RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421087.5

SPRED2-202, Transcript of sprouty related EVH1 domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene SPRED2, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRED2-202ENST00000421087 MCM10Q7L590 875 aa25.38■■□□□ 1.65
SPRED2-202ENST00000421087 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
SPRED2-202ENST00000421087 FKBP8Q14318 412 aa25.36■■□□□ 1.65
SPRED2-202ENST00000421087 PLEKHF1Q96S99 279 aa25.36■■□□□ 1.65
SPRED2-202ENST00000421087 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
SPRED2-202ENST00000421087 C10orf71Q711Q0 1435 aa25.36■■□□□ 1.65
SPRED2-202ENST00000421087 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
SPRED2-202ENST00000421087 DLG5Q8TDM6 1919 aa25.34■■□□□ 1.65
SPRED2-202ENST00000421087 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
SPRED2-202ENST00000421087 DCTN1Q14203 1278 aa25.34■■□□□ 1.65
SPRED2-202ENST00000421087 USPL1Q5W0Q7 1092 aa25.34■■□□□ 1.65
SPRED2-202ENST00000421087 NARFQ9UHQ1 456 aa25.34■■□□□ 1.65
SPRED2-202ENST00000421087 KCNQ3O43525 872 aa25.33■■□□□ 1.65
SPRED2-202ENST00000421087 CANXP27824 592 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
SPRED2-202ENST00000421087 TGFB2P61812 414 aa25.33■■□□□ 1.65
SPRED2-202ENST00000421087 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa25.33■■□□□ 1.64
SPRED2-202ENST00000421087 PXDNLA1KZ92 1463 aa25.32■■□□□ 1.64
SPRED2-202ENST00000421087 EIF5P55010 431 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
SPRED2-202ENST00000421087 NFE2L2Q16236 605 aa25.31■■□□□ 1.64
SPRED2-202ENST00000421087 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa25.3■■□□□ 1.64
SPRED2-202ENST00000421087 A0A087WZG4 1122 aa25.3■■□□□ 1.64
SPRED2-202ENST00000421087 DDR1Q08345 913 aa25.3■■□□□ 1.64
SPRED2-202ENST00000421087 TM4SF1P30408 202 aa25.29■■□□□ 1.64
SPRED2-202ENST00000421087 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
SPRED2-202ENST00000421087 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
SPRED2-202ENST00000421087 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
SPRED2-202ENST00000421087 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
SPRED2-202ENST00000421087 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
SPRED2-202ENST00000421087 WWC3Q9ULE0 1092 aa25.27■■□□□ 1.64
SPRED2-202ENST00000421087 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
SPRED2-202ENST00000421087 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
SPRED2-202ENST00000421087 A0A0G2JLW4 131 aa25.25■■□□□ 1.63
SPRED2-202ENST00000421087 NFIXQ14938 502 aa25.25■■□□□ 1.63
SPRED2-202ENST00000421087 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
SPRED2-202ENST00000421087 BCL2L12Q9HB09 334 aa25.25■■□□□ 1.63
SPRED2-202ENST00000421087 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
SPRED2-202ENST00000421087 A1BGP04217 495 aa25.24■■□□□ 1.63
SPRED2-202ENST00000421087 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
SPRED2-202ENST00000421087 USP16Q9Y5T5 823 aa25.24■■□□□ 1.63
SPRED2-202ENST00000421087 SCN7AQ01118 1682 aa25.23■■□□□ 1.63
SPRED2-202ENST00000421087 DPEP1P16444 411 aa25.23■■□□□ 1.63
SPRED2-202ENST00000421087 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
SPRED2-202ENST00000421087 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
SPRED2-202ENST00000421087 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa25.22■■□□□ 1.63
SPRED2-202ENST00000421087 KDM3BQ7LBC6 1761 aa25.22■■□□□ 1.63
SPRED2-202ENST00000421087 NRXN2Q9P2S2 1712 aa25.21■■□□□ 1.63
SPRED2-202ENST00000421087 MIS18AQ9NYP9 233 aa25.21■■□□□ 1.63
SPRED2-202ENST00000421087 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa25.21■■□□□ 1.63
SPRED2-202ENST00000421087 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP25.2■■□□□ 1.62
SPRED2-202ENST00000421087 BCS1LQ9Y276 419 aa25.2■■□□□ 1.62
SPRED2-202ENST00000421087 SERPINB2P05120 415 aa25.19■■□□□ 1.62
SPRED2-202ENST00000421087 RIPK4P57078 832 aa25.19■■□□□ 1.62
SPRED2-202ENST00000421087 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
SPRED2-202ENST00000421087 LAMB4A4D0S4 1761 aa25.18■■□□□ 1.62
SPRED2-202ENST00000421087 KCNA3P22001 575 aa25.18■■□□□ 1.62
SPRED2-202ENST00000421087 LMOD3Q0VAK6 560 aa25.18■■□□□ 1.62
SPRED2-202ENST00000421087 TMPOP42166 694 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
SPRED2-202ENST00000421087 BICDL1Q6ZP65 573 aa25.17■■□□□ 1.62
SPRED2-202ENST00000421087 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
SPRED2-202ENST00000421087 PIM2Q9P1W9 311 aa25.17■■□□□ 1.62
SPRED2-202ENST00000421087 BCORQ6W2J9 1755 aa25.16■■□□□ 1.62
SPRED2-202ENST00000421087 CAMTA2O94983 1202 aa25.16■■□□□ 1.62
SPRED2-202ENST00000421087 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
SPRED2-202ENST00000421087 TBC1D9BQ66K14 1250 aa25.16■■□□□ 1.62
SPRED2-202ENST00000421087 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
SPRED2-202ENST00000421087 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa25.14■■□□□ 1.62
SPRED2-202ENST00000421087 CCDC146Q8IYE0 955 aa25.14■■□□□ 1.62
SPRED2-202ENST00000421087 RUNDC1Q96C34 613 aa25.14■■□□□ 1.62
SPRED2-202ENST00000421087 CARMIL3Q8ND23 1372 aa25.14■■□□□ 1.61
SPRED2-202ENST00000421087 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
SPRED2-202ENST00000421087 CHRNA5P30532 468 aa25.13■■□□□ 1.61
SPRED2-202ENST00000421087 NBPF26B4DH59 902 aa25.12■■□□□ 1.61
SPRED2-202ENST00000421087 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
SPRED2-202ENST00000421087 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
SPRED2-202ENST00000421087 NBPF15Q8N660 670 aa25.12■■□□□ 1.61
SPRED2-202ENST00000421087 TSPYL4Q9UJ04 414 aa25.12■■□□□ 1.61
SPRED2-202ENST00000421087 ADAMTS8Q9UP79 889 aa25.12■■□□□ 1.61
SPRED2-202ENST00000421087 ADCY9O60503 1353 aa25.11■■□□□ 1.61
SPRED2-202ENST00000421087 CLEC4GQ6UXB4 293 aa25.11■■□□□ 1.61
SPRED2-202ENST00000421087 SETDB2Q96T68 719 aa25.11■■□□□ 1.61
SPRED2-202ENST00000421087 BABAM1Q9NWV8 329 aa25.11■■□□□ 1.61
SPRED2-202ENST00000421087 ZNF652Q9Y2D9 606 aa25.11■■□□□ 1.61
SPRED2-202ENST00000421087 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
SPRED2-202ENST00000421087 ATP10DQ9P241 1426 aa25.1■■□□□ 1.61
SPRED2-202ENST00000421087 RGL2O15211 777 aa25.09■■□□□ 1.61
SPRED2-202ENST00000421087 NEUROD2Q15784 382 aa25.09■■□□□ 1.61
SPRED2-202ENST00000421087 DLEC1Q9Y238 1755 aa25.08■■□□□ 1.61
SPRED2-202ENST00000421087 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa25.08■■□□□ 1.61
SPRED2-202ENST00000421087 PRR5LQ6MZQ0 368 aa25.07■■□□□ 1.6
SPRED2-202ENST00000421087 CNBD1Q8NA66 436 aa25.06■■□□□ 1.6
SPRED2-202ENST00000421087 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa25.06■■□□□ 1.6
SPRED2-202ENST00000421087 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa25.05■■□□□ 1.6
SPRED2-202ENST00000421087 H0YIN7 160 aa25.05■■□□□ 1.6
SPRED2-202ENST00000421087 NPHP1O15259 732 aa25.05■■□□□ 1.6
SPRED2-202ENST00000421087 C2CD5Q86YS7 1000 aa25.05■■□□□ 1.6
SPRED2-202ENST00000421087 BRIP1Q9BX63 1249 aa25.05■■□□□ 1.6
SPRED2-202ENST00000421087 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
SPRED2-202ENST00000421087 PDE6BP35913 854 aa25.04■■□□□ 1.6
SPRED2-202ENST00000421087 TRIM35Q9UPQ4 493 aa25.04■■□□□ 1.6
SPRED2-202ENST00000421087 ERBB4Q15303 1308 aa25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms