RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404321.3

PTPRN2-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRN2, Length 1,374 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2-204ENST00000404321 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
PTPRN2-204ENST00000404321 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
PTPRN2-204ENST00000404321 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
PTPRN2-204ENST00000404321 NLGN1Q8N2Q7 840 aa23.99■■□□□ 1.43
PTPRN2-204ENST00000404321 ADAMTS8Q9UP79 889 aa23.99■■□□□ 1.43
PTPRN2-204ENST00000404321 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa23.98■■□□□ 1.43
PTPRN2-204ENST00000404321 RIPK4P57078 832 aa23.98■■□□□ 1.43
PTPRN2-204ENST00000404321 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
PTPRN2-204ENST00000404321 FKBP8Q14318 412 aa23.97■■□□□ 1.43
PTPRN2-204ENST00000404321 NEUROD2Q15784 382 aa23.97■■□□□ 1.43
PTPRN2-204ENST00000404321 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
PTPRN2-204ENST00000404321 A1BGP04217 495 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRN2-204ENST00000404321 USPL1Q5W0Q7 1092 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRN2-204ENST00000404321 COL15A1P39059 1388 aa23.96■■□□□ 1.43
PTPRN2-204ENST00000404321 ZPR1O75312 459 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRN2-204ENST00000404321 TMPOP42166 694 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
PTPRN2-204ENST00000404321 GPR162Q16538 588 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRN2-204ENST00000404321 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
PTPRN2-204ENST00000404321 CD2APQ9Y5K6 639 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRN2-204ENST00000404321 USP16Q9Y5T5 823 aa23.95■■□□□ 1.42
PTPRN2-204ENST00000404321 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
PTPRN2-204ENST00000404321 C4AP0C0L4 1744 aa23.94■■□□□ 1.42
PTPRN2-204ENST00000404321 CCDC184Q52MB2 194 aa23.93■■□□□ 1.42
PTPRN2-204ENST00000404321 RUNDC1Q96C34 613 aa23.93■■□□□ 1.42
PTPRN2-204ENST00000404321 WWC3Q9ULE0 1092 aa23.93■■□□□ 1.42
PTPRN2-204ENST00000404321 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
PTPRN2-204ENST00000404321 EIF5P55010 431 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
PTPRN2-204ENST00000404321 PARP3Q9Y6F1 533 aa23.92■■□□□ 1.42
PTPRN2-204ENST00000404321 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
PTPRN2-204ENST00000404321 NARFQ9UHQ1 456 aa23.91■■□□□ 1.42
PTPRN2-204ENST00000404321 DLG5Q8TDM6 1919 aa23.9■■□□□ 1.42
PTPRN2-204ENST00000404321 DDR1Q08345 913 aa23.9■■□□□ 1.42
PTPRN2-204ENST00000404321 ANP32CO43423 234 aa23.89■■□□□ 1.41
PTPRN2-204ENST00000404321 LMOD3Q0VAK6 560 aa23.89■■□□□ 1.41
PTPRN2-204ENST00000404321 BCL2L12Q9HB09 334 aa23.89■■□□□ 1.41
PTPRN2-204ENST00000404321 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa23.89■■□□□ 1.41
PTPRN2-204ENST00000404321 TSPYL4Q9UJ04 414 aa23.88■■□□□ 1.41
PTPRN2-204ENST00000404321 A0A087WZG4 1122 aa23.87■■□□□ 1.41
PTPRN2-204ENST00000404321 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP23.87■■□□□ 1.41
PTPRN2-204ENST00000404321 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
PTPRN2-204ENST00000404321 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
PTPRN2-204ENST00000404321 UTRNP46939 3433 aa23.87■■□□□ 1.41
PTPRN2-204ENST00000404321 YY1P25490 414 aa23.86■■□□□ 1.41
PTPRN2-204ENST00000404321 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
PTPRN2-204ENST00000404321 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
PTPRN2-204ENST00000404321 TM4SF1P30408 202 aa23.85■■□□□ 1.41
PTPRN2-204ENST00000404321 NFIXQ14938 502 aa23.85■■□□□ 1.41
PTPRN2-204ENST00000404321 BICDL1Q6ZP65 573 aa23.85■■□□□ 1.41
PTPRN2-204ENST00000404321 TRIM35Q9UPQ4 493 aa23.85■■□□□ 1.41
