RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362865.1

RNU6-227P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 227, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-227P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-227P-201ENST00000362865 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
RNU6-227P-201ENST00000362865 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC35F4A4IF30 521 aa5.08□□□□□ -1.6
RNU6-227P-201ENST00000362865 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
RNU6-227P-201ENST00000362865 PHKA2P46019 1235 aa5.08□□□□□ -1.6
RNU6-227P-201ENST00000362865 RASSF7Q02833 373 aa5.08□□□□□ -1.6
RNU6-227P-201ENST00000362865 TBCELQ5QJ74 424 aa5.08□□□□□ -1.6
RNU6-227P-201ENST00000362865 TAS1R3Q7RTX0 852 aa5.08□□□□□ -1.6
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC9A9Q8IVB4 645 aa5.08□□□□□ -1.6
RNU6-227P-201ENST00000362865 FAM200AQ8TCP9 573 aa5.08□□□□□ -1.6
RNU6-227P-201ENST00000362865 RHBDD1Q8TEB9 315 aa5.08□□□□□ -1.6
RNU6-227P-201ENST00000362865 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
RNU6-227P-201ENST00000362865 C21orf2O43822 256 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-227P-201ENST00000362865 FAM69CQ0P6D2 419 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-227P-201ENST00000362865 GNASQ5JWF2 1037 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMEM164Q5U3C3 297 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-227P-201ENST00000362865 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
RNU6-227P-201ENST00000362865 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
RNU6-227P-201ENST00000362865 PPFIA3O75145 1194 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-227P-201ENST00000362865 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
RNU6-227P-201ENST00000362865 PLA2G4AP47712 749 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-227P-201ENST00000362865 VEGFBP49765 207 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-227P-201ENST00000362865 WDR44Q5JSH3 913 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-227P-201ENST00000362865 CCDC155Q8N6L0 562 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-227P-201ENST00000362865 GAS2L2Q8NHY3 880 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-227P-201ENST00000362865 HINFPQ9BQA5 517 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-227P-201ENST00000362865 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-227P-201ENST00000362865 CABP1Q9NZU7 370 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-227P-201ENST00000362865 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
RNU6-227P-201ENST00000362865 TEAD4Q15561 434 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-227P-201ENST00000362865 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-227P-201ENST00000362865 GPAT2Q6NUI2 795 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-227P-201ENST00000362865 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RNU6-227P-201ENST00000362865 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLAIN2Q9P270 581 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-227P-201ENST00000362865 DYRK1BQ9Y463 629 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-227P-201ENST00000362865 PARP3Q9Y6F1 533 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-227P-201ENST00000362865 ATAD2Q6PL18 1390 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-227P-201ENST00000362865 CARNS1A5YM72 827 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMEM88BA6NKF7 163 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-227P-201ENST00000362865 EML1O00423 815 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-227P-201ENST00000362865 ADAM23O75077 832 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-227P-201ENST00000362865 WEE1P30291 646 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-227P-201ENST00000362865 NOS2P35228 1153 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-227P-201ENST00000362865 SWI5Q1ZZU3 235 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC16A10Q8TF71 515 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-227P-201ENST00000362865 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
RNU6-227P-201ENST00000362865 A0A1B0GTH6 734 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-227P-201ENST00000362865 H3BM21 787 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-227P-201ENST00000362865 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
RNU6-227P-201ENST00000362865 ATP4AP20648 1035 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-227P-201ENST00000362865 IGFBP4P22692 258 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-227P-201ENST00000362865 ITGA6P23229 1130 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-227P-201ENST00000362865 MSX1P28360 303 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-227P-201ENST00000362865 TXLNAP40222 546 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-227P-201ENST00000362865 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
RNU6-227P-201ENST00000362865 OCLNQ16625 522 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-227P-201ENST00000362865 POTEAQ6S8J7 498 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-227P-201ENST00000362865 NPAS3Q8IXF0 933 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-227P-201ENST00000362865 Q8N3U1 123 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-227P-201ENST00000362865 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
RNU6-227P-201ENST00000362865 L3MBTL2Q969R5 705 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-227P-201ENST00000362865 AIDAQ96BJ3 306 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-227P-201ENST00000362865 PRIMPOLQ96LW4 560 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-227P-201ENST00000362865 GPAMQ9HCL2 828 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-227P-201ENST00000362865 SERTM1A2A2V5 107 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-227P-201ENST00000362865 PRMT3O60678 531 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-227P-201ENST00000362865 F11P03951 625 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-227P-201ENST00000362865 THBS1P07996 1170 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-227P-201ENST00000362865 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-227P-201ENST00000362865 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
RNU6-227P-201ENST00000362865 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-227P-201ENST00000362865 STAG2Q8N3U4 1231 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-227P-201ENST00000362865 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
RNU6-227P-201ENST00000362865 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF232Q9UNY5 417 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-227P-201ENST00000362865 ERBB4Q15303 1308 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-227P-201ENST00000362865 DBN1Q16643 649 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-227P-201ENST00000362865 NBPF1Q3BBV0 1214 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-227P-201ENST00000362865 VWA5B2Q8N398 1253 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-227P-201ENST00000362865 RETREG2Q8NC44 543 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-227P-201ENST00000362865 C7orf43Q8WVR3 580 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-227P-201ENST00000362865 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
RNU6-227P-201ENST00000362865 KLRG1Q96E93 195 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-227P-201ENST00000362865 RUBCNLQ9H714 662 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-227P-201ENST00000362865 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-227P-201ENST00000362865 FOXO3O43524 673 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-227P-201ENST00000362865 IGHA1P01876 353 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-227P-201ENST00000362865 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-227P-201ENST00000362865 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-227P-201ENST00000362865 TRIM22Q8IYM9 498 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-227P-201ENST00000362865 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-227P-201ENST00000362865 C1orf216Q8TAB5 229 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-227P-201ENST00000362865 IRF7Q92985 503 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZIC5Q96T25 663 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-227P-201ENST00000362865 PHACTR1Q9C0D0 580 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-227P-201ENST00000362865 CRISPLD1Q9H336 500 aa5□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms