RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472760.1

PRPF40A-208, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF40A, Length 243 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-208ENST00000472760 STAG2Q8N3U4 1231 aa8.6□□□□□ -1.03
PRPF40A-208ENST00000472760 COL26A1Q96A83 441 aa8.6□□□□□ -1.03
PRPF40A-208ENST00000472760 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
PRPF40A-208ENST00000472760 SEPT3Q9UH03 358 aa8.6□□□□□ -1.03
PRPF40A-208ENST00000472760 NOS2P35228 1153 aa8.59□□□□□ -1.03
PRPF40A-208ENST00000472760 TEAD4Q15561 434 aa8.59□□□□□ -1.03
PRPF40A-208ENST00000472760 CAPN12Q6ZSI9 719 aa8.59□□□□□ -1.03
PRPF40A-208ENST00000472760 RHBDD1Q8TEB9 315 aa8.59□□□□□ -1.03
PRPF40A-208ENST00000472760 BMP1P13497 986 aa8.58□□□□□ -1.04
PRPF40A-208ENST00000472760 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PRPF40A-208ENST00000472760 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PRPF40A-208ENST00000472760 L3MBTL2Q969R5 705 aa8.58□□□□□ -1.04
PRPF40A-208ENST00000472760 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PRPF40A-208ENST00000472760 PARP3Q9Y6F1 533 aa8.58□□□□□ -1.04
PRPF40A-208ENST00000472760 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP8.57□□□□□ -1.04
PRPF40A-208ENST00000472760 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa8.57□□□□□ -1.04
PRPF40A-208ENST00000472760 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa8.57□□□□□ -1.04
PRPF40A-208ENST00000472760 TTLL8A6PVC2 850 aa8.56□□□□□ -1.04
PRPF40A-208ENST00000472760 EML1O00423 815 aa8.56□□□□□ -1.04
PRPF40A-208ENST00000472760 C4orf17Q53FE4 359 aa8.56□□□□□ -1.04
PRPF40A-208ENST00000472760 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa8.56□□□□□ -1.04
PRPF40A-208ENST00000472760 TRIM46Q7Z4K8 759 aa8.56□□□□□ -1.04
PRPF40A-208ENST00000472760 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa8.56□□□□□ -1.04
PRPF40A-208ENST00000472760 NGLY1Q96IV0 654 aa8.56□□□□□ -1.04
PRPF40A-208ENST00000472760 ANO2Q9NQ90 1003 aa8.56□□□□□ -1.04
PRPF40A-208ENST00000472760 EGFL7Q9UHF1 273 aa8.56□□□□□ -1.04
PRPF40A-208ENST00000472760 SOWAHDA6NJG2 315 aa8.55□□□□□ -1.04
PRPF40A-208ENST00000472760 PHKA2P46019 1235 aa8.55□□□□□ -1.04
PRPF40A-208ENST00000472760 PLA2G4AP47712 749 aa8.55□□□□□ -1.04
PRPF40A-208ENST00000472760 POU4F2Q12837 409 aa8.55□□□□□ -1.04
PRPF40A-208ENST00000472760 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
PRPF40A-208ENST00000472760 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa8.55□□□□□ -1.04
PRPF40A-208ENST00000472760 C16orf46Q6P387 395 aa8.55□□□□□ -1.04
PRPF40A-208ENST00000472760 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa8.55□□□□□ -1.04
PRPF40A-208ENST00000472760 CRIPAKQ8N1N5 446 aa8.55□□□□□ -1.04
PRPF40A-208ENST00000472760 RNF217Q8TC41 542 aa8.55□□□□□ -1.04
PRPF40A-208ENST00000472760 AIDAQ96BJ3 306 aa8.55□□□□□ -1.04
PRPF40A-208ENST00000472760 ZFP42Q96MM3 310 aa8.55□□□□□ -1.04
PRPF40A-208ENST00000472760 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
PRPF40A-208ENST00000472760 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
PRPF40A-208ENST00000472760 FIGNL2A6NMB9 653 aa8.54□□□□□ -1.04
PRPF40A-208ENST00000472760 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa8.54□□□□□ -1.04
PRPF40A-208ENST00000472760 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PRPF40A-208ENST00000472760 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP8.54□□□□□ -1.04
PRPF40A-208ENST00000472760 POTEAQ6S8J7 498 aa8.54□□□□□ -1.04
PRPF40A-208ENST00000472760 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa8.54□□□□□ -1.04
PRPF40A-208ENST00000472760 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PRPF40A-208ENST00000472760 H3BRB1 525 aa8.53□□□□□ -1.04
