RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487163.5

USP21-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 21, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene USP21, Length 2,514 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21-208ENST00000487163 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP20.59■□□□□ 0.89
USP21-208ENST00000487163 CHMLP26374 656 aa20.59■□□□□ 0.89
USP21-208ENST00000487163 PKP1Q13835 747 aa20.59■□□□□ 0.89
USP21-208ENST00000487163 POLA2Q14181 598 aa20.59■□□□□ 0.89
USP21-208ENST00000487163 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
USP21-208ENST00000487163 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
USP21-208ENST00000487163 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
USP21-208ENST00000487163 ANO2Q9NQ90 1003 aa20.58■□□□□ 0.89
USP21-208ENST00000487163 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
USP21-208ENST00000487163 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
USP21-208ENST00000487163 RHPN1Q8TCX5 695 aa20.58■□□□□ 0.88
USP21-208ENST00000487163 PALD1Q9ULE6 856 aa20.58■□□□□ 0.88
USP21-208ENST00000487163 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
USP21-208ENST00000487163 PANK2Q9BZ23 570 aa20.57■□□□□ 0.88
USP21-208ENST00000487163 NCAPD2Q15021 1401 aa20.57■□□□□ 0.88
USP21-208ENST00000487163 IL25Q9H293 177 aa20.57■□□□□ 0.88
USP21-208ENST00000487163 C1orf167Q5SNV9 1468 aa20.56■□□□□ 0.88
USP21-208ENST00000487163 NEK4P51957 841 aa20.56■□□□□ 0.88
USP21-208ENST00000487163 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa20.56■□□□□ 0.88
USP21-208ENST00000487163 ERBB3P21860 1342 aa20.55■□□□□ 0.88
USP21-208ENST00000487163 RAB11FIP3O75154 756 aa20.55■□□□□ 0.88
USP21-208ENST00000487163 BAG4O95429 457 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
USP21-208ENST00000487163 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
USP21-208ENST00000487163 C19orf44Q9H6X5 657 aa20.54■□□□□ 0.88
USP21-208ENST00000487163 CHMP4AQ9BY43 222 aa20.54■□□□□ 0.88
USP21-208ENST00000487163 PI4K2BQ8TCG2 481 aa20.53■□□□□ 0.88
USP21-208ENST00000487163 KIF1BPQ96EK5 621 aa20.53■□□□□ 0.88
USP21-208ENST00000487163 SLC39A6Q13433 755 aa20.52■□□□□ 0.88
USP21-208ENST00000487163 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
USP21-208ENST00000487163 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
USP21-208ENST00000487163 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
USP21-208ENST00000487163 NLRP2Q9NX02 1062 aa20.52■□□□□ 0.87
USP21-208ENST00000487163 HEG1Q9ULI3 1381 aa20.51■□□□□ 0.87
USP21-208ENST00000487163 NUCB2P80303 420 aa20.51■□□□□ 0.87
USP21-208ENST00000487163 AOX1Q06278 1338 aa20.51■□□□□ 0.87
USP21-208ENST00000487163 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
USP21-208ENST00000487163 KSR2Q6VAB6 950 aa20.51■□□□□ 0.87
USP21-208ENST00000487163 CLEC17AQ6ZS10 378 aa20.51■□□□□ 0.87
USP21-208ENST00000487163 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa20.5■□□□□ 0.87
USP21-208ENST00000487163 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
USP21-208ENST00000487163 GOLGA6L22H0YM25 854 aa20.5■□□□□ 0.87
USP21-208ENST00000487163 MCCP23508 829 aa20.5■□□□□ 0.87
USP21-208ENST00000487163 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
USP21-208ENST00000487163 MCTP1Q6DN14 999 aa20.5■□□□□ 0.87
USP21-208ENST00000487163 CABLES1Q8TDN4 633 aa20.5■□□□□ 0.87
USP21-208ENST00000487163 TMX3Q96JJ7 454 aa20.5■□□□□ 0.87
USP21-208ENST00000487163 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
USP21-208ENST00000487163 GAS2L3Q86XJ1 694 aa20.49■□□□□ 0.87
