RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484266.5

CHKB-210, Transcript of choline kinase beta, human

TSL 2

Gene CHKB, Length 1,401 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHKB-210	ENST00000484266	STARD3NL	O95772	234 aa		42.94	■■■■■ 4.46
CHKB-210	ENST00000484266	ZNF853	P0CG23	659 aa		42.94	■■■■■ 4.46
CHKB-210	ENST00000484266	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	42.93	■■■■■ 4.46
CHKB-210	ENST00000484266	RPS6KA4	O75676	772 aa		42.93	■■■■■ 4.46
CHKB-210	ENST00000484266	PHF14	O94880	888 aa		42.93	■■■■■ 4.46
CHKB-210	ENST00000484266	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		42.93	■■■■■ 4.46
CHKB-210	ENST00000484266	IFT57	Q9NWB7	429 aa		42.93	■■■■■ 4.46
CHKB-210	ENST00000484266	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	42.93	■■■■■ 4.46
CHKB-210	ENST00000484266	NGEF	Q8N5V2	710 aa		42.92	■■■■■ 4.46
CHKB-210	ENST00000484266	USP16	Q9Y5T5	823 aa		42.92	■■■■■ 4.46
CHKB-210	ENST00000484266	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	42.9	■■■■■ 4.46
CHKB-210	ENST00000484266	GNAI1	P63096	354 aa		42.89	■■■■■ 4.46
CHKB-210	ENST00000484266	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		42.89	■■■■■ 4.46
CHKB-210	ENST00000484266	MBIP	Q9NS73	344 aa		42.88	■■■■■ 4.46
CHKB-210	ENST00000484266	C4A	P0C0L4	1744 aa		42.88	■■■■■ 4.45
CHKB-210	ENST00000484266	ZBTB7A	O95365	584 aa		42.87	■■■■■ 4.45
CHKB-210	ENST00000484266	MSH5	O43196	834 aa		42.86	■■■■■ 4.45
CHKB-210	ENST00000484266	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		42.85	■■■■■ 4.45
CHKB-210	ENST00000484266	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	42.84	■■■■■ 4.45
CHKB-210	ENST00000484266	ADRA2B	P18089	450 aa		42.84	■■■■■ 4.45
CHKB-210	ENST00000484266	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		42.84	■■■■■ 4.45
CHKB-210	ENST00000484266	IL16	Q14005	1332 aa		42.83	■■■■■ 4.45
CHKB-210	ENST00000484266	MTFR1L	Q9H019	292 aa		42.83	■■■■■ 4.45
CHKB-210	ENST00000484266	LRP5	O75197	1615 aa		42.83	■■■■■ 4.45
CHKB-210	ENST00000484266	A1BG	P04217	495 aa		42.82	■■■■■ 4.45
CHKB-210	ENST00000484266	WDR63	Q8IWG1	891 aa		42.82	■■■■■ 4.45
CHKB-210	ENST00000484266	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		42.81	■■■■■ 4.44
CHKB-210	ENST00000484266	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	42.81	■■■■■ 4.44
CHKB-210	ENST00000484266	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	42.81	■■■■■ 4.44
CHKB-210	ENST00000484266	KRT24	Q2M2I5	525 aa		42.8	■■■■■ 4.44
CHKB-210	ENST00000484266	SPON1	Q9HCB6	807 aa		42.79	■■■■■ 4.44
CHKB-210	ENST00000484266	ZNF521	Q96K83	1311 aa		42.78	■■■■■ 4.44
CHKB-210	ENST00000484266	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	42.78	■■■■■ 4.44
CHKB-210	ENST00000484266	COL15A1	P39059	1388 aa		42.77	■■■■■ 4.44
CHKB-210	ENST00000484266	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	42.75	■■■■■ 4.43
CHKB-210	ENST00000484266	RFC4	P35249	363 aa		42.74	■■■■■ 4.43
CHKB-210	ENST00000484266	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	42.74	■■■■■ 4.43
CHKB-210	ENST00000484266	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	42.74	■■■■■ 4.43
CHKB-210	ENST00000484266	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	42.74	■■■■■ 4.43
CHKB-210	ENST00000484266	NBPF26	B4DH59	902 aa		42.72	■■■■■ 4.43
CHKB-210	ENST00000484266	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	42.72	■■■■■ 4.43
CHKB-210	ENST00000484266	NBPF15	Q8N660	670 aa		42.72	■■■■■ 4.43
CHKB-210	ENST00000484266	PTGER2	P43116	358 aa		42.71	■■■■■ 4.43
CHKB-210	ENST00000484266	MSL1	Q68DK7	614 aa		42.7	■■■■■ 4.43
CHKB-210	ENST00000484266	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		42.7	■■■■■ 4.43
CHKB-210	ENST00000484266	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	42.7	■■■■■ 4.43
CHKB-210	ENST00000484266	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		42.69	■■■■■ 4.42
CHKB-210	ENST00000484266	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	42.69	■■■■■ 4.42
CHKB-210	ENST00000484266	HOXB7	P09629	217 aa		42.68	■■■■■ 4.42
CHKB-210	ENST00000484266	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		42.68	■■■■■ 4.42
