RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510829.6

RABGEF1-208, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-208ENST00000510829 CABP4P57796 275 aa13.51□□□□□ -0.25
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RABGEF1-208ENST00000510829 SSH3Q8TE77 659 aa13.51□□□□□ -0.25
RABGEF1-208ENST00000510829 KIF1BPQ96EK5 621 aa13.51□□□□□ -0.25
RABGEF1-208ENST00000510829 ST18O60284 1047 aa13.51□□□□□ -0.25
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RABGEF1-208ENST00000510829 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa13.48□□□□□ -0.25
RABGEF1-208ENST00000510829 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
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RABGEF1-208ENST00000510829 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
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RABGEF1-208ENST00000510829 USP54Q70EL1 1684 aa13.47□□□□□ -0.25
RABGEF1-208ENST00000510829 NEK4P51957 841 aa13.47□□□□□ -0.25
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RABGEF1-208ENST00000510829 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa13.47□□□□□ -0.25
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RABGEF1-208ENST00000510829 FMNL2Q96PY5 1086 aa13.46□□□□□ -0.25
RABGEF1-208ENST00000510829 SIL1Q9H173 461 aa13.46□□□□□ -0.25
RABGEF1-208ENST00000510829 SLAIN2Q9P270 581 aa13.46□□□□□ -0.25
RABGEF1-208ENST00000510829 CYP27B1O15528 508 aa13.46□□□□□ -0.25
RABGEF1-208ENST00000510829 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa13.46□□□□□ -0.25
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RABGEF1-208ENST00000510829 USP16Q9Y5T5 823 aa13.46□□□□□ -0.25
RABGEF1-208ENST00000510829 TNS3Q68CZ2 1445 aa13.46□□□□□ -0.26
RABGEF1-208ENST00000510829 CHMLP26374 656 aa13.46□□□□□ -0.26
RABGEF1-208ENST00000510829 POLA2Q14181 598 aa13.46□□□□□ -0.26
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RABGEF1-208ENST00000510829 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP13.46□□□□□ -0.261e-7■■□□□ 13.3
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RABGEF1-208ENST00000510829 DDX11L8A8MPP1 907 aa13.45□□□□□ -0.26
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RABGEF1-208ENST00000510829 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
RABGEF1-208ENST00000510829 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
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RABGEF1-208ENST00000510829 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa13.45□□□□□ -0.26
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RABGEF1-208ENST00000510829 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
RABGEF1-208ENST00000510829 AACSQ86V21 672 aa13.44□□□□□ -0.26
RABGEF1-208ENST00000510829 KIF1AQ12756 1690 aa13.44□□□□□ -0.26
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RABGEF1-208ENST00000510829 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa13.41□□□□□ -0.26
RABGEF1-208ENST00000510829 AOX1Q06278 1338 aa13.4□□□□□ -0.26
RABGEF1-208ENST00000510829 A0A0G2JS52 829 aa13.4□□□□□ -0.26
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RABGEF1-208ENST00000510829 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa13.4□□□□□ -0.26
RABGEF1-208ENST00000510829 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
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