RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366554.2

OPN3-201, Transcript of opsin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN3, Length 2,620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-201ENST00000366554 MTMR6Q9Y217 621 aa25.89■■□□□ 1.73
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OPN3-201ENST00000366554 CHMP3Q9Y3E7 222 aa25.77■■□□□ 1.72
OPN3-201ENST00000366554 RNF20Q5VTR2 975 aa25.77■■□□□ 1.72
OPN3-201ENST00000366554 HYPKQ9NX55 129 aa25.77■■□□□ 1.72
OPN3-201ENST00000366554 DACT1Q9NYF0 836 aa25.77■■□□□ 1.72
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OPN3-201ENST00000366554 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
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OPN3-201ENST00000366554 CABP1Q9NZU7 370 aa25.74■■□□□ 1.71
OPN3-201ENST00000366554 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
OPN3-201ENST00000366554 SLC4A2P04920 1241 aa25.74■■□□□ 1.71
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OPN3-201ENST00000366554 KCND1Q9NSA2 647 aa25.73■■□□□ 1.71
OPN3-201ENST00000366554 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
OPN3-201ENST00000366554 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
OPN3-201ENST00000366554 PTPRMP28827 1452 aa25.73■■□□□ 1.71
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