2Q15021 1401 aa24.82■■□□□ 1.56
CCNDBP1-205ENST00000564630 PXDNLA1KZ92 1463 aa24.82■■□□□ 1.56
CCNDBP1-205ENST00000564630 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
CCNDBP1-205ENST00000564630 TNS2Q63HR2 1409 aa24.82■■□□□ 1.56
CCNDBP1-205ENST00000564630 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa24.81■■□□□ 1.56
CCNDBP1-205ENST00000564630 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa24.81■■□□□ 1.56
CCNDBP1-205ENST00000564630 GOLGA6L22H0YM25 854 aa24.8■■□□□ 1.56
CCNDBP1-205ENST00000564630 EXOC5O00471 708 aa24.8■■□□□ 1.56
CCNDBP1-205ENST00000564630 ERC2O15083 957 aa24.8■■□□□ 1.56
CCNDBP1-205ENST00000564630 SSFA2P28290 1259 aa24.8■■□□□ 1.56
CCNDBP1-205ENST00000564630 NECTIN2Q92692 538 aa24.8■■□□□ 1.56
CCNDBP1-205ENST00000564630 SALL3Q9BXA9 1300 aa24.8■■□□□ 1.56
CCNDBP1-205ENST00000564630 ATP8B2P98198 1209 aa24.79■■□□□ 1.56
CCNDBP1-205ENST00000564630 HS1BP3Q53T59 392 aa24.79■■□□□ 1.56
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