RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
SH3BP2-220ENST00000511663 KCNA3P22001 575 aa25.82■■□□□ 1.72
SH3BP2-220ENST00000511663 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa25.82■■□□□ 1.72
SH3BP2-220ENST00000511663 A0A087WZG4 1122 aa25.81■■□□□ 1.72
SH3BP2-220ENST00000511663 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
SH3BP2-220ENST00000511663 IL17REQ8NFR9 667 aa25.81■■□□□ 1.72
SH3BP2-220ENST00000511663 COL15A1P39059 1388 aa25.81■■□□□ 1.72
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF790Q6PG37 636 aa25.79■■□□□ 1.72
SH3BP2-220ENST00000511663 CHRNA5P30532 468 aa25.78■■□□□ 1.72
SH3BP2-220ENST00000511663 NFIXQ14938 502 aa25.78■■□□□ 1.72
SH3BP2-220ENST00000511663 KCPQ6ZWJ8 1503 aa25.78■■□□□ 1.72
SH3BP2-220ENST00000511663 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa25.77■■□□□ 1.72
SH3BP2-220ENST00000511663 PRKAR2BP31323 418 aa25.77■■□□□ 1.72
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
SH3BP2-220ENST00000511663 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
SH3BP2-220ENST00000511663 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
SH3BP2-220ENST00000511663 SERPINB2P05120 415 aa25.76■■□□□ 1.71
SH3BP2-220ENST00000511663 FMNL2Q96PY5 1086 aa25.76■■□□□ 1.71
SH3BP2-220ENST00000511663 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa25.75■■□□□ 1.71
SH3BP2-220ENST00000511663 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
SH3BP2-220ENST00000511663 HSPA6P17066 643 aa25.75■■□□□ 1.71
SH3BP2-220ENST00000511663 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP25.75■■□□□ 1.71
SH3BP2-220ENST00000511663 C9orf131Q5VYM1 1079 aa25.75■■□□□ 1.71
SH3BP2-220ENST00000511663 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
SH3BP2-220ENST00000511663 HEG1Q9ULI3 1381 aa25.74■■□□□ 1.71
SH3BP2-220ENST00000511663 BTBD11A6QL63 1104 aa25.74■■□□□ 1.71
SH3BP2-220ENST00000511663 KIF3CO14782 793 aa25.74■■□□□ 1.71
SH3BP2-220ENST00000511663 EIF5P55010 431 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
SH3BP2-220ENST00000511663 BICDL1Q6ZP65 573 aa25.73■■□□□ 1.71
SH3BP2-220ENST00000511663 PHACTR3Q96KR7 559 aa25.73■■□□□ 1.71
SH3BP2-220ENST00000511663 RSPH6AQ9H0K4 717 aa25.73■■□□□ 1.71
SH3BP2-220ENST00000511663 PPP2R1AP30153 589 aa25.72■■□□□ 1.71
SH3BP2-220ENST00000511663 BCL2L12Q9HB09 334 aa25.72■■□□□ 1.71
SH3BP2-220ENST00000511663 H0YIN7 160 aa25.7■■□□□ 1.7
SH3BP2-220ENST00000511663 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
SH3BP2-220ENST00000511663 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
SH3BP2-220ENST00000511663 TOMM70O94826 608 aa25.69■■□□□ 1.7
SH3BP2-220ENST00000511663 NEFMP07197 916 aa25.69■■□□□ 1.7
SH3BP2-220ENST00000511663 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
SH3BP2-220ENST00000511663 RNF181Q9P0P0 153 aa25.69■■□□□ 1.7
SH3BP2-220ENST00000511663 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa25.68■■□□□ 1.7
SH3BP2-220ENST00000511663 C2CD5Q86YS7 1000 aa25.68■■□□□ 1.7
SH3BP2-220ENST00000511663 TTLL6Q8N841 843 aa25.68■■□□□ 1.7
SH3BP2-220ENST00000511663 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa25.68■■□□□ 1.7
SH3BP2-220ENST00000511663 KDM2BQ8NHM5 1336 aa25.67■■□□□ 1.7
SH3BP2-220ENST00000511663 UBR2Q8IWV8 1755 aa25.67■■□□□ 1.7
SH3BP2-220ENST00000511663 NPHP1O15259 732 aa25.67■■□□□ 1.7
SH3BP2-220ENST00000511663 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa25.67■■□□□ 1.7
SH3BP2-220ENST00000511663 A1BGP04217 495 aa25.66■■□□□ 1.7
