RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551676.5

PPP1CC-208, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, human

TSL 2 BASIC

Gene PPP1CC, Length 1,581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP1CC-208	ENST00000551676	USP21	Q9UK80	565 aa		32.52	■■■□□ 2.8
PPP1CC-208	ENST00000551676	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		32.52	■■■□□ 2.8
PPP1CC-208	ENST00000551676	PIGB	Q92521	554 aa		32.51	■■■□□ 2.79
PPP1CC-208	ENST00000551676	PROSER3	Q2NL68	480 aa		32.49	■■■□□ 2.79
PPP1CC-208	ENST00000551676	USP16	Q9Y5T5	823 aa		32.49	■■■□□ 2.79
PPP1CC-208	ENST00000551676	BCL9	O00512	1426 aa		32.48	■■■□□ 2.79
PPP1CC-208	ENST00000551676	ANXA1	P04083	346 aa		32.48	■■■□□ 2.79
PPP1CC-208	ENST00000551676	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	32.48	■■■□□ 2.79
PPP1CC-208	ENST00000551676	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		32.48	■■■□□ 2.79
PPP1CC-208	ENST00000551676	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	32.46	■■■□□ 2.79
PPP1CC-208	ENST00000551676	ITGB4	P16144	1822 aa		32.45	■■■□□ 2.79
PPP1CC-208	ENST00000551676	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		32.45	■■■□□ 2.78
PPP1CC-208	ENST00000551676	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	32.45	■■■□□ 2.78
PPP1CC-208	ENST00000551676	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	32.45	■■■□□ 2.78
PPP1CC-208	ENST00000551676	ATG3	Q9NT62	314 aa		32.45	■■■□□ 2.78
PPP1CC-208	ENST00000551676	ERBB4	Q15303	1308 aa		32.44	■■■□□ 2.78
PPP1CC-208	ENST00000551676	ADCY9	O60503	1353 aa		32.43	■■■□□ 2.78
PPP1CC-208	ENST00000551676	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		32.42	■■■□□ 2.78
PPP1CC-208	ENST00000551676	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		32.42	■■■□□ 2.78
PPP1CC-208	ENST00000551676	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		32.42	■■■□□ 2.78
PPP1CC-208	ENST00000551676	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		32.41	■■■□□ 2.78
PPP1CC-208	ENST00000551676	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		32.41	■■■□□ 2.78
PPP1CC-208	ENST00000551676	MEIS3	Q99687	375 aa		32.41	■■■□□ 2.78
PPP1CC-208	ENST00000551676	AFF2	P51816	1311 aa		32.41	■■■□□ 2.78
PPP1CC-208	ENST00000551676	KSR2	Q6VAB6	950 aa		32.41	■■■□□ 2.78
PPP1CC-208	ENST00000551676	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		32.41	■■■□□ 2.78
PPP1CC-208	ENST00000551676	ATP10D	Q9P241	1426 aa		32.4	■■■□□ 2.78
PPP1CC-208	ENST00000551676	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	32.4	■■■□□ 2.78
PPP1CC-208	ENST00000551676	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	32.4	■■■□□ 2.78
PPP1CC-208	ENST00000551676	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		32.4	■■■□□ 2.78
PPP1CC-208	ENST00000551676	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		32.38	■■■□□ 2.77
PPP1CC-208	ENST00000551676	BEND3	Q5T5X7	828 aa		32.38	■■■□□ 2.77
PPP1CC-208	ENST00000551676	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		32.37	■■■□□ 2.77
PPP1CC-208	ENST00000551676	ATRN	O75882	1429 aa		32.37	■■■□□ 2.77
PPP1CC-208	ENST00000551676	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	32.36	■■■□□ 2.77
PPP1CC-208	ENST00000551676	SMC5	Q8IY18	1101 aa		32.36	■■■□□ 2.77
PPP1CC-208	ENST00000551676	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		32.36	■■■□□ 2.77
PPP1CC-208	ENST00000551676	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		32.36	■■■□□ 2.77
PPP1CC-208	ENST00000551676	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	32.36	■■■□□ 2.77
PPP1CC-208	ENST00000551676	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	32.36	■■■□□ 2.77
PPP1CC-208	ENST00000551676	GNAI3	P08754	354 aa		32.35	■■■□□ 2.77
PPP1CC-208	ENST00000551676	MYL6B	P14649	208 aa		32.35	■■■□□ 2.77
PPP1CC-208	ENST00000551676	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		32.35	■■■□□ 2.77
PPP1CC-208	ENST00000551676	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	32.34	■■■□□ 2.77
PPP1CC-208	ENST00000551676	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		32.34	■■■□□ 2.77
PPP1CC-208	ENST00000551676	SKAP1	Q86WV1	359 aa		32.33	■■■□□ 2.77
PPP1CC-208	ENST00000551676	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		32.33	■■■□□ 2.77
PPP1CC-208	ENST00000551676	NBPF26	B4DH59	902 aa		32.32	■■■□□ 2.77
PPP1CC-208	ENST00000551676	NBPF14	Q5TI25	921 aa		32.32	■■■□□ 2.77
PPP1CC-208	ENST00000551676	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	32.32	■■■□□ 2.77
PPP1CC-208	ENST00000551676	COPS6	Q7L5N1	327 aa		32.32	■■■□□ 2.77
PPP1CC-208	ENST00000551676	NBPF15	Q8N660	670 aa		32.32	■■■□□ 2.77
PPP1CC-208	ENST00000551676	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	32.32	■■■□□ 2.77
PPP1CC-208	ENST00000551676	USP44	Q9H0E7	712 aa		32.32	■■■□□ 2.77
PPP1CC-208	ENST00000551676	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		32.32	■■■□□ 2.77
PPP1CC-208	ENST00000551676	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	32.32	■■■□□ 2.77
PPP1CC-208	ENST00000551676	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	32.31	■■■□□ 2.76
PPP1CC-208	ENST00000551676	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	32.31	■■■□□ 2.76
PPP1CC-208	ENST00000551676	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	32.3	■■■□□ 2.76
PPP1CC-208	ENST00000551676	ALDH1L1	O75891	902 aa		32.3	■■■□□ 2.76
PPP1CC-208	ENST00000551676	GNAI2	P04899	355 aa		32.3	■■■□□ 2.76
PPP1CC-208	ENST00000551676	CEP85	Q6P2H3	762 aa		32.3	■■■□□ 2.76
PPP1CC-208	ENST00000551676	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		32.3	■■■□□ 2.76
PPP1CC-208	ENST00000551676	A1BG	P04217	495 aa		32.28	■■■□□ 2.76
PPP1CC-208	ENST00000551676	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	32.28	■■■□□ 2.76
PPP1CC-208	ENST00000551676	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		32.28	■■■□□ 2.76
PPP1CC-208	ENST00000551676	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		32.28	■■■□□ 2.76
PPP1CC-208	ENST00000551676	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		32.28	■■■□□ 2.76
PPP1CC-208	ENST00000551676	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	32.28	■■■□□ 2.76
PPP1CC-208	ENST00000551676	LINS1	Q8NG48	757 aa		32.27	■■■□□ 2.76
PPP1CC-208	ENST00000551676	GCC1	Q96CN9	775 aa		32.27	■■■□□ 2.76
PPP1CC-208	ENST00000551676	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		32.26	■■■□□ 2.75
PPP1CC-208	ENST00000551676	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		32.26	■■■□□ 2.75
PPP1CC-208	ENST00000551676	STARD3NL	O95772	234 aa		32.25	■■■□□ 2.75
PPP1CC-208	ENST00000551676	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	32.24	■■■□□ 2.75
PPP1CC-208	ENST00000551676	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	32.24	■■■□□ 2.75
PPP1CC-208	ENST00000551676	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		32.23	■■■□□ 2.75
PPP1CC-208	ENST00000551676		A0A0G2JS52	829 aa		32.22	■■■□□ 2.75
PPP1CC-208	ENST00000551676	MYT1	Q01538	1121 aa		32.22	■■■□□ 2.75
PPP1CC-208	ENST00000551676	DCTPP1	Q9H773	170 aa		32.22	■■■□□ 2.75
PPP1CC-208	ENST00000551676	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	32.21	■■■□□ 2.75
PPP1CC-208	ENST00000551676	NUCB1	Q02818	461 aa		32.21	■■■□□ 2.75
PPP1CC-208	ENST00000551676	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	32.21	■■■□□ 2.75
PPP1CC-208	ENST00000551676	IGKV5-2	P06315	115 aa		32.2	■■■□□ 2.75
PPP1CC-208	ENST00000551676	KCNQ2	O43526	872 aa		32.19	■■■□□ 2.74
PPP1CC-208	ENST00000551676	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	32.19	■■■□□ 2.74
PPP1CC-208	ENST00000551676	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	32.19	■■■□□ 2.74
PPP1CC-208	ENST00000551676	UTY	O14607	1347 aa		32.19	■■■□□ 2.74
PPP1CC-208	ENST00000551676	RGS3	P49796	1198 aa		32.19	■■■□□ 2.74
PPP1CC-208	ENST00000551676	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		32.19	■■■□□ 2.74
PPP1CC-208	ENST00000551676	HMMR	O75330	724 aa		32.18	■■■□□ 2.74
PPP1CC-208	ENST00000551676	ATP8B2	P98198	1209 aa		32.18	■■■□□ 2.74
PPP1CC-208	ENST00000551676	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	32.18	■■■□□ 2.74
PPP1CC-208	ENST00000551676	TJP1	Q07157	1748 aa		32.17	■■■□□ 2.74
PPP1CC-208	ENST00000551676	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	32.17	■■■□□ 2.74
PPP1CC-208	ENST00000551676	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		32.16	■■■□□ 2.74
PPP1CC-208	ENST00000551676	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		32.16	■■■□□ 2.74
PPP1CC-208	ENST00000551676	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		32.15	■■■□□ 2.74
PPP1CC-208	ENST00000551676	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		32.15	■■■□□ 2.74
PPP1CC-208	ENST00000551676	MYD88	Q99836	296 aa		32.15	■■■□□ 2.74

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