RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, human

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP4-208	ENST00000462602	HYPK	Q9NX55	129 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	BCAR3	O75815	825 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	A1BG	P04217	495 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	KIF16B	Q96L93	1317 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		12	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		12	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		12	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		12	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	MYL6B	P14649	208 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	PDIA6	Q15084	440 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	PROM2	Q8N271	834 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	LY75	O60449	1722 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	C5	P01031	1676 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	PTPRC	P08575	1304 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	NBPF26	B4DH59	902 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	MS4A1	P11836	297 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	KCNQ4	P56696	695 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	FLII	Q13045	1269 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	NBPF14	Q5TI25	921 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	NBPF15	Q8N660	670 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		11.98	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602		A0A087WZG4	1122 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	RPS6KA4	O75676	772 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	ANXA1	P04083	346 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	PROSER3	Q2NL68	480 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	11.97	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	AK7	Q96M32	723 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	TJP1	Q07157	1748 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	CACNA1F	O60840	1977 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	GNPAT	O15228	680 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	COPS6	Q7L5N1	327 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	G2E3	Q7L622	706 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
SH3BP4-208	ENST00000462602	EP400	Q96L91	3159 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SH3BP4-208	ENST00000462602	ADRA2B	P18089	450 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SH3BP4-208	ENST00000462602	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
SH3BP4-208	ENST00000462602	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SH3BP4-208	ENST00000462602	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SH3BP4-208	ENST00000462602	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
SH3BP4-208	ENST00000462602	PDE3A	Q14432	1141 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SH3BP4-208	ENST00000462602	KSR2	Q6VAB6	950 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SH3BP4-208	ENST00000462602	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SH3BP4-208	ENST00000462602	ILDR2	Q71H61	639 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SH3BP4-208	ENST00000462602	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SH3BP4-208	ENST00000462602	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
SH3BP4-208	ENST00000462602	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SH3BP4-208	ENST00000462602	ARX	Q96QS3	562 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SH3BP4-208	ENST00000462602	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SH3BP4-208	ENST00000462602	PLIN1	O60240	522 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SH3BP4-208	ENST00000462602	TRIM27	P14373	513 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SH3BP4-208	ENST00000462602	SSFA2	P28290	1259 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SH3BP4-208	ENST00000462602	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SH3BP4-208	ENST00000462602	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
SH3BP4-208	ENST00000462602	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
SH3BP4-208	ENST00000462602	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SH3BP4-208	ENST00000462602	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SH3BP4-208	ENST00000462602	AKT1S1	Q96B36	256 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SH3BP4-208	ENST00000462602	STK32B	Q9NY57	414 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SH3BP4-208	ENST00000462602	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
SH3BP4-208	ENST00000462602	C4B	P0C0L5	1744 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SH3BP4-208	ENST00000462602	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SH3BP4-208	ENST00000462602	RGL2	O15211	777 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SH3BP4-208	ENST00000462602	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		11.92	□□□□□ -0.5

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