RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 FOXD4L1Q9NU39 408 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 RAI14Q9P0K7 980 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 BCL9O00512 1426 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 SATB1Q01826 763 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 SPG7Q9UQ90 795 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 NRAPQ86VF7 1730 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 SCP2P22307 547 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 SSFA2P28290 1259 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP5.7□□□□□ -1.52e-6■■■■□ 25.7
RABGGTB-213ENST00000496055 BRWD3Q6RI45 1802 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 TNS2Q63HR2 1409 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 USP31Q70CQ4 1352 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 ERBB3P21860 1342 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 GOLGA6CA6NDK9 693 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 GOLGA6BA6NDN3 693 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 GOLGA6DP0CG33 693 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 NME9Q86XW9 330 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 MAP7D2Q96T17 732 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 SYT17Q9BSW7 474 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa5.7□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 ABCA3Q99758 1704 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 MARCH6O60337 910 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 ATL2Q8NHH9 583 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 ZBTB9Q96C00 473 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 CLCN1P35523 988 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 SIN3AQ96ST3 1273 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 ABCC6O95255 1503 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 NRKQ7Z2Y5 1582 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 SSR1P43307 286 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 MTA1Q13330 715 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 ANKRD23Q86SG2 305 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 MTA3Q9BTC8 594 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 MYH16Q9H6N6 1097 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 STK24Q9Y6E0 443 aa5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 SLIT3O75094 1523 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 QRICH2Q9H0J4 1663 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 AXIN2Q9Y2T1 843 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 PPME1Q9Y570 386 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 RTL1A6NKG5 1358 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 NRDCO43847 1150 aa5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 PIK3R5Q8WYR1 880 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 TMOD3Q9NYL9 352 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 CD2APQ9Y5K6 639 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 MRVI1Q9Y6F6 885 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 MAP3K5Q99683 1374 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 RHBDL3P58872 404 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 C1QTNF8P60827 252 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 HOXC9P31274 260 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 KIF24Q5T7B8 1368 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 NEUROD2Q15784 382 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 CEP83Q9Y592 693 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-213ENST00000496055 C1orf141Q5JVX7 400 aa5.65□□□□□ -1.51
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF280DQ6N043 979 aa5.65□□□□□ -1.51
RABGGTB-213ENST00000496055 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
RABGGTB-213ENST00000496055 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa5.65□□□□□ -1.51
RABGGTB-213ENST00000496055 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms