RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 ILDR2Q71H61 639 aa9□□□□□ -0.97
CTPS1-201ENST00000372616 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
CTPS1-201ENST00000372616 MYH16Q9H6N6 1097 aa9□□□□□ -0.97
CTPS1-201ENST00000372616 SPTLC1O15269 473 aa9□□□□□ -0.97
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF710Q8N1W2 664 aa9□□□□□ -0.97
CTPS1-201ENST00000372616 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
CTPS1-201ENST00000372616 PTPRUQ92729 1446 aa9□□□□□ -0.97
CTPS1-201ENST00000372616 USP32Q8NFA0 1604 aa9□□□□□ -0.97
CTPS1-201ENST00000372616 WASLO00401 505 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
CTPS1-201ENST00000372616 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
CTPS1-201ENST00000372616 USP17L8P0C7I0 530 aa8.99□□□□□ -0.97
CTPS1-201ENST00000372616 WAPLQ7Z5K2 1190 aa8.99□□□□□ -0.97
CTPS1-201ENST00000372616 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa8.99□□□□□ -0.97
CTPS1-201ENST00000372616 CERKQ8TCT0 537 aa8.99□□□□□ -0.97
CTPS1-201ENST00000372616 CDK19Q9BWU1 502 aa8.99□□□□□ -0.97
CTPS1-201ENST00000372616 ROBO2Q9HCK4 1378 aa8.99□□□□□ -0.97
CTPS1-201ENST00000372616 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
CTPS1-201ENST00000372616 TERF2IPQ9NYB0 399 aa8.99□□□□□ -0.97
CTPS1-201ENST00000372616 LILRB3O75022 631 aa8.98□□□□□ -0.97
CTPS1-201ENST00000372616 COL9A1P20849 921 aa8.98□□□□□ -0.97
CTPS1-201ENST00000372616 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
CTPS1-201ENST00000372616 ATP7BP35670 1465 aa8.98□□□□□ -0.97
CTPS1-201ENST00000372616 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
CTPS1-201ENST00000372616 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP8.98□□□□□ -0.978e-6■■■□□ 17.3
CTPS1-201ENST00000372616 SKAP1Q86WV1 359 aa8.98□□□□□ -0.97
CTPS1-201ENST00000372616 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
CTPS1-201ENST00000372616 NWD1Q149M9 1564 aa8.98□□□□□ -0.97
CTPS1-201ENST00000372616 NSD2O96028 1365 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-201ENST00000372616 NUDT18Q6ZVK8 323 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-201ENST00000372616 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-201ENST00000372616 HSCBQ8IWL3 235 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-201ENST00000372616 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-201ENST00000372616 GBP4Q96PP9 640 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-201ENST00000372616 EYA1Q99502 592 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-201ENST00000372616 ITSN1Q15811 1721 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-201ENST00000372616 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-201ENST00000372616 WWC1Q8IX03 1113 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-201ENST00000372616 HLA-CQ95604 372 aa8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-201ENST00000372616 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
CTPS1-201ENST00000372616 SMAPO00193 183 aa8.96□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 IGHDP01880 384 aa8.96□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 KCNA6P17658 529 aa8.96□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 TERF1P54274 439 aa8.96□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 VAC14Q08AM6 782 aa8.96□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 WDR63Q8IWG1 891 aa8.96□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa8.96□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 TSKSQ9UJT2 592 aa8.96□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 ESPNB1AK53 854 aa8.95□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 APAF1O14727 1248 aa8.95□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 GABBR2O75899 941 aa8.95□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 GUCA2AQ02747 115 aa8.95□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 CTDSPL2Q05D32 466 aa8.95□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC27Q2M243 656 aa8.95□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 ARSIQ5FYB1 569 aa8.95□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 DCBLD2Q96PD2 775 aa8.95□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 MAP7D2Q96T17 732 aa8.95□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 GRPEL1Q9HAV7 217 aa8.95□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 TSC1Q92574 1164 aa8.95□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 NSD3Q9BZ95 1437 aa8.95□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa8.95□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 KIF16BQ96L93 1317 aa8.94□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 BCAR3O75815 825 aa8.94□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 SNX21Q969T3 373 aa8.94□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 C22orf23Q9BZE7 217 aa8.94□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 PDCL3Q9H2J4 239 aa8.94□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa8.94□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 ANKARQ7Z5J8 1434 aa8.94□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa8.94□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa8.93□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 GOLGA6L22H0YM25 854 aa8.93□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 PBXIP1Q96AQ6 731 aa8.93□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 METRNQ9UJH8 293 aa8.93□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 A0A1W2PP64 1363 aa8.93□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 FMN2Q9NZ56 1722 aa8.93□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa8.93□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC173Q0VFZ6 552 aa8.93□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 RDH13Q8NBN7 331 aa8.93□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 EPS8L1Q8TE68 723 aa8.93□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 CARD14Q9BXL6 1004 aa8.93□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 CABP1Q9NZU7 370 aa8.93□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 AKAP12Q02952 1782 aa8.93□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 CLCN6P51797 869 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 RARSP54136 660 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 RUNDC1Q96C34 613 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 PRM3Q9NNZ6 103 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 MON2Q7Z3U7 1717 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 NALCNQ8IZF0 1738 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 CD163L1Q9NR16 1453 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 KIF20BQ96Q89 1820 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 GPR37L1O60883 481 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 HS1BP3Q53T59 392 aa8.92□□□□□ -0.98
CTPS1-201ENST00000372616 LRRN4Q8WUT4 740 aa8.92□□□□□ -0.98
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