RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557444.5

AFG3L1P-217, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, humanhuman

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Gene AFG3L1P, Length 2,447 nt, Biotype transcribed unitary pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L1P-217ENST00000557444 TEFQ10587 303 aa24.4■■□□□ 1.5
AFG3L1P-217ENST00000557444 LMBRD1Q9NUN5 540 aa24.4■■□□□ 1.5
AFG3L1P-217ENST00000557444 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
AFG3L1P-217ENST00000557444 NCLP19338 710 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.5
AFG3L1P-217ENST00000557444 BEND3Q5T5X7 828 aa24.39■■□□□ 1.5
AFG3L1P-217ENST00000557444 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
AFG3L1P-217ENST00000557444 POLA2Q14181 598 aa24.39■■□□□ 1.49
AFG3L1P-217ENST00000557444 LMOD2Q6P5Q4 547 aa24.39■■□□□ 1.49
AFG3L1P-217ENST00000557444 DNAAF4Q8WXU2 420 aa24.39■■□□□ 1.49
AFG3L1P-217ENST00000557444 RHPN1Q8TCX5 695 aa24.38■■□□□ 1.49
AFG3L1P-217ENST00000557444 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
AFG3L1P-217ENST00000557444 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
AFG3L1P-217ENST00000557444 PXDNQ92626 1479 aa24.36■■□□□ 1.49
AFG3L1P-217ENST00000557444 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa24.36■■□□□ 1.49
AFG3L1P-217ENST00000557444 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
AFG3L1P-217ENST00000557444 AKAP4Q5JQC9 854 aa24.36■■□□□ 1.49
AFG3L1P-217ENST00000557444 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
AFG3L1P-217ENST00000557444 KCNH5Q8NCM2 988 aa24.36■■□□□ 1.49
AFG3L1P-217ENST00000557444 KDM3BQ7LBC6 1761 aa24.36■■□□□ 1.49
AFG3L1P-217ENST00000557444 PI4K2BQ8TCG2 481 aa24.35■■□□□ 1.49
AFG3L1P-217ENST00000557444 ADCY9O60503 1353 aa24.35■■□□□ 1.49
AFG3L1P-217ENST00000557444 GCP02774 474 aa24.35■■□□□ 1.49
AFG3L1P-217ENST00000557444 MCCP23508 829 aa24.35■■□□□ 1.49
AFG3L1P-217ENST00000557444 PROSER3Q2NL68 480 aa24.35■■□□□ 1.49
AFG3L1P-217ENST00000557444 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa24.34■■□□□ 1.49
AFG3L1P-217ENST00000557444 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
AFG3L1P-217ENST00000557444 RAB11FIP3O75154 756 aa24.33■■□□□ 1.48
AFG3L1P-217ENST00000557444 RNMTO43148 476 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
AFG3L1P-217ENST00000557444 HOXB7P09629 217 aa24.32■■□□□ 1.48
AFG3L1P-217ENST00000557444 GPT2Q8TD30 523 aa24.32■■□□□ 1.48
AFG3L1P-217ENST00000557444 AXIN2Q9Y2T1 843 aa24.32■■□□□ 1.48
AFG3L1P-217ENST00000557444 ARHGEF25Q86VW2 580 aa24.31■■□□□ 1.48
AFG3L1P-217ENST00000557444 KIF1BPQ96EK5 621 aa24.31■■□□□ 1.48
AFG3L1P-217ENST00000557444 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
AFG3L1P-217ENST00000557444 AOX1Q06278 1338 aa24.31■■□□□ 1.48
AFG3L1P-217ENST00000557444 ERBB4Q15303 1308 aa24.31■■□□□ 1.48
AFG3L1P-217ENST00000557444 ANAPC15P60006 121 aa24.3■■□□□ 1.48
AFG3L1P-217ENST00000557444 ANKRD24Q8TF21 1146 aa24.3■■□□□ 1.48
AFG3L1P-217ENST00000557444 LMO7Q8WWI1 1683 aa24.3■■□□□ 1.48
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa24.3■■□□□ 1.48
AFG3L1P-217ENST00000557444 C1orf141Q5JVX7 400 aa24.3■■□□□ 1.48
AFG3L1P-217ENST00000557444 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa24.3■■□□□ 1.48
AFG3L1P-217ENST00000557444 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
AFG3L1P-217ENST00000557444 CUL4AQ13619 759 aa24.29■■□□□ 1.48
AFG3L1P-217ENST00000557444 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
AFG3L1P-217ENST00000557444 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
AFG3L1P-217ENST00000557444 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
