RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366976.3

NSL1-201, Transcript of NSL1, MIS12 kinetochore complex component, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NSL1, Length 722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSL1-201ENST00000366976 UBR2Q8IWV8 1755 aa20.59■□□□□ 0.89
NSL1-201ENST00000366976 HEG1Q9ULI3 1381 aa20.59■□□□□ 0.89
NSL1-201ENST00000366976 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
NSL1-201ENST00000366976 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
NSL1-201ENST00000366976 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
NSL1-201ENST00000366976 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
NSL1-201ENST00000366976 GYS1P13807 737 aa20.57■□□□□ 0.88
NSL1-201ENST00000366976 TJP1Q07157 1748 aa20.57■□□□□ 0.88
NSL1-201ENST00000366976 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
NSL1-201ENST00000366976 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa20.56■□□□□ 0.88
NSL1-201ENST00000366976 IFFO2Q5TF58 517 aa20.56■□□□□ 0.88
NSL1-201ENST00000366976 MSL1Q68DK7 614 aa20.56■□□□□ 0.88
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NSL1-201ENST00000366976 BABAM1Q9NWV8 329 aa20.55■□□□□ 0.88
NSL1-201ENST00000366976 A0A087WZG4 1122 aa20.54■□□□□ 0.88
NSL1-201ENST00000366976 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
NSL1-201ENST00000366976 MCM10Q7L590 875 aa20.54■□□□□ 0.88
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NSL1-201ENST00000366976 LMOD3Q0VAK6 560 aa20.53■□□□□ 0.88
NSL1-201ENST00000366976 SMIM5Q71RC9 77 aa20.53■□□□□ 0.88
NSL1-201ENST00000366976 NARFQ9UHQ1 456 aa20.53■□□□□ 0.88
NSL1-201ENST00000366976 ZPR1O75312 459 aa20.52■□□□□ 0.88
NSL1-201ENST00000366976 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
NSL1-201ENST00000366976 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
NSL1-201ENST00000366976 RGL2O15211 777 aa20.51■□□□□ 0.87
NSL1-201ENST00000366976 GRIN3BO60391 1043 aa20.51■□□□□ 0.87
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NSL1-201ENST00000366976 CEP350Q5VT06 3117 aa20.51■□□□□ 0.87
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NSL1-201ENST00000366976 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa20.5■□□□□ 0.87
NSL1-201ENST00000366976 COL15A1P39059 1388 aa20.49■□□□□ 0.87
NSL1-201ENST00000366976 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP20.49■□□□□ 0.87
NSL1-201ENST00000366976 TM4SF1P30408 202 aa20.49■□□□□ 0.87
NSL1-201ENST00000366976 RUNDC1Q96C34 613 aa20.49■□□□□ 0.87
NSL1-201ENST00000366976 PARP3Q9Y6F1 533 aa20.49■□□□□ 0.87
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NSL1-201ENST00000366976 DCTN1Q14203 1278 aa20.48■□□□□ 0.87
NSL1-201ENST00000366976 RIPK4P57078 832 aa20.47■□□□□ 0.87
NSL1-201ENST00000366976 KCNQ3O43525 872 aa20.46■□□□□ 0.87
NSL1-201ENST00000366976 FKBP8Q14318 412 aa20.46■□□□□ 0.87
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NSL1-201ENST00000366976 ADAMTS8Q9UP79 889 aa20.46■□□□□ 0.87
NSL1-201ENST00000366976 C4AP0C0L4 1744 aa20.46■□□□□ 0.87
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NSL1-201ENST00000366976 USP16Q9Y5T5 823 aa20.45■□□□□ 0.86
NSL1-201ENST00000366976 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
NSL1-201ENST00000366976 C10orf71Q711Q0 1435 aa20.44■□□□□ 0.86
NSL1-201ENST00000366976 ATP10DQ9P241 1426 aa20.44■□□□□ 0.86
NSL1-201ENST00000366976 DLG5Q8TDM6 1919 aa20.43■□□□□ 0.86
NSL1-201ENST00000366976 CLEC4GQ6UXB4 293 aa20.43■□□□□ 0.86
NSL1-201ENST00000366976 KIF13BQ9NQT8 1826 aa20.43■□□□□ 0.86
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NSL1-201ENST00000366976 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
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NSL1-201ENST00000366976 BCL2L12Q9HB09 334 aa20.41■□□□□ 0.86
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NSL1-201ENST00000366976 NFIXQ14938 502 aa20.4■□□□□ 0.86
NSL1-201ENST00000366976 ERBB4Q15303 1308 aa20.4■□□□□ 0.86
NSL1-201ENST00000366976 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa20.4■□□□□ 0.86
NSL1-201ENST00000366976 RNF39Q9H2S5 420 aa20.39■□□□□ 0.85
NSL1-201ENST00000366976 CHL1O00533 1208 aa20.37■□□□□ 0.85
NSL1-201ENST00000366976 ANP32CO43423 234 aa20.37■□□□□ 0.85
NSL1-201ENST00000366976 CAMTA2O94983 1202 aa20.37■□□□□ 0.85
NSL1-201ENST00000366976 MIS18AQ9NYP9 233 aa20.37■□□□□ 0.85
NSL1-201ENST00000366976 TSPYL4Q9UJ04 414 aa20.37■□□□□ 0.85
NSL1-201ENST00000366976 TRIM35Q9UPQ4 493 aa20.37■□□□□ 0.85
NSL1-201ENST00000366976 PXDNLA1KZ92 1463 aa20.37■□□□□ 0.85
NSL1-201ENST00000366976 KDM3BQ7LBC6 1761 aa20.36■□□□□ 0.85
NSL1-201ENST00000366976 SERPINB2P05120 415 aa20.36■□□□□ 0.85
NSL1-201ENST00000366976 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
NSL1-201ENST00000366976 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
NSL1-201ENST00000366976 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
NSL1-201ENST00000366976 ZNF652Q9Y2D9 606 aa20.36■□□□□ 0.85
NSL1-201ENST00000366976 ADCY9O60503 1353 aa20.35■□□□□ 0.85
NSL1-201ENST00000366976 NBPF26B4DH59 902 aa20.35■□□□□ 0.85
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NSL1-201ENST00000366976 NBPF15Q8N660 670 aa20.35■□□□□ 0.85
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NSL1-201ENST00000366976 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa20.35■□□□□ 0.85
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NSL1-201ENST00000366976 ERVV-1B6SEH8 477 aa20.34■□□□□ 0.85
NSL1-201ENST00000366976 KCNA3P22001 575 aa20.34■□□□□ 0.85
NSL1-201ENST00000366976 CCDC146Q8IYE0 955 aa20.34■□□□□ 0.85
NSL1-201ENST00000366976 CARMIL3Q8ND23 1372 aa20.34■□□□□ 0.85
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NSL1-201ENST00000366976 CFAP44Q96MT7 982 aa20.33■□□□□ 0.85
NSL1-201ENST00000366976 SETDB2Q96T68 719 aa20.33■□□□□ 0.85
NSL1-201ENST00000366976 PIM2Q9P1W9 311 aa20.33■□□□□ 0.85
NSL1-201ENST00000366976 A0A0G2JLW4 131 aa20.32■□□□□ 0.84
NSL1-201ENST00000366976 DPEP1P16444 411 aa20.32■□□□□ 0.84
NSL1-201ENST00000366976 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
NSL1-201ENST00000366976 HSPA6P17066 643 aa20.31■□□□□ 0.84
NSL1-201ENST00000366976 TBC1D9BQ66K14 1250 aa20.31■□□□□ 0.84
NSL1-201ENST00000366976 BRIP1Q9BX63 1249 aa20.31■□□□□ 0.84
NSL1-201ENST00000366976 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa20.3■□□□□ 0.84
NSL1-201ENST00000366976 SCN7AQ01118 1682 aa20.3■□□□□ 0.84
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