CHKB-210	ENST00000484266	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	42.68	■■■■■ 4.42
CHKB-210	ENST00000484266	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	42.68	■■■■■ 4.42
CHKB-210	ENST00000484266	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	42.67	■■■■■ 4.42
CHKB-210	ENST00000484266	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		42.66	■■■■■ 4.42
CHKB-210	ENST00000484266	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		42.65	■■■■■ 4.42
CHKB-210	ENST00000484266	ERBB4	Q15303	1308 aa		42.64	■■■■■ 4.42
CHKB-210	ENST00000484266		A0A087WZG4	1122 aa		42.64	■■■■■ 4.42
CHKB-210	ENST00000484266	GYS1	P13807	737 aa		42.64	■■■■■ 4.42
CHKB-210	ENST00000484266	NARF	Q9UHQ1	456 aa		42.63	■■■■■ 4.42
CHKB-210	ENST00000484266	SCN7A	Q01118	1682 aa		42.62	■■■■■ 4.41
CHKB-210	ENST00000484266	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	42.61	■■■■■ 4.41
CHKB-210	ENST00000484266	ZPR1	O75312	459 aa		42.61	■■■■■ 4.41
CHKB-210	ENST00000484266	NECTIN2	Q92692	538 aa		42.61	■■■■■ 4.41
CHKB-210	ENST00000484266	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		42.6	■■■■■ 4.41
CHKB-210	ENST00000484266	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	42.6	■■■■■ 4.41
CHKB-210	ENST00000484266	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		42.59	■■■■■ 4.41
CHKB-210	ENST00000484266	PDIA6	Q15084	440 aa		42.59	■■■■■ 4.41
CHKB-210	ENST00000484266	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		42.59	■■■■■ 4.41
CHKB-210	ENST00000484266	TSPYL6	Q8N831	410 aa		42.59	■■■■■ 4.41
CHKB-210	ENST00000484266	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		42.59	■■■■■ 4.41
CHKB-210	ENST00000484266	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		42.59	■■■■■ 4.41
CHKB-210	ENST00000484266	POLD1	P28340	1107 aa		42.58	■■■■■ 4.41
CHKB-210	ENST00000484266	GOLGA2	Q08379	1002 aa		42.58	■■■■■ 4.41
CHKB-210	ENST00000484266	MYL6B	P14649	208 aa		42.57	■■■■■ 4.41
CHKB-210	ENST00000484266	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		42.57	■■■■■ 4.41
CHKB-210	ENST00000484266	FKBP8	Q14318	412 aa		42.55	■■■■■ 4.4
CHKB-210	ENST00000484266	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	42.55	■■■■■ 4.4
CHKB-210	ENST00000484266	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		42.55	■■■■■ 4.4
CHKB-210	ENST00000484266	PROSER3	Q2NL68	480 aa		42.54	■■■■■ 4.4
CHKB-210	ENST00000484266	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		42.54	■■■■■ 4.4
CHKB-210	ENST00000484266	ARX	Q96QS3	562 aa		42.54	■■■■■ 4.4
CHKB-210	ENST00000484266	ANXA1	P04083	346 aa		42.53	■■■■■ 4.4
CHKB-210	ENST00000484266	CAMTA2	O94983	1202 aa		42.52	■■■■■ 4.4
CHKB-210	ENST00000484266	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	42.52	■■■■■ 4.4
CHKB-210	ENST00000484266	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		42.52	■■■■■ 4.4
CHKB-210	ENST00000484266	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	42.51	■■■■■ 4.4
CHKB-210	ENST00000484266	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	42.51	■■■■■ 4.4
CHKB-210	ENST00000484266	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	42.51	■■■■■ 4.4
CHKB-210	ENST00000484266		E9PSI1	815 aa		42.5	■■■■■ 4.39
CHKB-210	ENST00000484266	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	42.5	■■■■■ 4.39
CHKB-210	ENST00000484266	MMP10	P09238	476 aa		42.49	■■■■■ 4.39
CHKB-210	ENST00000484266	SLFN5	Q08AF3	891 aa		42.48	■■■■■ 4.39
CHKB-210	ENST00000484266	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		42.48	■■■■■ 4.39
CHKB-210	ENST00000484266	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	42.47	■■■■■ 4.39
CHKB-210	ENST00000484266	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		42.46	■■■■■ 4.39
CHKB-210	ENST00000484266	TM4SF1	P30408	202 aa		42.43	■■■■■ 4.38
CHKB-210	ENST00000484266	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		42.43	■■■■■ 4.38
CHKB-210	ENST00000484266	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		42.43	■■■■■ 4.38
CHKB-210	ENST00000484266	NUP98	P52948	1817 aa		42.41	■■■■■ 4.38
CHKB-210	ENST00000484266	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		42.41	■■■■■ 4.38

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