RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419253.1

TTC28-AS1-203, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTC28-AS1, Length 846 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CANXP27824 592 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NEUROD2Q15784 382 aa16.33■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ADAMTS8Q9UP79 889 aa16.33■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KCNQ3O43525 872 aa16.32■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TMPOP42166 694 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MMP10P09238 476 aa16.31■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MIS18AQ9NYP9 233 aa16.31■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa16.31■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-203ENST00000419253 A0A087WZG4 1122 aa16.3■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GYS1P13807 737 aa16.3■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-203ENST00000419253 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PARP3Q9Y6F1 533 aa16.3■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GPR162Q16538 588 aa16.29■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CD2APQ9Y5K6 639 aa16.29■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-203ENST00000419253 COL15A1P39059 1388 aa16.28■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-203ENST00000419253 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TSPYL4Q9UJ04 414 aa16.28■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-203ENST00000419253 C4AP0C0L4 1744 aa16.28■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-203ENST00000419253 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-203ENST00000419253 USPL1Q5W0Q7 1092 aa16.27■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MRS2Q9HD23 443 aa16.27■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NARFQ9UHQ1 456 aa16.27■□□□□ 0.2
TTC28-AS1-203ENST00000419253 A1BGP04217 495 aa16.26■□□□□ 0.19
TTC28-AS1-203ENST00000419253 EIF5P55010 431 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NLGN2Q8NFZ4 835 aa16.26■□□□□ 0.19
TTC28-AS1-203ENST00000419253 USP16Q9Y5T5 823 aa16.26■□□□□ 0.19
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FKBP8Q14318 412 aa16.25■□□□□ 0.19
TTC28-AS1-203ENST00000419253 BABAM1Q9NWV8 329 aa16.25■□□□□ 0.19
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa16.23■□□□□ 0.19
TTC28-AS1-203ENST00000419253 APAF1O14727 1248 aa16.23■□□□□ 0.19
TTC28-AS1-203ENST00000419253 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa16.23■□□□□ 0.19
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KDM3BQ7LBC6 1761 aa16.23■□□□□ 0.19
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CCDC184Q52MB2 194 aa16.21■□□□□ 0.19
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TRIM35Q9UPQ4 493 aa16.21■□□□□ 0.19
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GRIN3BO60391 1043 aa16.2■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TM4SF1P30408 202 aa16.2■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TGFB2P61812 414 aa16.2■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 BICDL1Q6ZP65 573 aa16.2■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF652Q9Y2D9 606 aa16.2■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NPHP1O15259 732 aa16.19■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 YY1P25490 414 aa16.19■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NFIXQ14938 502 aa16.19■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DDR1Q08345 913 aa16.18■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NGEFQ8N5V2 710 aa16.18■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LAMB4A4D0S4 1761 aa16.18■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CHL1O00533 1208 aa16.17■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SERPINB2P05120 415 aa16.17■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SETDB2Q96T68 719 aa16.17■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 BCL2L12Q9HB09 334 aa16.17■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NBPF26B4DH59 902 aa16.16■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MYL6BP14649 208 aa16.16■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TBC1D9BQ66K14 1250 aa16.16■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KIF6Q6ZMV9 814 aa16.16■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NBPF15Q8N660 670 aa16.16■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CFAP44Q96MT7 982 aa16.16■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 WWC3Q9ULE0 1092 aa16.16■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 C10orf71Q711Q0 1435 aa16.16■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ERBB4Q15303 1308 aa16.16■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 A0A0G2JLW4 131 aa16.15■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CAMTA2O94983 1202 aa16.15■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GNAI1P63096 354 aa16.15■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CLEC4GQ6UXB4 293 aa16.15■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KIF13BQ9NQT8 1826 aa16.15■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CHD4Q14839 1912 aa16.14■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DPEP1P16444 411 aa16.14■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-203ENST00000419253 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP16.14■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FAM9BQ8IZU0 186 aa16.14■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-203ENST00000419253 IFT57Q9NWB7 429 aa16.14■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CARMIL3Q8ND23 1372 aa16.13■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-203ENST00000419253 BCS1LQ9Y276 419 aa16.13■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SCN7AQ01118 1682 aa16.13■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PXDNLA1KZ92 1463 aa16.12■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RGL2O15211 777 aa16.12■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ST5P78524 1137 aa16.12■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NECTIN2Q92692 538 aa16.12■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PIM2Q9P1W9 311 aa16.12■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-203ENST00000419253 UTRNP46939 3433 aa16.12■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-203ENST00000419253 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-203ENST00000419253 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CNBD1Q8NA66 436 aa16.11■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MBIPQ9NS73 344 aa16.11■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms