RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461448.5

SNHG12-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 12, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SNHG12, Length 1,629 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12-201ENST00000461448 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
SNHG12-201ENST00000461448 CRKLP46109 303 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
SNHG12-201ENST00000461448 RREB1Q92766 1687 aa25.2■■□□□ 1.63
SNHG12-201ENST00000461448 C5P01031 1676 aa25.2■■□□□ 1.62
SNHG12-201ENST00000461448 A1BGP04217 495 aa25.19■■□□□ 1.62
SNHG12-201ENST00000461448 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa25.19■■□□□ 1.62
SNHG12-201ENST00000461448 AK7Q96M32 723 aa25.19■■□□□ 1.62
SNHG12-201ENST00000461448 CCDC87Q9NVE4 849 aa25.19■■□□□ 1.62
SNHG12-201ENST00000461448 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa25.19■■□□□ 1.62
SNHG12-201ENST00000461448 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
SNHG12-201ENST00000461448 VAMP4O75379 141 aa25.18■■□□□ 1.62
SNHG12-201ENST00000461448 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
SNHG12-201ENST00000461448 NBPF14Q5TI25 921 aa25.18■■□□□ 1.62
SNHG12-201ENST00000461448 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
SNHG12-201ENST00000461448 STK32BQ9NY57 414 aa25.18■■□□□ 1.62
SNHG12-201ENST00000461448 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
SNHG12-201ENST00000461448 CANXP27824 592 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
SNHG12-201ENST00000461448 TAF1LQ8IZX4 1826 aa25.17■■□□□ 1.62
SNHG12-201ENST00000461448 NUP188Q5SRE5 1749 aa25.16■■□□□ 1.62
SNHG12-201ENST00000461448 GNPATO15228 680 aa25.16■■□□□ 1.62
SNHG12-201ENST00000461448 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
SNHG12-201ENST00000461448 ZNF827Q17R98 1081 aa25.16■■□□□ 1.62
SNHG12-201ENST00000461448 AKT1S1Q96B36 256 aa25.16■■□□□ 1.62
SNHG12-201ENST00000461448 ZNF428Q96B54 188 aa25.16■■□□□ 1.62
SNHG12-201ENST00000461448 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
SNHG12-201ENST00000461448 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa25.16■■□□□ 1.62
SNHG12-201ENST00000461448 C4BP0C0L5 1744 aa25.16■■□□□ 1.62
SNHG12-201ENST00000461448 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
SNHG12-201ENST00000461448 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa25.15■■□□□ 1.62
SNHG12-201ENST00000461448 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
SNHG12-201ENST00000461448 SLC15A2Q16348 729 aa25.14■■□□□ 1.61
SNHG12-201ENST00000461448 CCDC30Q5VVM6 783 aa25.14■■□□□ 1.61
SNHG12-201ENST00000461448 LAMB4A4D0S4 1761 aa25.14■■□□□ 1.61
SNHG12-201ENST00000461448 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
SNHG12-201ENST00000461448 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
SNHG12-201ENST00000461448 NBPF26B4DH59 902 aa25.12■■□□□ 1.61
SNHG12-201ENST00000461448 RPS6KA4O75676 772 aa25.12■■□□□ 1.61
SNHG12-201ENST00000461448 MYL6BP14649 208 aa25.12■■□□□ 1.61
SNHG12-201ENST00000461448 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
SNHG12-201ENST00000461448 NBPF15Q8N660 670 aa25.12■■□□□ 1.61
SNHG12-201ENST00000461448 CHPF2Q9P2E5 772 aa25.12■■□□□ 1.61
SNHG12-201ENST00000461448 ERBB4Q15303 1308 aa25.12■■□□□ 1.61
SNHG12-201ENST00000461448 SMIM5Q71RC9 77 aa25.12■■□□□ 1.61
SNHG12-201ENST00000461448 PHF14O94880 888 aa25.11■■□□□ 1.61
SNHG12-201ENST00000461448 ANXA1P04083 346 aa25.11■■□□□ 1.61
SNHG12-201ENST00000461448 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
SNHG12-201ENST00000461448 STK31Q9BXU1 1019 aa25.11■■□□□ 1.61
SNHG12-201ENST00000461448 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
SNHG12-201ENST00000461448 PDIA6Q15084 440 aa25.1■■□□□ 1.61
SNHG12-201ENST00000461448 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP25.1■■□□□ 1.61
SNHG12-201ENST00000461448 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
SNHG12-201ENST00000461448 PROSER3Q2NL68 480 aa25.09■■□□□ 1.61
SNHG12-201ENST00000461448 AMIGO3Q86WK7 504 aa25.09■■□□□ 1.61
SNHG12-201ENST00000461448 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
SNHG12-201ENST00000461448 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.6
SNHG12-201ENST00000461448 EIF5P55010 431 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.6
SNHG12-201ENST00000461448 TRAPPC3LQ5T215 181 aa25.08■■□□□ 1.6
SNHG12-201ENST00000461448 ARXQ96QS3 562 aa25.08■■□□□ 1.6
SNHG12-201ENST00000461448 ALDH1L2Q3SY69 923 aa25.07■■□□□ 1.6
SNHG12-201ENST00000461448 MSH5O43196 834 aa25.06■■□□□ 1.6
SNHG12-201ENST00000461448 SLC4A2P04920 1241 aa25.06■■□□□ 1.6
SNHG12-201ENST00000461448 SSFA2P28290 1259 aa25.06■■□□□ 1.6
SNHG12-201ENST00000461448 HYPKQ9NX55 129 aa25.06■■□□□ 1.6
SNHG12-201ENST00000461448 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
SNHG12-201ENST00000461448 FLAD1Q8NFF5 587 aa25.05■■□□□ 1.6
SNHG12-201ENST00000461448 COL15A1P39059 1388 aa25.05■■□□□ 1.6
SNHG12-201ENST00000461448 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
SNHG12-201ENST00000461448 RCAN3Q9UKA8 241 aa25.04■■□□□ 1.6
SNHG12-201ENST00000461448 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa25.04■■□□□ 1.6
SNHG12-201ENST00000461448 A0A087WZG4 1122 aa25.04■■□□□ 1.6
SNHG12-201ENST00000461448 ADRA2BP18089 450 aa25.04■■□□□ 1.6
SNHG12-201ENST00000461448 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
SNHG12-201ENST00000461448 SSH1Q8WYL5 1049 aa25.04■■□□□ 1.6
SNHG12-201ENST00000461448 RFC4P35249 363 aa25.03■■□□□ 1.6
SNHG12-201ENST00000461448 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
SNHG12-201ENST00000461448 BCL2L13Q9BXK5 485 aa25.03■■□□□ 1.6
SNHG12-201ENST00000461448 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
SNHG12-201ENST00000461448 RARSP54136 660 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
SNHG12-201ENST00000461448 COPS6Q7L5N1 327 aa25.02■■□□□ 1.6
SNHG12-201ENST00000461448 LRP10Q7Z4F1 713 aa25.02■■□□□ 1.6
SNHG12-201ENST00000461448 XAGE3Q8WTP9 111 aa25.02■■□□□ 1.6
SNHG12-201ENST00000461448 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
SNHG12-201ENST00000461448 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa25.02■■□□□ 1.6
SNHG12-201ENST00000461448 UBR3Q6ZT12 1888 aa25.02■■□□□ 1.6
SNHG12-201ENST00000461448 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
SNHG12-201ENST00000461448 SMC4Q9NTJ3 1288 aa25.01■■□□□ 1.59
SNHG12-201ENST00000461448 TTLL7Q6ZT98 887 aa25.01■■□□□ 1.59
SNHG12-201ENST00000461448 G2E3Q7L622 706 aa25■■□□□ 1.59
SNHG12-201ENST00000461448 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
SNHG12-201ENST00000461448 ZPR1O75312 459 aa24.99■■□□□ 1.59
SNHG12-201ENST00000461448 KIF6Q6ZMV9 814 aa24.99■■□□□ 1.59
SNHG12-201ENST00000461448 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa24.98■■□□□ 1.59
SNHG12-201ENST00000461448 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
SNHG12-201ENST00000461448 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
SNHG12-201ENST00000461448 NARFQ9UHQ1 456 aa24.97■■□□□ 1.59
SNHG12-201ENST00000461448 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
SNHG12-201ENST00000461448 USPL1Q5W0Q7 1092 aa24.97■■□□□ 1.59
SNHG12-201ENST00000461448 BCAR3O75815 825 aa24.96■■□□□ 1.59
SNHG12-201ENST00000461448 FLIIQ13045 1269 aa24.96■■□□□ 1.59
SNHG12-201ENST00000461448 ZBTB3Q9H5J0 574 aa24.96■■□□□ 1.59
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