PTPRN2-204ENST00000404321 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
PTPRN2-204ENST00000404321 C10orf71Q711Q0 1435 aa23.84■■□□□ 1.41
PTPRN2-204ENST00000404321 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
PTPRN2-204ENST00000404321 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa23.83■■□□□ 1.41
PTPRN2-204ENST00000404321 NBPF26B4DH59 902 aa23.83■■□□□ 1.41
PTPRN2-204ENST00000404321 APAF1O14727 1248 aa23.83■■□□□ 1.41
PTPRN2-204ENST00000404321 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
PTPRN2-204ENST00000404321 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
PTPRN2-204ENST00000404321 NBPF15Q8N660 670 aa23.83■■□□□ 1.41
PTPRN2-204ENST00000404321 A0A0G2JLW4 131 aa23.82■■□□□ 1.4
PTPRN2-204ENST00000404321 MRS2Q9HD23 443 aa23.82■■□□□ 1.4
PTPRN2-204ENST00000404321 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
PTPRN2-204ENST00000404321 PXDNLA1KZ92 1463 aa23.81■■□□□ 1.4
PTPRN2-204ENST00000404321 KDM3BQ7LBC6 1761 aa23.81■■□□□ 1.4
PTPRN2-204ENST00000404321 TBC1D9BQ66K14 1250 aa23.8■■□□□ 1.4
PTPRN2-204ENST00000404321 CAMTA2O94983 1202 aa23.79■■□□□ 1.4
PTPRN2-204ENST00000404321 DPEP1P16444 411 aa23.79■■□□□ 1.4
PTPRN2-204ENST00000404321 NGEFQ8N5V2 710 aa23.79■■□□□ 1.4
PTPRN2-204ENST00000404321 SERPINB2P05120 415 aa23.78■■□□□ 1.4
PTPRN2-204ENST00000404321 TGFB2P61812 414 aa23.78■■□□□ 1.4
PTPRN2-204ENST00000404321 GRIN3BO60391 1043 aa23.77■■□□□ 1.4
PTPRN2-204ENST00000404321 MYL6BP14649 208 aa23.76■■□□□ 1.39
PTPRN2-204ENST00000404321 KRT24Q2M2I5 525 aa23.76■■□□□ 1.39
PTPRN2-204ENST00000404321 BABAM1Q9NWV8 329 aa23.76■■□□□ 1.39
PTPRN2-204ENST00000404321 CHL1O00533 1208 aa23.75■■□□□ 1.39
PTPRN2-204ENST00000404321 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
PTPRN2-204ENST00000404321 CHRNA5P30532 468 aa23.74■■□□□ 1.39
PTPRN2-204ENST00000404321 CCDC24Q8N4L8 307 aa23.74■■□□□ 1.39
PTPRN2-204ENST00000404321 BCS1LQ9Y276 419 aa23.74■■□□□ 1.39
PTPRN2-204ENST00000404321 SCN7AQ01118 1682 aa23.73■■□□□ 1.39
PTPRN2-204ENST00000404321 NECTIN2Q92692 538 aa23.73■■□□□ 1.39
PTPRN2-204ENST00000404321 SETDB2Q96T68 719 aa23.72■■□□□ 1.39
PTPRN2-204ENST00000404321 CARMIL3Q8ND23 1372 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRN2-204ENST00000404321 KCNA3P22001 575 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRN2-204ENST00000404321 LAMB4A4D0S4 1761 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRN2-204ENST00000404321 KIF13BQ9NQT8 1826 aa23.7■■□□□ 1.39
PTPRN2-204ENST00000404321 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
PTPRN2-204ENST00000404321 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRN2-204ENST00000404321 ANXA1P04083 346 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRN2-204ENST00000404321 HLFQ16534 295 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRN2-204ENST00000404321 TTLL7Q6ZT98 887 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRN2-204ENST00000404321 CFAP44Q96MT7 982 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRN2-204ENST00000404321 ZNF652Q9Y2D9 606 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRN2-204ENST00000404321 NPHP1O15259 732 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRN2-204ENST00000404321 PROSER3Q2NL68 480 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRN2-204ENST00000404321 PRR5LQ6MZQ0 368 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRN2-204ENST00000404321 MBIPQ9NS73 344 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRN2-204ENST00000404321 PIM2Q9P1W9 311 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRN2-204ENST00000404321 FAM177BA6PVY3 158 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRN2-204ENST00000404321 CLEC4GQ6UXB4 293 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRN2-204ENST00000404321 ZBTB3Q9H5J0 574 aa23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.7 ms