PRPF40A-208ENST00000472760 ICMTO60725 284 aa8.53□□□□□ -1.04
PRPF40A-208ENST00000472760 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PRPF40A-208ENST00000472760 GLYCTKQ8IVS8 523 aa8.53□□□□□ -1.04
PRPF40A-208ENST00000472760 HELQQ8TDG4 1101 aa8.53□□□□□ -1.04
PRPF40A-208ENST00000472760 PHACTR1Q9C0D0 580 aa8.53□□□□□ -1.04
PRPF40A-208ENST00000472760 SAP130Q9H0E3 1048 aa8.53□□□□□ -1.04
PRPF40A-208ENST00000472760 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PRPF40A-208ENST00000472760 AAASQ9NRG9 546 aa8.53□□□□□ -1.04
PRPF40A-208ENST00000472760 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PRPF40A-208ENST00000472760 ST8SIA5O15466 376 aa8.52□□□□□ -1.05
PRPF40A-208ENST00000472760 RHOQP17081 205 aa8.52□□□□□ -1.05
PRPF40A-208ENST00000472760 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PRPF40A-208ENST00000472760 MTMR3Q13615 1198 aa8.52□□□□□ -1.05
PRPF40A-208ENST00000472760 CCDC27Q2M243 656 aa8.52□□□□□ -1.05
PRPF40A-208ENST00000472760 NBPF1Q3BBV0 1214 aa8.52□□□□□ -1.05
PRPF40A-208ENST00000472760 COX20Q5RI15 118 aa8.52□□□□□ -1.05
PRPF40A-208ENST00000472760 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PRPF40A-208ENST00000472760 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PRPF40A-208ENST00000472760 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa8.52□□□□□ -1.05
PRPF40A-208ENST00000472760 TXLNAP40222 546 aa8.51□□□□□ -1.05
PRPF40A-208ENST00000472760 RTN1Q16799 776 aa8.51□□□□□ -1.05
PRPF40A-208ENST00000472760 WDR44Q5JSH3 913 aa8.51□□□□□ -1.05
PRPF40A-208ENST00000472760 C1orf53Q5VUE5 145 aa8.51□□□□□ -1.05
PRPF40A-208ENST00000472760 TATP17735 454 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PRPF40A-208ENST00000472760 MYO19Q96H55 970 aa8.5□□□□□ -1.05
PRPF40A-208ENST00000472760 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa8.5□□□□□ -1.05
PRPF40A-208ENST00000472760 MAN1A2O60476 641 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF40A-208ENST00000472760 FAM13AO94988 1023 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF40A-208ENST00000472760 RHPN1Q8TCX5 695 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF40A-208ENST00000472760 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF40A-208ENST00000472760 STIM2Q9P246 746 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF40A-208ENST00000472760 LRFN2Q9ULH4 789 aa8.49□□□□□ -1.05
PRPF40A-208ENST00000472760 BRD2P25440 801 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PRPF40A-208ENST00000472760 DGKZQ13574 1117 aa8.48□□□□□ -1.05
PRPF40A-208ENST00000472760 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP8.48□□□□□ -1.058e-9■□□□□ 8.6
PRPF40A-208ENST00000472760 C11orf91Q3C1V1 193 aa8.48□□□□□ -1.05
PRPF40A-208ENST00000472760 BICDL1Q6ZP65 573 aa8.48□□□□□ -1.05
PRPF40A-208ENST00000472760 DACH1Q9UI36 760 aa8.48□□□□□ -1.05
PRPF40A-208ENST00000472760 DNMT3LQ9UJW3 386 aa8.48□□□□□ -1.05
PRPF40A-208ENST00000472760 A0A1B0GTH6 734 aa8.47□□□□□ -1.05
PRPF40A-208ENST00000472760 MPSTP25325 297 aa8.47□□□□□ -1.05
PRPF40A-208ENST00000472760 ABTB2Q8N961 1025 aa8.47□□□□□ -1.05
PRPF40A-208ENST00000472760 NEUROD4Q9HD90 331 aa8.47□□□□□ -1.05
PRPF40A-208ENST00000472760 KLK14Q9P0G3 267 aa8.47□□□□□ -1.05
PRPF40A-208ENST00000472760 TNFRSF10BO14763 440 aa8.46□□□□□ -1.06
PRPF40A-208ENST00000472760 NPR3P17342 541 aa8.46□□□□□ -1.06
PRPF40A-208ENST00000472760 AAMPQ13685 434 aa8.46□□□□□ -1.06
PRPF40A-208ENST00000472760 HIF1AQ16665 826 aa8.46□□□□□ -1.06
PRPF40A-208ENST00000472760 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
PRPF40A-208ENST00000472760 IFT43Q96FT9 208 aa8.46□□□□□ -1.06
PRPF40A-208ENST00000472760 SENP2Q9HC62 589 aa8.46□□□□□ -1.06
PRPF40A-208ENST00000472760 MSX1P28360 303 aa8.45□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 141.2 ms