SH3BP2-220ENST00000511663 TBC1D9BQ66K14 1250 aa25.65■■□□□ 1.7
SH3BP2-220ENST00000511663 NMRK2Q9NPI5 230 aa25.65■■□□□ 1.7
SH3BP2-220ENST00000511663 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa25.65■■□□□ 1.7
SH3BP2-220ENST00000511663 PDE6BP35913 854 aa25.64■■□□□ 1.7
SH3BP2-220ENST00000511663 SETDB2Q96T68 719 aa25.64■■□□□ 1.7
SH3BP2-220ENST00000511663 KCNQ3O43525 872 aa25.63■■□□□ 1.69
SH3BP2-220ENST00000511663 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
SH3BP2-220ENST00000511663 MCM10Q7L590 875 aa25.63■■□□□ 1.69
SH3BP2-220ENST00000511663 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP25.62■■□□□ 1.694e-7■■□□□ 11.4
SH3BP2-220ENST00000511663 BRIP1Q9BX63 1249 aa25.62■■□□□ 1.69
SH3BP2-220ENST00000511663 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
SH3BP2-220ENST00000511663 APLP1P51693 650 aa25.61■■□□□ 1.69
SH3BP2-220ENST00000511663 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
SH3BP2-220ENST00000511663 USP16Q9Y5T5 823 aa25.61■■□□□ 1.69
SH3BP2-220ENST00000511663 CARMIL3Q8ND23 1372 aa25.6■■□□□ 1.69
SH3BP2-220ENST00000511663 LMNB1P20700 586 aa25.59■■□□□ 1.69
SH3BP2-220ENST00000511663 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
SH3BP2-220ENST00000511663 NRXN2Q9P2S2 1712 aa25.58■■□□□ 1.69
SH3BP2-220ENST00000511663 ST5P78524 1137 aa25.58■■□□□ 1.69
SH3BP2-220ENST00000511663 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
SH3BP2-220ENST00000511663 CNBD1Q8NA66 436 aa25.58■■□□□ 1.69
SH3BP2-220ENST00000511663 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
SH3BP2-220ENST00000511663 RRAGCQ9HB90 399 aa25.58■■□□□ 1.69
SH3BP2-220ENST00000511663 CAMTA2O94983 1202 aa25.57■■□□□ 1.68
SH3BP2-220ENST00000511663 RASSF7Q02833 373 aa25.57■■□□□ 1.68
SH3BP2-220ENST00000511663 DCTN1Q14203 1278 aa25.57■■□□□ 1.68
SH3BP2-220ENST00000511663 PRR5LQ6MZQ0 368 aa25.57■■□□□ 1.68
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF652Q9Y2D9 606 aa25.57■■□□□ 1.68
SH3BP2-220ENST00000511663 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
SH3BP2-220ENST00000511663 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
SH3BP2-220ENST00000511663 CLEC4GQ6UXB4 293 aa25.55■■□□□ 1.68
SH3BP2-220ENST00000511663 CCDC24Q8N4L8 307 aa25.55■■□□□ 1.68
SH3BP2-220ENST00000511663 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
SH3BP2-220ENST00000511663 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa25.53■■□□□ 1.68
SH3BP2-220ENST00000511663 FSTL1Q12841 308 aa25.53■■□□□ 1.68
SH3BP2-220ENST00000511663 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
SH3BP2-220ENST00000511663 CNKSR1Q969H4 720 aa25.53■■□□□ 1.68
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
SH3BP2-220ENST00000511663 C21orf2O43822 256 aa25.51■■□□□ 1.67
SH3BP2-220ENST00000511663 DPY19L2Q6NUT2 758 aa25.51■■□□□ 1.67
SH3BP2-220ENST00000511663 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
SH3BP2-220ENST00000511663 SBF1O95248 1867 aa25.51■■□□□ 1.67
SH3BP2-220ENST00000511663 GLTPD2A6NH11 291 aa25.5■■□□□ 1.67
SH3BP2-220ENST00000511663 DLEC1Q9Y238 1755 aa25.49■■□□□ 1.67
SH3BP2-220ENST00000511663 SCN7AQ01118 1682 aa25.49■■□□□ 1.67
SH3BP2-220ENST00000511663 STYK1Q6J9G0 422 aa25.49■■□□□ 1.67
SH3BP2-220ENST00000511663 TPTE2Q6XPS3 522 aa25.49■■□□□ 1.67
SH3BP2-220ENST00000511663 MASTLQ96GX5 879 aa25.49■■□□□ 1.67
SH3BP2-220ENST00000511663 MIS18AQ9NYP9 233 aa25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 147.6 ms