RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418663.5

AC004980.1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene AC004980.1, Length 2,667 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC004980.1-201ENST00000418663 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
AC004980.1-201ENST00000418663 AXIN2Q9Y2T1 843 aa26.6■■□□□ 1.85
AC004980.1-201ENST00000418663 LRRC37A3O60309 1634 aa26.6■■□□□ 1.85
AC004980.1-201ENST00000418663 ANXA1P04083 346 aa26.6■■□□□ 1.85
AC004980.1-201ENST00000418663 MCCP23508 829 aa26.6■■□□□ 1.85
AC004980.1-201ENST00000418663 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
AC004980.1-201ENST00000418663 KCNH5Q8NCM2 988 aa26.6■■□□□ 1.85
AC004980.1-201ENST00000418663 SURF6O75683 361 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
AC004980.1-201ENST00000418663 USP54Q70EL1 1684 aa26.59■■□□□ 1.85
AC004980.1-201ENST00000418663 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa26.59■■□□□ 1.85
AC004980.1-201ENST00000418663 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
AC004980.1-201ENST00000418663 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
AC004980.1-201ENST00000418663 RBSNQ9H1K0 784 aa26.58■■□□□ 1.85
AC004980.1-201ENST00000418663 ADAMTSL3P82987 1691 aa26.58■■□□□ 1.85
AC004980.1-201ENST00000418663 CCDC173Q0VFZ6 552 aa26.58■■□□□ 1.85
AC004980.1-201ENST00000418663 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
AC004980.1-201ENST00000418663 ZNF445P59923 1031 aa26.57■■□□□ 1.84
AC004980.1-201ENST00000418663 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
AC004980.1-201ENST00000418663 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
AC004980.1-201ENST00000418663 ARHGEF25Q86VW2 580 aa26.56■■□□□ 1.84
AC004980.1-201ENST00000418663 STAP2Q9UGK3 403 aa26.56■■□□□ 1.84
AC004980.1-201ENST00000418663 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa26.55■■□□□ 1.84
AC004980.1-201ENST00000418663 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa26.55■■□□□ 1.84
AC004980.1-201ENST00000418663 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
AC004980.1-201ENST00000418663 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
AC004980.1-201ENST00000418663 KRT28Q7Z3Y7 464 aa26.55■■□□□ 1.84
AC004980.1-201ENST00000418663 TMEM63CQ9P1W3 806 aa26.55■■□□□ 1.84
AC004980.1-201ENST00000418663 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa26.54■■□□□ 1.84
AC004980.1-201ENST00000418663 CHPF2Q9P2E5 772 aa26.54■■□□□ 1.84
AC004980.1-201ENST00000418663 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
AC004980.1-201ENST00000418663 SRGAP3O43295 1099 aa26.54■■□□□ 1.84
AC004980.1-201ENST00000418663 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
AC004980.1-201ENST00000418663 SSH3Q8TE77 659 aa26.53■■□□□ 1.84
AC004980.1-201ENST00000418663 ANKRD24Q8TF21 1146 aa26.53■■□□□ 1.84
AC004980.1-201ENST00000418663 PPP1R9BQ96SB3 815 aa26.53■■□□□ 1.84
AC004980.1-201ENST00000418663 SYCE3A1L190 88 aa26.52■■□□□ 1.84
AC004980.1-201ENST00000418663 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
AC004980.1-201ENST00000418663 BTBD11A6QL63 1104 aa26.52■■□□□ 1.84
AC004980.1-201ENST00000418663 TEFQ10587 303 aa26.52■■□□□ 1.84
AC004980.1-201ENST00000418663 RHPN1Q8TCX5 695 aa26.52■■□□□ 1.84
AC004980.1-201ENST00000418663 PI4KAP2A4QPH2 592 aa26.51■■□□□ 1.83
AC004980.1-201ENST00000418663 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa26.51■■□□□ 1.83
AC004980.1-201ENST00000418663 TPRNQ4KMQ1 711 aa26.5■■□□□ 1.83
AC004980.1-201ENST00000418663 GDPD2Q9HCC8 539 aa26.5■■□□□ 1.83
AC004980.1-201ENST00000418663 BABAM1Q9NWV8 329 aa26.5■■□□□ 1.83
AC004980.1-201ENST00000418663 BRD1O95696 1058 aa26.5■■□□□ 1.83
AC004980.1-201ENST00000418663 CUL4AQ13619 759 aa26.5■■□□□ 1.83
AC004980.1-201ENST00000418663 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa26.49■■□□□ 1.83
AC004980.1-201ENST00000418663 MCM2P49736 904 aa26.49■■□□□ 1.83
AC004980.1-201ENST00000418663 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
AC004980.1-201ENST00000418663 AKAP4Q5JQC9 854 aa26.49■■□□□ 1.83
AC004980.1-201ENST00000418663 PXDNQ92626 1479 aa26.48■■□□□ 1.83
AC004980.1-201ENST00000418663 ANAPC15P60006 121 aa26.48■■□□□ 1.83
AC004980.1-201ENST00000418663 PI4K2BQ8TCG2 481 aa26.48■■□□□ 1.83
AC004980.1-201ENST00000418663 DTNBO60941 627 aa26.47■■□□□ 1.83
AC004980.1-201ENST00000418663 POLA2Q14181 598 aa26.47■■□□□ 1.83
AC004980.1-201ENST00000418663 RNMTO43148 476 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
AC004980.1-201ENST00000418663 DNAAF4Q8WXU2 420 aa26.46■■□□□ 1.83
AC004980.1-201ENST00000418663 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.83
AC004980.1-201ENST00000418663 RNF214Q8ND24 703 aa26.45■■□□□ 1.83
AC004980.1-201ENST00000418663 CACNA1FO60840 1977 aa26.45■■□□□ 1.83
AC004980.1-201ENST00000418663 PXDNLA1KZ92 1463 aa26.45■■□□□ 1.82
AC004980.1-201ENST00000418663 C1orf141Q5JVX7 400 aa26.45■■□□□ 1.82
AC004980.1-201ENST00000418663 BEND3Q5T5X7 828 aa26.45■■□□□ 1.82
AC004980.1-201ENST00000418663 RAB11FIP3O75154 756 aa26.44■■□□□ 1.82
AC004980.1-201ENST00000418663 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
AC004980.1-201ENST00000418663 HSPA4P34932 840 aa26.44■■□□□ 1.82
AC004980.1-201ENST00000418663 C19orf44Q9H6X5 657 aa26.44■■□□□ 1.82
AC004980.1-201ENST00000418663 SPG7Q9UQ90 795 aa26.44■■□□□ 1.82
AC004980.1-201ENST00000418663 ZSCAN30Q86W11 494 aa26.43■■□□□ 1.82
AC004980.1-201ENST00000418663 CABLES1Q8TDN4 633 aa26.43■■□□□ 1.82
AC004980.1-201ENST00000418663 PROSER3Q2NL68 480 aa26.43■■□□□ 1.82
AC004980.1-201ENST00000418663 LRSAM1Q6UWE0 723 aa26.43■■□□□ 1.82
AC004980.1-201ENST00000418663 KIF1BPQ96EK5 621 aa26.43■■□□□ 1.82
AC004980.1-201ENST00000418663 AOX1Q06278 1338 aa26.43■■□□□ 1.82
AC004980.1-201ENST00000418663 CPA1P15085 419 aa26.42■■□□□ 1.82
AC004980.1-201ENST00000418663 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
AC004980.1-201ENST00000418663 C1orf167Q5SNV9 1468 aa26.42■■□□□ 1.82
AC004980.1-201ENST00000418663 RASEFQ8IZ41 740 aa26.42■■□□□ 1.82
AC004980.1-201ENST00000418663 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
AC004980.1-201ENST00000418663 SGSM2O43147 1006 aa26.41■■□□□ 1.82
AC004980.1-201ENST00000418663 AMOTQ4VCS5 1084 aa26.41■■□□□ 1.82
AC004980.1-201ENST00000418663 SNX14Q9Y5W7 946 aa26.41■■□□□ 1.82
AC004980.1-201ENST00000418663 MSNP26038 577 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
AC004980.1-201ENST00000418663 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
AC004980.1-201ENST00000418663 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
AC004980.1-201ENST00000418663 RGPD5Q99666 1765 aa26.39■■□□□ 1.82
AC004980.1-201ENST00000418663 CNTROBQ8N137 903 aa26.39■■□□□ 1.82
AC004980.1-201ENST00000418663 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.81
AC004980.1-201ENST00000418663 RAD50Q92878 1312 aa26.39■■□□□ 1.81
AC004980.1-201ENST00000418663 ADCY9O60503 1353 aa26.39■■□□□ 1.81
AC004980.1-201ENST00000418663 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
AC004980.1-201ENST00000418663 MBD3O95983 291 aa26.38■■□□□ 1.81
AC004980.1-201ENST00000418663 SLIT3O75094 1523 aa26.38■■□□□ 1.81
AC004980.1-201ENST00000418663 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
AC004980.1-201ENST00000418663 NLRP2Q9NX02 1062 aa26.37■■□□□ 1.81
AC004980.1-201ENST00000418663 AK2P54819 239 aa26.37■■□□□ 1.81
AC004980.1-201ENST00000418663 SLC39A6Q13433 755 aa26.37■■□□□ 1.81
AC004980.1-201ENST00000418663 USP48Q86UV5 1035 aa26.37■■□□□ 1.81
AC004980.1-201ENST00000418663 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.6 ms