RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446285.5

ODC1-204, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ODC1, Length 665 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-204ENST00000446285 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP35.53■■■■□ 3.28
ODC1-204ENST00000446285 FKBP8Q14318 412 aa35.53■■■■□ 3.28
ODC1-204ENST00000446285 FMNL2Q96PY5 1086 aa35.53■■■■□ 3.28
ODC1-204ENST00000446285 NEFMP07197 916 aa35.52■■■■□ 3.28
ODC1-204ENST00000446285 NARFQ9UHQ1 456 aa35.52■■■■□ 3.28
ODC1-204ENST00000446285 BTBD11A6QL63 1104 aa35.5■■■■□ 3.27
ODC1-204ENST00000446285 RALBP1Q15311 655 aa35.49■■■■□ 3.27
ODC1-204ENST00000446285 USPL1Q5W0Q7 1092 aa35.49■■■■□ 3.27
ODC1-204ENST00000446285 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP35.48■■■■□ 3.27
ODC1-204ENST00000446285 A0A087WZG4 1122 aa35.47■■■■□ 3.27
ODC1-204ENST00000446285 TM4SF1P30408 202 aa35.46■■■■□ 3.27
ODC1-204ENST00000446285 DDR1Q08345 913 aa35.46■■■■□ 3.27
ODC1-204ENST00000446285 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP35.46■■■■□ 3.27
ODC1-204ENST00000446285 CANXP27824 592 aaKnown RBP35.45■■■■□ 3.27
ODC1-204ENST00000446285 EIF5P55010 431 aaKnown RBP35.45■■■■□ 3.27
ODC1-204ENST00000446285 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP35.43■■■■□ 3.26
ODC1-204ENST00000446285 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP35.43■■■■□ 3.26
ODC1-204ENST00000446285 MCM10Q7L590 875 aa35.43■■■■□ 3.26
ODC1-204ENST00000446285 WWC3Q9ULE0 1092 aa35.42■■■■□ 3.26
ODC1-204ENST00000446285 A0A0G2JLW4 131 aa35.41■■■■□ 3.26
ODC1-204ENST00000446285 DPEP1P16444 411 aa35.4■■■■□ 3.26
ODC1-204ENST00000446285 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP35.4■■■■□ 3.26
ODC1-204ENST00000446285 DLG5Q8TDM6 1919 aa35.4■■■■□ 3.26
ODC1-204ENST00000446285 KCNQ3O43525 872 aa35.38■■■■□ 3.25
ODC1-204ENST00000446285 NFIXQ14938 502 aa35.38■■■■□ 3.25
ODC1-204ENST00000446285 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP35.38■■■■□ 3.25
ODC1-204ENST00000446285 PLEKHF1Q96S99 279 aa35.38■■■■□ 3.25
ODC1-204ENST00000446285 NRXN2Q9P2S2 1712 aa35.37■■■■□ 3.25
ODC1-204ENST00000446285 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP35.37■■■■□ 3.25
ODC1-204ENST00000446285 BCL2L12Q9HB09 334 aa35.37■■■■□ 3.25
ODC1-204ENST00000446285 BCS1LQ9Y276 419 aa35.37■■■■□ 3.25
ODC1-204ENST00000446285 SCN7AQ01118 1682 aa35.37■■■■□ 3.25
ODC1-204ENST00000446285 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP35.36■■■■□ 3.25
ODC1-204ENST00000446285 DCTN1Q14203 1278 aa35.36■■■■□ 3.25
ODC1-204ENST00000446285 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa35.35■■■■□ 3.25
ODC1-204ENST00000446285 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP35.35■■■■□ 3.25
ODC1-204ENST00000446285 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP35.35■■■■□ 3.25
ODC1-204ENST00000446285 ADCY9O60503 1353 aa35.35■■■■□ 3.25
ODC1-204ENST00000446285 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa35.34■■■■□ 3.25
ODC1-204ENST00000446285 PIM2Q9P1W9 311 aa35.34■■■■□ 3.25
ODC1-204ENST00000446285 ATP10DQ9P241 1426 aa35.33■■■■□ 3.25
ODC1-204ENST00000446285 KCNA3P22001 575 aa35.33■■■■□ 3.25
ODC1-204ENST00000446285 NFE2L2Q16236 605 aa35.33■■■■□ 3.25
ODC1-204ENST00000446285 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP35.32■■■■□ 3.24
ODC1-204ENST00000446285 A1BGP04217 495 aa35.31■■■■□ 3.24
ODC1-204ENST00000446285 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP35.31■■■■□ 3.24
ODC1-204ENST00000446285 SERPINB2P05120 415 aa35.3■■■■□ 3.24
ODC1-204ENST00000446285 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP35.3■■■■□ 3.24
ODC1-204ENST00000446285 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP35.29■■■■□ 3.24
ODC1-204ENST00000446285 USP16Q9Y5T5 823 aa35.29■■■■□ 3.24
ODC1-204ENST00000446285 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP35.28■■■■□ 3.24
ODC1-204ENST00000446285 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa35.27■■■■□ 3.24
ODC1-204ENST00000446285 KDM3BQ7LBC6 1761 aa35.27■■■■□ 3.24
ODC1-204ENST00000446285 BCORQ6W2J9 1755 aa35.25■■■■□ 3.23
ODC1-204ENST00000446285 LAMB4A4D0S4 1761 aa35.25■■■■□ 3.23
ODC1-204ENST00000446285 CARMIL3Q8ND23 1372 aa35.24■■■■□ 3.23
ODC1-204ENST00000446285 CHRNA5P30532 468 aa35.23■■■■□ 3.23
ODC1-204ENST00000446285 C1QTNF8P60827 252 aa35.23■■■■□ 3.23
ODC1-204ENST00000446285 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa35.23■■■■□ 3.23
ODC1-204ENST00000446285 DLEC1Q9Y238 1755 aa35.23■■■■□ 3.23
ODC1-204ENST00000446285 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa35.22■■■■□ 3.23
ODC1-204ENST00000446285 CAMTA2O94983 1202 aa35.22■■■■□ 3.23
ODC1-204ENST00000446285 TBC1D9BQ66K14 1250 aa35.22■■■■□ 3.23
ODC1-204ENST00000446285 BICDL1Q6ZP65 573 aa35.22■■■■□ 3.23
ODC1-204ENST00000446285 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP35.22■■■■□ 3.23
ODC1-204ENST00000446285 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP35.22■■■■□ 3.23
ODC1-204ENST00000446285 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa35.2■■■■□ 3.23
ODC1-204ENST00000446285 RGL2O15211 777 aa35.19■■■■□ 3.22
ODC1-204ENST00000446285 CLEC4GQ6UXB4 293 aa35.18■■■■□ 3.22
ODC1-204ENST00000446285 SETDB2Q96T68 719 aa35.18■■■■□ 3.22
ODC1-204ENST00000446285 MIS18AQ9NYP9 233 aa35.18■■■■□ 3.22
ODC1-204ENST00000446285 LMOD3Q0VAK6 560 aa35.17■■■■□ 3.22
ODC1-204ENST00000446285 ZNF652Q9Y2D9 606 aa35.17■■■■□ 3.22
ODC1-204ENST00000446285 H0YIN7 160 aa35.15■■■■□ 3.22
ODC1-204ENST00000446285 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP35.14■■■■□ 3.22
ODC1-204ENST00000446285 RIPK4P57078 832 aa35.14■■■■□ 3.22
ODC1-204ENST00000446285 C2CD5Q86YS7 1000 aa35.14■■■■□ 3.22
ODC1-204ENST00000446285 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP35.14■■■■□ 3.22
ODC1-204ENST00000446285 BRIP1Q9BX63 1249 aa35.14■■■■□ 3.22
ODC1-204ENST00000446285 NBPF26B4DH59 902 aa35.13■■■■□ 3.21
ODC1-204ENST00000446285 PDE6BP35913 854 aa35.13■■■■□ 3.21
ODC1-204ENST00000446285 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP35.13■■■■□ 3.21
ODC1-204ENST00000446285 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP35.13■■■■□ 3.21
ODC1-204ENST00000446285 NBPF15Q8N660 670 aa35.13■■■■□ 3.21
ODC1-204ENST00000446285 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa35.13■■■■□ 3.21
ODC1-204ENST00000446285 PRR5LQ6MZQ0 368 aa35.12■■■■□ 3.21
ODC1-204ENST00000446285 BABAM1Q9NWV8 329 aa35.12■■■■□ 3.21
ODC1-204ENST00000446285 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP35.11■■■■□ 3.21
ODC1-204ENST00000446285 TTLL6Q8N841 843 aa35.11■■■■□ 3.21
ODC1-204ENST00000446285 CNBD1Q8NA66 436 aa35.11■■■■□ 3.21
ODC1-204ENST00000446285 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP35.1■■■■□ 3.21
ODC1-204ENST00000446285 TMPOP42166 694 aaKnown RBP35.1■■■■□ 3.21
ODC1-204ENST00000446285 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP35.1■■■■□ 3.21
ODC1-204ENST00000446285 NPHP1O15259 732 aa35.09■■■■□ 3.21
ODC1-204ENST00000446285 ST5P78524 1137 aa35.09■■■■□ 3.21
ODC1-204ENST00000446285 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP35.09■■■■□ 3.21
ODC1-204ENST00000446285 TSPYL4Q9UJ04 414 aa35.07■■■■□ 3.2
ODC1-204ENST00000446285 C9orf131Q5VYM1 1079 aa35.06■■■■□ 3.2
ODC1-204ENST00000446285 RUNDC1Q96C34 613 aa35.05■■■■□ 3.2
ODC1-204ENST00000446285 SBF1O95248 1867 aa35.05■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.3 ms