RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555542.5

PRKCH-216, Transcript of protein kinase C eta, human

TSL 4

Gene PRKCH, Length 521 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCH-216	ENST00000555542	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		32.5	■■■□□ 2.79
PRKCH-216	ENST00000555542	MCM10	Q7L590	875 aa		32.5	■■■□□ 2.79
PRKCH-216	ENST00000555542	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		32.5	■■■□□ 2.79
PRKCH-216	ENST00000555542	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	32.5	■■■□□ 2.79
PRKCH-216	ENST00000555542	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		32.49	■■■□□ 2.79
PRKCH-216	ENST00000555542	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	32.48	■■■□□ 2.79
PRKCH-216	ENST00000555542	TGFB2	P61812	414 aa		32.47	■■■□□ 2.79
PRKCH-216	ENST00000555542	RALBP1	Q15311	655 aa		32.47	■■■□□ 2.79
PRKCH-216	ENST00000555542	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	32.47	■■■□□ 2.79
PRKCH-216	ENST00000555542	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		32.46	■■■□□ 2.79
PRKCH-216	ENST00000555542	DCTN1	Q14203	1278 aa		32.45	■■■□□ 2.79
PRKCH-216	ENST00000555542	NARF	Q9UHQ1	456 aa		32.45	■■■□□ 2.79
PRKCH-216	ENST00000555542	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	32.45	■■■□□ 2.79
PRKCH-216	ENST00000555542	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	32.44	■■■□□ 2.78
PRKCH-216	ENST00000555542		A0A0G2JLW4	131 aa		32.43	■■■□□ 2.78
PRKCH-216	ENST00000555542	KCNQ3	O43525	872 aa		32.43	■■■□□ 2.78
PRKCH-216	ENST00000555542	DDR1	Q08345	913 aa		32.43	■■■□□ 2.78
PRKCH-216	ENST00000555542	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	32.43	■■■□□ 2.78
PRKCH-216	ENST00000555542	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	32.42	■■■□□ 2.78
PRKCH-216	ENST00000555542	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		32.42	■■■□□ 2.78
PRKCH-216	ENST00000555542	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		32.42	■■■□□ 2.78
PRKCH-216	ENST00000555542		A0A087WZG4	1122 aa		32.41	■■■□□ 2.78
PRKCH-216	ENST00000555542	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		32.39	■■■□□ 2.78
PRKCH-216	ENST00000555542	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	32.39	■■■□□ 2.78
PRKCH-216	ENST00000555542	DPEP1	P16444	411 aa		32.39	■■■□□ 2.78
PRKCH-216	ENST00000555542	BCS1L	Q9Y276	419 aa		32.39	■■■□□ 2.78
PRKCH-216	ENST00000555542	TM4SF1	P30408	202 aa		32.38	■■■□□ 2.77
PRKCH-216	ENST00000555542	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	32.38	■■■□□ 2.77
PRKCH-216	ENST00000555542	NFIX	Q14938	502 aa		32.36	■■■□□ 2.77
PRKCH-216	ENST00000555542	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		32.36	■■■□□ 2.77
PRKCH-216	ENST00000555542	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	32.35	■■■□□ 2.77
PRKCH-216	ENST00000555542	A1BG	P04217	495 aa		32.35	■■■□□ 2.77
PRKCH-216	ENST00000555542	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	32.35	■■■□□ 2.77
PRKCH-216	ENST00000555542	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	32.35	■■■□□ 2.77
PRKCH-216	ENST00000555542	NFE2L2	Q16236	605 aa		32.34	■■■□□ 2.77
PRKCH-216	ENST00000555542	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		32.34	■■■□□ 2.77
PRKCH-216	ENST00000555542	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	32.33	■■■□□ 2.77
PRKCH-216	ENST00000555542	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		32.33	■■■□□ 2.77
PRKCH-216	ENST00000555542	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		32.32	■■■□□ 2.76
PRKCH-216	ENST00000555542	USP16	Q9Y5T5	823 aa		32.32	■■■□□ 2.76
PRKCH-216	ENST00000555542	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	32.32	■■■□□ 2.76
PRKCH-216	ENST00000555542	SCN7A	Q01118	1682 aa		32.31	■■■□□ 2.76
PRKCH-216	ENST00000555542	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		32.3	■■■□□ 2.76
PRKCH-216	ENST00000555542	SERPINB2	P05120	415 aa		32.3	■■■□□ 2.76
PRKCH-216	ENST00000555542	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	32.3	■■■□□ 2.76
PRKCH-216	ENST00000555542	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		32.3	■■■□□ 2.76
PRKCH-216	ENST00000555542	PIM2	Q9P1W9	311 aa		32.3	■■■□□ 2.76
PRKCH-216	ENST00000555542	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	32.29	■■■□□ 2.76
PRKCH-216	ENST00000555542	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	32.28	■■■□□ 2.76
PRKCH-216	ENST00000555542	ATP10D	Q9P241	1426 aa		32.27	■■■□□ 2.76
PRKCH-216	ENST00000555542	CHRNA5	P30532	468 aa		32.27	■■■□□ 2.76
PRKCH-216	ENST00000555542	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		32.27	■■■□□ 2.76
PRKCH-216	ENST00000555542	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	32.26	■■■□□ 2.75
PRKCH-216	ENST00000555542	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		32.26	■■■□□ 2.75
PRKCH-216	ENST00000555542	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	32.25	■■■□□ 2.75
PRKCH-216	ENST00000555542	KCNA3	P22001	575 aa		32.25	■■■□□ 2.75
PRKCH-216	ENST00000555542	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	32.25	■■■□□ 2.75
PRKCH-216	ENST00000555542	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		32.25	■■■□□ 2.75
PRKCH-216	ENST00000555542	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	32.25	■■■□□ 2.75
PRKCH-216	ENST00000555542	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		32.23	■■■□□ 2.75
PRKCH-216	ENST00000555542	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	32.23	■■■□□ 2.75
PRKCH-216	ENST00000555542	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		32.23	■■■□□ 2.75
PRKCH-216	ENST00000555542	NPHP1	O15259	732 aa		32.22	■■■□□ 2.75
PRKCH-216	ENST00000555542	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	32.22	■■■□□ 2.75
PRKCH-216	ENST00000555542	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		32.22	■■■□□ 2.75
PRKCH-216	ENST00000555542	RIPK4	P57078	832 aa		32.21	■■■□□ 2.75
PRKCH-216	ENST00000555542	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		32.21	■■■□□ 2.75
PRKCH-216	ENST00000555542	ADCY9	O60503	1353 aa		32.2	■■■□□ 2.75
PRKCH-216	ENST00000555542	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		32.2	■■■□□ 2.75
PRKCH-216	ENST00000555542	CAMTA2	O94983	1202 aa		32.2	■■■□□ 2.75
PRKCH-216	ENST00000555542	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	32.2	■■■□□ 2.75
PRKCH-216	ENST00000555542	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	32.2	■■■□□ 2.75
PRKCH-216	ENST00000555542	SETDB2	Q96T68	719 aa		32.19	■■■□□ 2.74
PRKCH-216	ENST00000555542	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		32.18	■■■□□ 2.74
PRKCH-216	ENST00000555542	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		32.18	■■■□□ 2.74
PRKCH-216	ENST00000555542	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		32.17	■■■□□ 2.74
PRKCH-216	ENST00000555542	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		32.16	■■■□□ 2.74
PRKCH-216	ENST00000555542		H0YIN7	160 aa		32.15	■■■□□ 2.74
PRKCH-216	ENST00000555542	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	32.15	■■■□□ 2.74
PRKCH-216	ENST00000555542	C1QTNF8	P60827	252 aa		32.15	■■■□□ 2.74
PRKCH-216	ENST00000555542	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	32.15	■■■□□ 2.74
PRKCH-216	ENST00000555542	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	32.15	■■■□□ 2.74
PRKCH-216	ENST00000555542	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		32.15	■■■□□ 2.74
PRKCH-216	ENST00000555542	NBPF26	B4DH59	902 aa		32.14	■■■□□ 2.74
PRKCH-216	ENST00000555542	NEUROD2	Q15784	382 aa		32.14	■■■□□ 2.74
PRKCH-216	ENST00000555542	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	32.14	■■■□□ 2.74
PRKCH-216	ENST00000555542	NBPF15	Q8N660	670 aa		32.14	■■■□□ 2.74
PRKCH-216	ENST00000555542	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	32.14	■■■□□ 2.74
PRKCH-216	ENST00000555542	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		32.14	■■■□□ 2.74
PRKCH-216	ENST00000555542	CNBD1	Q8NA66	436 aa		32.13	■■■□□ 2.73
PRKCH-216	ENST00000555542	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		32.12	■■■□□ 2.73
PRKCH-216	ENST00000555542	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		32.12	■■■□□ 2.73
PRKCH-216	ENST00000555542	PDE6B	P35913	854 aa		32.11	■■■□□ 2.73
PRKCH-216	ENST00000555542	ST5	P78524	1137 aa		32.11	■■■□□ 2.73
PRKCH-216	ENST00000555542	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		32.11	■■■□□ 2.73
PRKCH-216	ENST00000555542	NGEF	Q8N5V2	710 aa		32.11	■■■□□ 2.73
PRKCH-216	ENST00000555542	TTLL6	Q8N841	843 aa		32.1	■■■□□ 2.73
PRKCH-216	ENST00000555542	RUNDC1	Q96C34	613 aa		32.1	■■■□□ 2.73
PRKCH-216	ENST00000555542	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		32.1	■■■□□ 2.73
PRKCH-216	ENST00000555542	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		32.09	■■■□□ 2.73

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