RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376362.1

GKAP1-201, Transcript of G kinase anchoring protein 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GKAP1, Length 1,237 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1-201ENST00000376362 USP17L11C9JVI0 530 aa8.39□□□□□ -1.07
GKAP1-201ENST00000376362 USP17L21D6R901 530 aa8.39□□□□□ -1.07
GKAP1-201ENST00000376362 USP17L18D6R9N7 530 aa8.39□□□□□ -1.07
GKAP1-201ENST00000376362 USP17L22D6RA61 530 aa8.39□□□□□ -1.07
GKAP1-201ENST00000376362 USP17L17D6RBQ6 530 aa8.39□□□□□ -1.07
GKAP1-201ENST00000376362 USP17L19D6RCP7 530 aa8.39□□□□□ -1.07
GKAP1-201ENST00000376362 USP17L20D6RJB6 530 aa8.39□□□□□ -1.07
GKAP1-201ENST00000376362 RASA1P20936 1047 aa8.39□□□□□ -1.07
GKAP1-201ENST00000376362 USP17L24Q0WX57 530 aa8.39□□□□□ -1.07
GKAP1-201ENST00000376362 TMEM164Q5U3C3 297 aa8.39□□□□□ -1.07
GKAP1-201ENST00000376362 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
GKAP1-201ENST00000376362 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
GKAP1-201ENST00000376362 INHAP05111 366 aa8.38□□□□□ -1.07
GKAP1-201ENST00000376362 FURINP09958 794 aa8.38□□□□□ -1.07
GKAP1-201ENST00000376362 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
GKAP1-201ENST00000376362 GDF10P55107 478 aa8.38□□□□□ -1.07
GKAP1-201ENST00000376362 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
GKAP1-201ENST00000376362 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
GKAP1-201ENST00000376362 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
GKAP1-201ENST00000376362 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa8.38□□□□□ -1.07
GKAP1-201ENST00000376362 CCDC102BQ68D86 513 aa8.37□□□□□ -1.07
GKAP1-201ENST00000376362 TPCN2Q8NHX9 752 aa8.37□□□□□ -1.07
GKAP1-201ENST00000376362 CNKSR1Q969H4 720 aa8.37□□□□□ -1.07
GKAP1-201ENST00000376362 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
GKAP1-201ENST00000376362 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
GKAP1-201ENST00000376362 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
GKAP1-201ENST00000376362 ZNF358Q9NW07 568 aa8.37□□□□□ -1.07
GKAP1-201ENST00000376362 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
GKAP1-201ENST00000376362 KCNA1Q09470 495 aa8.36□□□□□ -1.07
GKAP1-201ENST00000376362 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP8.36□□□□□ -1.07
GKAP1-201ENST00000376362 RNF217Q8TC41 542 aa8.36□□□□□ -1.07
GKAP1-201ENST00000376362 SLC4A9Q96Q91 983 aa8.36□□□□□ -1.07
GKAP1-201ENST00000376362 MEN1O00255 615 aa8.35□□□□□ -1.07
GKAP1-201ENST00000376362 BCRP11274 1271 aa8.35□□□□□ -1.07
GKAP1-201ENST00000376362 GPC1P35052 558 aa8.35□□□□□ -1.07
GKAP1-201ENST00000376362 EPHA4P54764 986 aa8.35□□□□□ -1.07
GKAP1-201ENST00000376362 PSME1Q06323 249 aa8.35□□□□□ -1.07
GKAP1-201ENST00000376362 DPYDQ12882 1025 aa8.35□□□□□ -1.07
GKAP1-201ENST00000376362 GAS6Q14393 721 aa8.35□□□□□ -1.07
GKAP1-201ENST00000376362 ESCO1Q5FWF5 840 aa8.35□□□□□ -1.07
GKAP1-201ENST00000376362 ANKMY2Q8IV38 441 aa8.35□□□□□ -1.07
GKAP1-201ENST00000376362 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
GKAP1-201ENST00000376362 SFI1A8K8P3 1242 aa8.34□□□□□ -1.07
GKAP1-201ENST00000376362 M0R2N6 131 aa8.34□□□□□ -1.07
GKAP1-201ENST00000376362 CENPCQ03188 943 aa8.34□□□□□ -1.07
GKAP1-201ENST00000376362 FAM200AQ8TCP9 573 aa8.34□□□□□ -1.07
GKAP1-201ENST00000376362 GRIP2Q9C0E4 1043 aa8.34□□□□□ -1.07
GKAP1-201ENST00000376362 MBIPQ9NS73 344 aa8.34□□□□□ -1.07
GKAP1-201ENST00000376362 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
GKAP1-201ENST00000376362 MTFR1Q15390 333 aa8.33□□□□□ -1.08
GKAP1-201ENST00000376362 FOXR1Q6PIV2 292 aa8.33□□□□□ -1.08
GKAP1-201ENST00000376362 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa8.33□□□□□ -1.08
GKAP1-201ENST00000376362 SMTNP53814 917 aa8.32□□□□□ -1.08
GKAP1-201ENST00000376362 SEC13P55735 322 aa8.32□□□□□ -1.08
GKAP1-201ENST00000376362 FAM69CQ0P6D2 419 aa8.32□□□□□ -1.08
GKAP1-201ENST00000376362 NLRP3Q96P20 1036 aa8.32□□□□□ -1.08
GKAP1-201ENST00000376362 SLAIN2Q9P270 581 aa8.32□□□□□ -1.08
GKAP1-201ENST00000376362 SERTAD1Q9UHV2 236 aa8.32□□□□□ -1.08
GKAP1-201ENST00000376362 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
GKAP1-201ENST00000376362 IGF1RP08069 1367 aa8.32□□□□□ -1.08
GKAP1-201ENST00000376362 USP3Q9Y6I4 520 aa8.31□□□□□ -1.08
GKAP1-201ENST00000376362 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa8.31□□□□□ -1.08
GKAP1-201ENST00000376362 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa8.3□□□□□ -1.08
GKAP1-201ENST00000376362 A6NJY4 79 aa8.3□□□□□ -1.08
GKAP1-201ENST00000376362 BACH1O14867 736 aa8.3□□□□□ -1.08
GKAP1-201ENST00000376362 TLR1Q15399 786 aa8.3□□□□□ -1.08
GKAP1-201ENST00000376362 LCE3BQ5TA77 95 aa8.3□□□□□ -1.08
GKAP1-201ENST00000376362 TMCO4Q5TGY1 634 aa8.3□□□□□ -1.08
GKAP1-201ENST00000376362 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa8.3□□□□□ -1.08
GKAP1-201ENST00000376362 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
GKAP1-201ENST00000376362 KRBA1A5PL33 1030 aa8.29□□□□□ -1.08
GKAP1-201ENST00000376362 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa8.29□□□□□ -1.08
GKAP1-201ENST00000376362 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
GKAP1-201ENST00000376362 TNS4Q8IZW8 715 aa8.29□□□□□ -1.08
GKAP1-201ENST00000376362 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
GKAP1-201ENST00000376362 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
GKAP1-201ENST00000376362 CDK2AP1O14519 115 aa8.28□□□□□ -1.08
GKAP1-201ENST00000376362 SSFA2P28290 1259 aa8.28□□□□□ -1.08
GKAP1-201ENST00000376362 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa8.28□□□□□ -1.08
GKAP1-201ENST00000376362 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
GKAP1-201ENST00000376362 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
GKAP1-201ENST00000376362 GPR25O00155 361 aa8.27□□□□□ -1.09
GKAP1-201ENST00000376362 SLC27A3Q5K4L6 730 aa8.27□□□□□ -1.09
GKAP1-201ENST00000376362 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa8.27□□□□□ -1.09
GKAP1-201ENST00000376362 C21orf2O43822 256 aa8.26□□□□□ -1.09
GKAP1-201ENST00000376362 SWI5Q1ZZU3 235 aa8.26□□□□□ -1.09
GKAP1-201ENST00000376362 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
GKAP1-201ENST00000376362 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa8.26□□□□□ -1.09
GKAP1-201ENST00000376362 NBPF15Q8N660 670 aa8.26□□□□□ -1.09
GKAP1-201ENST00000376362 ACDQ96AP0 544 aa8.26□□□□□ -1.09
GKAP1-201ENST00000376362 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
GKAP1-201ENST00000376362 ATP2B4P23634 1241 aa8.25□□□□□ -1.09
GKAP1-201ENST00000376362 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
GKAP1-201ENST00000376362 POU4F2Q12837 409 aa8.25□□□□□ -1.09
GKAP1-201ENST00000376362 C4orf17Q53FE4 359 aa8.25□□□□□ -1.09
GKAP1-201ENST00000376362 POTEAQ6S8J7 498 aa8.25□□□□□ -1.09
GKAP1-201ENST00000376362 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
GKAP1-201ENST00000376362 TXNDC2Q86VQ3 553 aa8.25□□□□□ -1.09
GKAP1-201ENST00000376362 SLC9A9Q8IVB4 645 aa8.25□□□□□ -1.09
GKAP1-201ENST00000376362 GMCL1Q96IK5 515 aa8.25□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 221.3 ms