RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 ADRA2BP18089 450 aa35.56■■■■□ 3.28
TPGS1-201ENST00000359315 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP35.56■■■■□ 3.28
TPGS1-201ENST00000359315 TRIM35Q9UPQ4 493 aa35.55■■■■□ 3.28
TPGS1-201ENST00000359315 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP35.53■■■■□ 3.28
TPGS1-201ENST00000359315 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP35.52■■■■□ 3.28
TPGS1-201ENST00000359315 CANXP27824 592 aaKnown RBP35.51■■■■□ 3.28
TPGS1-201ENST00000359315 RFC4P35249 363 aa35.51■■■■□ 3.28
TPGS1-201ENST00000359315 USP16Q9Y5T5 823 aa35.51■■■■□ 3.28
TPGS1-201ENST00000359315 C4AP0C0L4 1744 aa35.51■■■■□ 3.27
TPGS1-201ENST00000359315 APAF1O14727 1248 aa35.5■■■■□ 3.27
TPGS1-201ENST00000359315 STARD3NLO95772 234 aa35.5■■■■□ 3.27
TPGS1-201ENST00000359315 LMOD3Q0VAK6 560 aa35.5■■■■□ 3.27
TPGS1-201ENST00000359315 SYT17Q9BSW7 474 aa35.5■■■■□ 3.27
TPGS1-201ENST00000359315 GYS1P13807 737 aa35.49■■■■□ 3.27
TPGS1-201ENST00000359315 KLHL34Q8N239 644 aa35.49■■■■□ 3.27
TPGS1-201ENST00000359315 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP35.48■■■■□ 3.27
TPGS1-201ENST00000359315 COL15A1P39059 1388 aa35.48■■■■□ 3.27
TPGS1-201ENST00000359315 KDM3BQ7LBC6 1761 aa35.48■■■■□ 3.27
TPGS1-201ENST00000359315 A1BGP04217 495 aa35.47■■■■□ 3.27
TPGS1-201ENST00000359315 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP35.47■■■■□ 3.27
TPGS1-201ENST00000359315 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa35.46■■■■□ 3.27
TPGS1-201ENST00000359315 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP35.46■■■■□ 3.27
TPGS1-201ENST00000359315 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP35.45■■■■□ 3.27
TPGS1-201ENST00000359315 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP35.45■■■■□ 3.27
TPGS1-201ENST00000359315 TSPYL4Q9UJ04 414 aa35.44■■■■□ 3.26
TPGS1-201ENST00000359315 MMP10P09238 476 aa35.43■■■■□ 3.26
TPGS1-201ENST00000359315 EIF5P55010 431 aaKnown RBP35.43■■■■□ 3.26
TPGS1-201ENST00000359315 FKBP8Q14318 412 aa35.42■■■■□ 3.26
TPGS1-201ENST00000359315 USPL1Q5W0Q7 1092 aa35.41■■■■□ 3.26
TPGS1-201ENST00000359315 NLGN2Q8NFZ4 835 aa35.41■■■■□ 3.26
TPGS1-201ENST00000359315 NLGN1Q8N2Q7 840 aa35.4■■■■□ 3.26
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP35.4■■■■□ 3.26
TPGS1-201ENST00000359315 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP35.39■■■■□ 3.26
TPGS1-201ENST00000359315 BCL2L12Q9HB09 334 aa35.38■■■■□ 3.25
TPGS1-201ENST00000359315 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP35.37■■■■□ 3.25
TPGS1-201ENST00000359315 NARFQ9UHQ1 456 aa35.37■■■■□ 3.25
TPGS1-201ENST00000359315 NBPF26B4DH59 902 aa35.36■■■■□ 3.25
TPGS1-201ENST00000359315 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP35.36■■■■□ 3.25
TPGS1-201ENST00000359315 NBPF15Q8N660 670 aa35.36■■■■□ 3.25
TPGS1-201ENST00000359315 ZPR1O75312 459 aa35.35■■■■□ 3.25
TPGS1-201ENST00000359315 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP35.35■■■■□ 3.25
TPGS1-201ENST00000359315 CHL1O00533 1208 aa35.34■■■■□ 3.25
TPGS1-201ENST00000359315 DDR1Q08345 913 aa35.34■■■■□ 3.25
TPGS1-201ENST00000359315 BABAM1Q9NWV8 329 aa35.33■■■■□ 3.25
TPGS1-201ENST00000359315 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa35.33■■■■□ 3.25
TPGS1-201ENST00000359315 KRT24Q2M2I5 525 aa35.32■■■■□ 3.24
TPGS1-201ENST00000359315 LAMB4A4D0S4 1761 aa35.3■■■■□ 3.24
TPGS1-201ENST00000359315 FAM9BQ8IZU0 186 aa35.29■■■■□ 3.24
TPGS1-201ENST00000359315 A0A087WZG4 1122 aa35.28■■■■□ 3.24
TPGS1-201ENST00000359315 CD2APQ9Y5K6 639 aa35.28■■■■□ 3.24
TPGS1-201ENST00000359315 TM4SF1P30408 202 aa35.27■■■■□ 3.24
TPGS1-201ENST00000359315 NFIXQ14938 502 aa35.27■■■■□ 3.24
TPGS1-201ENST00000359315 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP35.26■■■■□ 3.24
TPGS1-201ENST00000359315 CAMTA2O94983 1202 aa35.26■■■■□ 3.24
TPGS1-201ENST00000359315 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP35.26■■■■□ 3.24
TPGS1-201ENST00000359315 CFAP44Q96MT7 982 aa35.26■■■■□ 3.24
TPGS1-201ENST00000359315 PARP3Q9Y6F1 533 aa35.26■■■■□ 3.24
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF853P0CG23 659 aa35.25■■■■□ 3.23
TPGS1-201ENST00000359315 MBIPQ9NS73 344 aa35.25■■■■□ 3.23
TPGS1-201ENST00000359315 C10orf71Q711Q0 1435 aa35.24■■■■□ 3.23
TPGS1-201ENST00000359315 SCN7AQ01118 1682 aa35.24■■■■□ 3.23
TPGS1-201ENST00000359315 BICDL1Q6ZP65 573 aa35.22■■■■□ 3.23
TPGS1-201ENST00000359315 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP35.21■■■■□ 3.23
TPGS1-201ENST00000359315 TBC1D9BQ66K14 1250 aa35.21■■■■□ 3.23
TPGS1-201ENST00000359315 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP35.2■■■■□ 3.23
TPGS1-201ENST00000359315 NGEFQ8N5V2 710 aa35.2■■■■□ 3.23
TPGS1-201ENST00000359315 IFT57Q9NWB7 429 aa35.2■■■■□ 3.23
TPGS1-201ENST00000359315 MYL6BP14649 208 aa35.19■■■■□ 3.22
TPGS1-201ENST00000359315 WWC1Q8IX03 1113 aa35.19■■■■□ 3.22
TPGS1-201ENST00000359315 NECTIN2Q92692 538 aa35.19■■■■□ 3.22
TPGS1-201ENST00000359315 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP35.19■■■■□ 3.22
TPGS1-201ENST00000359315 CCDC27Q2M243 656 aa35.18■■■■□ 3.22
TPGS1-201ENST00000359315 WWC3Q9ULE0 1092 aa35.18■■■■□ 3.22
TPGS1-201ENST00000359315 PXDNLA1KZ92 1463 aa35.17■■■■□ 3.22
TPGS1-201ENST00000359315 PDIA6Q15084 440 aa35.17■■■■□ 3.22
TPGS1-201ENST00000359315 PROSER3Q2NL68 480 aa35.17■■■■□ 3.22
TPGS1-201ENST00000359315 ANXA1P04083 346 aa35.16■■■■□ 3.22
TPGS1-201ENST00000359315 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP35.16■■■■□ 3.22
TPGS1-201ENST00000359315 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP35.16■■■■□ 3.22
TPGS1-201ENST00000359315 GNAI1P63096 354 aa35.15■■■■□ 3.22
TPGS1-201ENST00000359315 LRP10Q7Z4F1 713 aa35.15■■■■□ 3.22
TPGS1-201ENST00000359315 BCORQ6W2J9 1755 aa35.15■■■■□ 3.22
TPGS1-201ENST00000359315 SERPINB2P05120 415 aa35.14■■■■□ 3.22
TPGS1-201ENST00000359315 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP35.14■■■■□ 3.22
TPGS1-201ENST00000359315 TTLL7Q6ZT98 887 aa35.14■■■■□ 3.22
TPGS1-201ENST00000359315 ERBB4Q15303 1308 aa35.13■■■■□ 3.21
TPGS1-201ENST00000359315 GPR162Q16538 588 aa35.12■■■■□ 3.21
TPGS1-201ENST00000359315 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa35.12■■■■□ 3.21
TPGS1-201ENST00000359315 CARMIL3Q8ND23 1372 aa35.12■■■■□ 3.21
TPGS1-201ENST00000359315 DCAF8L1A6NGE4 600 aa35.11■■■■□ 3.21
TPGS1-201ENST00000359315 HLFQ16534 295 aa35.11■■■■□ 3.21
TPGS1-201ENST00000359315 DUSP27Q5VZP5 1158 aa35.11■■■■□ 3.21
TPGS1-201ENST00000359315 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP35.11■■■■□ 3.21
TPGS1-201ENST00000359315 KIF13BQ9NQT8 1826 aa35.11■■■■□ 3.21
TPGS1-201ENST00000359315 A0A0G2JLW4 131 aa35.09■■■■□ 3.21
TPGS1-201ENST00000359315 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP35.09■■■■□ 3.21
TPGS1-201ENST00000359315 DPEP1P16444 411 aa35.08■■■■□ 3.21
TPGS1-201ENST00000359315 NRXN2Q9P2S2 1712 aa35.07■■■■□ 3.2
TPGS1-201ENST00000359315 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP35.07■■■■□ 3.2
TPGS1-201ENST00000359315 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa35.07■■■■□ 3.2
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