RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527871.5

RPS2-208, Transcript of ribosomal protein S2, human

TSL 1 (best)

Gene RPS2, Length 1,243 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS2-208	ENST00000527871	ZPR1	O75312	459 aa		32.74	■■■□□ 2.83
RPS2-208	ENST00000527871	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	32.73	■■■□□ 2.83
RPS2-208	ENST00000527871	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		32.73	■■■□□ 2.83
RPS2-208	ENST00000527871	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		32.73	■■■□□ 2.83
RPS2-208	ENST00000527871	FCHSD2	O94868	740 aa		32.72	■■■□□ 2.83
RPS2-208	ENST00000527871	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	32.72	■■■□□ 2.83
RPS2-208	ENST00000527871	ZNF790	Q6PG37	636 aa		32.71	■■■□□ 2.83
RPS2-208	ENST00000527871	COL15A1	P39059	1388 aa		32.7	■■■□□ 2.83
RPS2-208	ENST00000527871	NFIX	Q14938	502 aa		32.7	■■■□□ 2.83
RPS2-208	ENST00000527871	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		32.7	■■■□□ 2.83
RPS2-208	ENST00000527871	PIM2	Q9P1W9	311 aa		32.7	■■■□□ 2.83
RPS2-208	ENST00000527871	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		32.7	■■■□□ 2.82
RPS2-208	ENST00000527871	PPP2R1A	P30153	589 aa		32.69	■■■□□ 2.82
RPS2-208	ENST00000527871	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	32.69	■■■□□ 2.82
RPS2-208	ENST00000527871	CHRNA5	P30532	468 aa		32.68	■■■□□ 2.82
RPS2-208	ENST00000527871	PRKAR2B	P31323	418 aa		32.68	■■■□□ 2.82
RPS2-208	ENST00000527871	TEF	Q10587	303 aa		32.68	■■■□□ 2.82
RPS2-208	ENST00000527871	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		32.68	■■■□□ 2.82
RPS2-208	ENST00000527871	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	32.67	■■■□□ 2.82
RPS2-208	ENST00000527871	KIF3C	O14782	793 aa		32.66	■■■□□ 2.82
RPS2-208	ENST00000527871	STARD3NL	O95772	234 aa		32.66	■■■□□ 2.82
RPS2-208	ENST00000527871	CFAP53	Q96M91	514 aa		32.66	■■■□□ 2.82
RPS2-208	ENST00000527871	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		32.66	■■■□□ 2.82
RPS2-208	ENST00000527871	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	32.65	■■■□□ 2.82
RPS2-208	ENST00000527871	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	32.64	■■■□□ 2.82
RPS2-208	ENST00000527871	KCNQ3	O43525	872 aa		32.63	■■■□□ 2.81
RPS2-208	ENST00000527871	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	32.62	■■■□□ 2.81
RPS2-208	ENST00000527871	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		32.62	■■■□□ 2.81
RPS2-208	ENST00000527871	SERPINB2	P05120	415 aa		32.61	■■■□□ 2.81
RPS2-208	ENST00000527871	NUDC	Q9Y266	331 aa		32.61	■■■□□ 2.81
RPS2-208	ENST00000527871	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	32.61	■■■□□ 2.81
RPS2-208	ENST00000527871	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		32.6	■■■□□ 2.81
RPS2-208	ENST00000527871	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	32.58	■■■□□ 2.81
RPS2-208	ENST00000527871	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	32.58	■■■□□ 2.81
RPS2-208	ENST00000527871	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		32.58	■■■□□ 2.81
RPS2-208	ENST00000527871		A0A087WZG4	1122 aa		32.57	■■■□□ 2.8
RPS2-208	ENST00000527871	BTBD11	A6QL63	1104 aa		32.57	■■■□□ 2.8
RPS2-208	ENST00000527871	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		32.57	■■■□□ 2.8
RPS2-208	ENST00000527871	A1BG	P04217	495 aa		32.56	■■■□□ 2.8
RPS2-208	ENST00000527871	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	32.56	■■■□□ 2.8
RPS2-208	ENST00000527871	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		32.54	■■■□□ 2.8
RPS2-208	ENST00000527871	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		32.54	■■■□□ 2.8
RPS2-208	ENST00000527871	HSPA6	P17066	643 aa		32.53	■■■□□ 2.8
RPS2-208	ENST00000527871	USP16	Q9Y5T5	823 aa		32.53	■■■□□ 2.8
RPS2-208	ENST00000527871	MCM10	Q7L590	875 aa		32.52	■■■□□ 2.8
RPS2-208	ENST00000527871	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		32.52	■■■□□ 2.8
RPS2-208	ENST00000527871	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		32.51	■■■□□ 2.79
RPS2-208	ENST00000527871	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		32.5	■■■□□ 2.79
RPS2-208	ENST00000527871	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		32.49	■■■□□ 2.79
RPS2-208	ENST00000527871	DCTN1	Q14203	1278 aa		32.49	■■■□□ 2.79
RPS2-208	ENST00000527871	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	32.48	■■■□□ 2.79
RPS2-208	ENST00000527871	CAMTA2	O94983	1202 aa		32.48	■■■□□ 2.79
RPS2-208	ENST00000527871	SBF1	O95248	1867 aa		32.46	■■■□□ 2.79
RPS2-208	ENST00000527871	TOMM70	O94826	608 aa		32.46	■■■□□ 2.79
RPS2-208	ENST00000527871	PRELP	P51888	382 aa		32.46	■■■□□ 2.79
RPS2-208	ENST00000527871	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		32.46	■■■□□ 2.79
RPS2-208	ENST00000527871	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	32.46	■■■□□ 2.79
RPS2-208	ENST00000527871	RNF181	Q9P0P0	153 aa		32.46	■■■□□ 2.79
RPS2-208	ENST00000527871	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	32.46	■■■□□ 2.79
RPS2-208	ENST00000527871	TTLL6	Q8N841	843 aa		32.45	■■■□□ 2.79
RPS2-208	ENST00000527871	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		32.44	■■■□□ 2.78
RPS2-208	ENST00000527871		H0YIN7	160 aa		32.43	■■■□□ 2.78
RPS2-208	ENST00000527871	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	32.43	■■■□□ 2.78
RPS2-208	ENST00000527871	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	32.43	■■■□□ 2.78
RPS2-208	ENST00000527871	SCN7A	Q01118	1682 aa		32.43	■■■□□ 2.78
RPS2-208	ENST00000527871	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		32.42	■■■□□ 2.78
RPS2-208	ENST00000527871	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		32.42	■■■□□ 2.78
RPS2-208	ENST00000527871	RASSF7	Q02833	373 aa		32.41	■■■□□ 2.78
RPS2-208	ENST00000527871	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		32.41	■■■□□ 2.78
RPS2-208	ENST00000527871	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	32.4	■■■□□ 2.78
RPS2-208	ENST00000527871	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	32.4	■■■□□ 2.78
RPS2-208	ENST00000527871	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		32.4	■■■□□ 2.78
RPS2-208	ENST00000527871	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		32.4	■■■□□ 2.78
RPS2-208	ENST00000527871	NBPF26	B4DH59	902 aa		32.39	■■■□□ 2.78
RPS2-208	ENST00000527871	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	32.39	■■■□□ 2.78
RPS2-208	ENST00000527871	NBPF15	Q8N660	670 aa		32.39	■■■□□ 2.78
RPS2-208	ENST00000527871	SETDB2	Q96T68	719 aa		32.38	■■■□□ 2.77
RPS2-208	ENST00000527871	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		32.37	■■■□□ 2.77
RPS2-208	ENST00000527871	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		32.37	■■■□□ 2.77
RPS2-208	ENST00000527871	NFKBIE	O00221	500 aa		32.36	■■■□□ 2.77
RPS2-208	ENST00000527871	PDE6B	P35913	854 aa		32.36	■■■□□ 2.77
RPS2-208	ENST00000527871	LMNB1	P20700	586 aa		32.35	■■■□□ 2.77
RPS2-208	ENST00000527871	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		32.35	■■■□□ 2.77
RPS2-208	ENST00000527871	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	32.35	■■■□□ 2.77
RPS2-208	ENST00000527871	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		32.33	■■■□□ 2.77
RPS2-208	ENST00000527871	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	32.33	■■■□□ 2.77
RPS2-208	ENST00000527871	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	32.33	■■■□□ 2.77
RPS2-208	ENST00000527871	RRAGC	Q9HB90	399 aa		32.33	■■■□□ 2.77
RPS2-208	ENST00000527871	CNBD1	Q8NA66	436 aa		32.32	■■■□□ 2.76
RPS2-208	ENST00000527871	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	32.32	■■■□□ 2.76
RPS2-208	ENST00000527871	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		32.32	■■■□□ 2.76
RPS2-208	ENST00000527871	RGL2	O15211	777 aa		32.29	■■■□□ 2.76
RPS2-208	ENST00000527871	SRGN	P10124	158 aa		32.29	■■■□□ 2.76
RPS2-208	ENST00000527871	APLP1	P51693	650 aa		32.29	■■■□□ 2.76
RPS2-208	ENST00000527871	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		32.29	■■■□□ 2.76
RPS2-208	ENST00000527871	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	32.29	■■■□□ 2.76
RPS2-208	ENST00000527871	C21orf2	O43822	256 aa		32.28	■■■□□ 2.76
RPS2-208	ENST00000527871	NFE2L2	Q16236	605 aa		32.28	■■■□□ 2.76
RPS2-208	ENST00000527871	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		32.27	■■■□□ 2.76
RPS2-208	ENST00000527871	GLTPD2	A6NH11	291 aa		32.26	■■■□□ 2.75

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