AFG3L1P-217ENST00000557444 NASPP49321 788 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
AFG3L1P-217ENST00000557444 MCM2P49736 904 aa24.27■■□□□ 1.48
AFG3L1P-217ENST00000557444 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
AFG3L1P-217ENST00000557444 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
AFG3L1P-217ENST00000557444 HSPA4P34932 840 aa24.27■■□□□ 1.48
AFG3L1P-217ENST00000557444 AMOTQ4VCS5 1084 aa24.26■■□□□ 1.47
AFG3L1P-217ENST00000557444 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
AFG3L1P-217ENST00000557444 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
AFG3L1P-217ENST00000557444 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
AFG3L1P-217ENST00000557444 SGSM2O43147 1006 aa24.25■■□□□ 1.47
AFG3L1P-217ENST00000557444 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
AFG3L1P-217ENST00000557444 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
AFG3L1P-217ENST00000557444 SPG7Q9UQ90 795 aa24.25■■□□□ 1.47
AFG3L1P-217ENST00000557444 BRD1O95696 1058 aa24.24■■□□□ 1.47
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZNF445P59923 1031 aa24.24■■□□□ 1.47
AFG3L1P-217ENST00000557444 CLCN1P35523 988 aa24.24■■□□□ 1.47
AFG3L1P-217ENST00000557444 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
AFG3L1P-217ENST00000557444 ESPNB1AK53 854 aa24.23■■□□□ 1.47
AFG3L1P-217ENST00000557444 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
AFG3L1P-217ENST00000557444 RASEFQ8IZ41 740 aa24.23■■□□□ 1.47
AFG3L1P-217ENST00000557444 CNTROBQ8N137 903 aa24.23■■□□□ 1.47
AFG3L1P-217ENST00000557444 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
AFG3L1P-217ENST00000557444 RAD50Q92878 1312 aa24.23■■□□□ 1.47
AFG3L1P-217ENST00000557444 TMEM63CQ9P1W3 806 aa24.23■■□□□ 1.47
AFG3L1P-217ENST00000557444 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
AFG3L1P-217ENST00000557444 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
AFG3L1P-217ENST00000557444 KSR2Q6VAB6 950 aa24.22■■□□□ 1.47
AFG3L1P-217ENST00000557444 IL17RAQ96F46 866 aa24.22■■□□□ 1.47
AFG3L1P-217ENST00000557444 SNX14Q9Y5W7 946 aa24.22■■□□□ 1.47
AFG3L1P-217ENST00000557444 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
AFG3L1P-217ENST00000557444 RBSNQ9H1K0 784 aa24.21■■□□□ 1.47
AFG3L1P-217ENST00000557444 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
AFG3L1P-217ENST00000557444 CPA1P15085 419 aa24.2■■□□□ 1.46
AFG3L1P-217ENST00000557444 SLC39A6Q13433 755 aa24.2■■□□□ 1.46
AFG3L1P-217ENST00000557444 HEG1Q9ULI3 1381 aa24.2■■□□□ 1.46
AFG3L1P-217ENST00000557444 MTX1Q13505 466 aa24.2■■□□□ 1.46
AFG3L1P-217ENST00000557444 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa24.2■■□□□ 1.46
AFG3L1P-217ENST00000557444 KRT28Q7Z3Y7 464 aa24.2■■□□□ 1.46
AFG3L1P-217ENST00000557444 CHMP4AQ9BY43 222 aa24.2■■□□□ 1.46
AFG3L1P-217ENST00000557444 SLIT3O75094 1523 aa24.19■■□□□ 1.46
AFG3L1P-217ENST00000557444 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
AFG3L1P-217ENST00000557444 NCAPD2Q15021 1401 aa24.19■■□□□ 1.46
AFG3L1P-217ENST00000557444 RGPD5Q99666 1765 aa24.19■■□□□ 1.46
AFG3L1P-217ENST00000557444 DTNBO60941 627 aa24.19■■□□□ 1.46
AFG3L1P-217ENST00000557444 GDPD2Q9HCC8 539 aa24.19■■□□□ 1.46
AFG3L1P-217ENST00000557444 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
AFG3L1P-217ENST00000557444 KAZALD1Q96I82 304 aa24.18■■□□□ 1.46
AFG3L1P-217ENST00000557444 SUCLG2Q96I99 432 aa24.18■■□□□ 1.46
AFG3L1P-217ENST00000557444 SYCE3A1L190 88 aa24.18■■□□□ 1.46
AFG3L1P-217ENST00000557444 ALDH1L1O75891 902 aa24.17■■□□□ 1.46
AFG3L1P-217ENST00000557444 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
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