USP21-208ENST00000487163 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa20.49■□□□□ 0.87
USP21-208ENST00000487163 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
USP21-208ENST00000487163 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
USP21-208ENST00000487163 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa20.49■□□□□ 0.87
USP21-208ENST00000487163 HSPA2P54652 639 aa20.49■□□□□ 0.87
USP21-208ENST00000487163 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
USP21-208ENST00000487163 GRPEL1Q9HAV7 217 aa20.48■□□□□ 0.87
USP21-208ENST00000487163 CHAMP1Q96JM3 812 aa20.48■□□□□ 0.87
USP21-208ENST00000487163 ZDHHC9Q9Y397 364 aa20.48■□□□□ 0.87
USP21-208ENST00000487163 KIF1AQ12756 1690 aa20.48■□□□□ 0.87
USP21-208ENST00000487163 ALS2Q96Q42 1657 aa20.47■□□□□ 0.87
USP21-208ENST00000487163 ATF3P18847 181 aa20.47■□□□□ 0.87
USP21-208ENST00000487163 MRE11P49959 708 aa20.47■□□□□ 0.87
USP21-208ENST00000487163 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
USP21-208ENST00000487163 ALDH1L1O75891 902 aa20.47■□□□□ 0.87
USP21-208ENST00000487163 ZNF790Q6PG37 636 aa20.47■□□□□ 0.87
USP21-208ENST00000487163 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa20.47■□□□□ 0.87
USP21-208ENST00000487163 HYPKQ9NX55 129 aa20.47■□□□□ 0.87
USP21-208ENST00000487163 PTMSP20962 102 aa20.46■□□□□ 0.87
USP21-208ENST00000487163 MTX1Q13505 466 aa20.46■□□□□ 0.87
USP21-208ENST00000487163 PDIA6Q15084 440 aa20.46■□□□□ 0.87
USP21-208ENST00000487163 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
USP21-208ENST00000487163 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
USP21-208ENST00000487163 MYL6BP14649 208 aa20.46■□□□□ 0.87
USP21-208ENST00000487163 ANAPC15P60006 121 aa20.46■□□□□ 0.87
USP21-208ENST00000487163 CHRNA2Q15822 529 aa20.46■□□□□ 0.87
USP21-208ENST00000487163 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa20.46■□□□□ 0.87
USP21-208ENST00000487163 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP20.46■□□□□ 0.87
USP21-208ENST00000487163 TMEM94Q12767 1356 aa20.45■□□□□ 0.86
USP21-208ENST00000487163 NPHP3Q7Z494 1330 aa20.45■□□□□ 0.86
USP21-208ENST00000487163 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
USP21-208ENST00000487163 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa20.44■□□□□ 0.86
USP21-208ENST00000487163 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
USP21-208ENST00000487163 CNTROBQ8N137 903 aa20.44■□□□□ 0.86
USP21-208ENST00000487163 KAZALD1Q96I82 304 aa20.44■□□□□ 0.86
USP21-208ENST00000487163 SUCLG2Q96I99 432 aa20.44■□□□□ 0.86
USP21-208ENST00000487163 SLC52A2Q9HAB3 445 aa20.44■□□□□ 0.86
USP21-208ENST00000487163 MST1RQ04912 1400 aa20.44■□□□□ 0.86
USP21-208ENST00000487163 SGSM2O43147 1006 aa20.44■□□□□ 0.86
USP21-208ENST00000487163 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
USP21-208ENST00000487163 LINS1Q8NG48 757 aa20.44■□□□□ 0.86
USP21-208ENST00000487163 GRM8O00222 908 aa20.43■□□□□ 0.86
USP21-208ENST00000487163 PHKG2P15735 406 aa20.43■□□□□ 0.86
USP21-208ENST00000487163 HSPA4P34932 840 aa20.43■□□□□ 0.86
USP21-208ENST00000487163 KLHL40Q2TBA0 621 aa20.43■□□□□ 0.86
USP21-208ENST00000487163 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa20.43■□□□□ 0.86
USP21-208ENST00000487163 MEGF6O75095 1541 aa20.43■□□□□ 0.86
USP21-208ENST00000487163 TATP17735 454 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
USP21-208ENST00000487163 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
USP21-208ENST00000487163 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
USP21-208ENST00000487163 RIC3Q7Z5B4 369 aa20.42■□□□□ 0.86
USP21-208ENST00000487163 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms