RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554698.5

SDR39U1-208, Transcript of short chain dehydrogenase/reductase family 39U member 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene SDR39U1, Length 1,364 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SDR39U1-208	ENST00000554698	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		27.88	■■■□□ 2.05
SDR39U1-208	ENST00000554698	RPS6KA4	O75676	772 aa		27.86	■■■□□ 2.05
SDR39U1-208	ENST00000554698	SSFA2	P28290	1259 aa		27.86	■■■□□ 2.05
SDR39U1-208	ENST00000554698	KRT24	Q2M2I5	525 aa		27.86	■■■□□ 2.05
SDR39U1-208	ENST00000554698	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
SDR39U1-208	ENST00000554698	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
SDR39U1-208	ENST00000554698	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		27.85	■■■□□ 2.05
SDR39U1-208	ENST00000554698	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		27.85	■■■□□ 2.05
SDR39U1-208	ENST00000554698	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
SDR39U1-208	ENST00000554698	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		27.85	■■■□□ 2.05
SDR39U1-208	ENST00000554698	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
SDR39U1-208	ENST00000554698	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
SDR39U1-208	ENST00000554698	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		27.83	■■■□□ 2.05
SDR39U1-208	ENST00000554698	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		27.83	■■■□□ 2.05
SDR39U1-208	ENST00000554698	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
SDR39U1-208	ENST00000554698	SMIM5	Q71RC9	77 aa		27.83	■■■□□ 2.05
SDR39U1-208	ENST00000554698	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		27.82	■■■□□ 2.04
SDR39U1-208	ENST00000554698	A1BG	P04217	495 aa		27.82	■■■□□ 2.04
SDR39U1-208	ENST00000554698	HOXB7	P09629	217 aa		27.82	■■■□□ 2.04
SDR39U1-208	ENST00000554698	ADRA2B	P18089	450 aa		27.82	■■■□□ 2.04
SDR39U1-208	ENST00000554698	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
SDR39U1-208	ENST00000554698	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
SDR39U1-208	ENST00000554698	PHF14	O94880	888 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SDR39U1-208	ENST00000554698	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	27.81	■■■□□ 2.04
SDR39U1-208	ENST00000554698	GOLGA2	Q08379	1002 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SDR39U1-208	ENST00000554698	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SDR39U1-208	ENST00000554698	CASZ1	Q86V15	1759 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SDR39U1-208	ENST00000554698	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		27.8	■■■□□ 2.04
SDR39U1-208	ENST00000554698	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		27.8	■■■□□ 2.04
SDR39U1-208	ENST00000554698	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	27.79	■■■□□ 2.04
SDR39U1-208	ENST00000554698	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		27.79	■■■□□ 2.04
SDR39U1-208	ENST00000554698	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		27.79	■■■□□ 2.04
SDR39U1-208	ENST00000554698	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
SDR39U1-208	ENST00000554698	NBPF26	B4DH59	902 aa		27.77	■■■□□ 2.04
SDR39U1-208	ENST00000554698	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
SDR39U1-208	ENST00000554698	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
SDR39U1-208	ENST00000554698	NBPF15	Q8N660	670 aa		27.77	■■■□□ 2.04
SDR39U1-208	ENST00000554698	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
SDR39U1-208	ENST00000554698	ERBB4	Q15303	1308 aa		27.77	■■■□□ 2.04
SDR39U1-208	ENST00000554698		E9PSI1	815 aa		27.76	■■■□□ 2.03
SDR39U1-208	ENST00000554698	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		27.76	■■■□□ 2.03
SDR39U1-208	ENST00000554698	COL15A1	P39059	1388 aa		27.76	■■■□□ 2.03
SDR39U1-208	ENST00000554698	SLFN5	Q08AF3	891 aa		27.75	■■■□□ 2.03
SDR39U1-208	ENST00000554698	MSH5	O43196	834 aa		27.74	■■■□□ 2.03
SDR39U1-208	ENST00000554698	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	27.74	■■■□□ 2.03
SDR39U1-208	ENST00000554698	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	27.74	■■■□□ 2.03
SDR39U1-208	ENST00000554698	TSPYL6	Q8N831	410 aa		27.74	■■■□□ 2.03
SDR39U1-208	ENST00000554698	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	27.73	■■■□□ 2.03
SDR39U1-208	ENST00000554698	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		27.73	■■■□□ 2.03
SDR39U1-208	ENST00000554698	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		27.73	■■■□□ 2.03
SDR39U1-208	ENST00000554698	RFC4	P35249	363 aa		27.72	■■■□□ 2.03
SDR39U1-208	ENST00000554698	PDIA6	Q15084	440 aa		27.72	■■■□□ 2.03
SDR39U1-208	ENST00000554698	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	27.72	■■■□□ 2.03
SDR39U1-208	ENST00000554698	MTFR1L	Q9H019	292 aa		27.72	■■■□□ 2.03
SDR39U1-208	ENST00000554698	ZBTB7A	O95365	584 aa		27.71	■■■□□ 2.03
SDR39U1-208	ENST00000554698	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	27.71	■■■□□ 2.03
SDR39U1-208	ENST00000554698	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		27.71	■■■□□ 2.03
SDR39U1-208	ENST00000554698		A0A087WZG4	1122 aa		27.7	■■■□□ 2.02
SDR39U1-208	ENST00000554698	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	27.7	■■■□□ 2.02
SDR39U1-208	ENST00000554698	NECTIN2	Q92692	538 aa		27.7	■■■□□ 2.02
SDR39U1-208	ENST00000554698	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	27.7	■■■□□ 2.02
SDR39U1-208	ENST00000554698	C4A	P0C0L4	1744 aa		27.69	■■■□□ 2.02
SDR39U1-208	ENST00000554698	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		27.69	■■■□□ 2.02
SDR39U1-208	ENST00000554698	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
SDR39U1-208	ENST00000554698	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		27.68	■■■□□ 2.02
SDR39U1-208	ENST00000554698	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	27.68	■■■□□ 2.02
SDR39U1-208	ENST00000554698	NARF	Q9UHQ1	456 aa		27.68	■■■□□ 2.02
SDR39U1-208	ENST00000554698	MYL6B	P14649	208 aa		27.67	■■■□□ 2.02
SDR39U1-208	ENST00000554698	PROSER3	Q2NL68	480 aa		27.67	■■■□□ 2.02
SDR39U1-208	ENST00000554698	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	27.67	■■■□□ 2.02
SDR39U1-208	ENST00000554698	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		27.67	■■■□□ 2.02
SDR39U1-208	ENST00000554698	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	27.67	■■■□□ 2.02
SDR39U1-208	ENST00000554698	GYS1	P13807	737 aa		27.66	■■■□□ 2.02
SDR39U1-208	ENST00000554698	SPON1	Q9HCB6	807 aa		27.66	■■■□□ 2.02
SDR39U1-208	ENST00000554698	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	27.66	■■■□□ 2.02
SDR39U1-208	ENST00000554698	ZPR1	O75312	459 aa		27.65	■■■□□ 2.02
SDR39U1-208	ENST00000554698	VAMP4	O75379	141 aa		27.65	■■■□□ 2.02
SDR39U1-208	ENST00000554698	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	27.65	■■■□□ 2.02
SDR39U1-208	ENST00000554698	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		27.64	■■■□□ 2.02
SDR39U1-208	ENST00000554698	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	27.64	■■■□□ 2.02
SDR39U1-208	ENST00000554698	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		27.64	■■■□□ 2.02
SDR39U1-208	ENST00000554698	ANXA1	P04083	346 aa		27.63	■■■□□ 2.01
SDR39U1-208	ENST00000554698	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		27.63	■■■□□ 2.01
SDR39U1-208	ENST00000554698	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		27.63	■■■□□ 2.01
SDR39U1-208	ENST00000554698	CAMTA2	O94983	1202 aa		27.62	■■■□□ 2.01
SDR39U1-208	ENST00000554698	PTGER2	P43116	358 aa		27.62	■■■□□ 2.01
SDR39U1-208	ENST00000554698	MSL1	Q68DK7	614 aa		27.62	■■■□□ 2.01
SDR39U1-208	ENST00000554698	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		27.62	■■■□□ 2.01
SDR39U1-208	ENST00000554698	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		27.62	■■■□□ 2.01
SDR39U1-208	ENST00000554698	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		27.61	■■■□□ 2.01
SDR39U1-208	ENST00000554698	HYPK	Q9NX55	129 aa		27.6	■■■□□ 2.01
SDR39U1-208	ENST00000554698	RGL2	O15211	777 aa		27.6	■■■□□ 2.01
SDR39U1-208	ENST00000554698	FKBP8	Q14318	412 aa		27.6	■■■□□ 2.01
SDR39U1-208	ENST00000554698	ARX	Q96QS3	562 aa		27.6	■■■□□ 2.01
SDR39U1-208	ENST00000554698	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		27.59	■■■□□ 2.01
SDR39U1-208	ENST00000554698	SCN7A	Q01118	1682 aa		27.58	■■■□□ 2.01
SDR39U1-208	ENST00000554698	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		27.58	■■■□□ 2.01
SDR39U1-208	ENST00000554698	LRP5	O75197	1615 aa		27.57	■■■□□ 2
SDR39U1-208	ENST00000554698	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		27.57	■■■□□ 2
SDR39U1-208	ENST00000554698	COPS6	Q7L5N1	327 aa		27.57	■■■□□ 2

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