RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 SMIM5Q71RC9 77 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 ATP2B2Q01814 1243 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 SBNO1A3KN83 1393 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 KDM2BQ8NHM5 1336 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRC-201ENST00000348564 LRRC7Q96NW7 1537 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 APPP05067 770 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 NFE2L2Q16236 605 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 ABCF2Q9UG63 623 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 ALDH1B1P30837 517 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 IKQ13123 557 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 COPS6Q7L5N1 327 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 EYA3Q99504 573 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 ANKARQ7Z5J8 1434 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 RNMTO43148 476 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 C21orf2O43822 256 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 LGR6Q9HBX8 967 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 USP6P35125 1406 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 PALLDQ8WX93 1383 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 ERVV-2B6SEH9 535 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 HMMRO75330 724 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 CRKLP46109 303 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 DUSP27Q5VZP5 1158 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 BARGINQ6ZT62 677 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 PIGBQ92521 554 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 PHKG2P15735 406 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 NUTM1Q86Y26 1132 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 MTMR7Q9Y216 660 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 XAGE3Q8WTP9 111 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 SIL1Q9H173 461 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 KNDC1Q76NI1 1749 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 CEP126Q9P2H0 1117 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 CAVIN4Q5BKX8 364 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 METTL24Q5JXM2 366 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF790Q6PG37 636 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 OVOS2Q6IE36 1432 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 MYCP01106 439 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
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PTPRC-201ENST00000348564 CCDC152Q4G0S7 254 aa5.5□□□□□ -1.53
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PTPRC-201ENST00000348564 VPS53Q5VIR6 699 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 SULF1Q8IWU6 871 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 CD163L1Q9NR16 1453 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 ZBED9Q6R2W3 1325 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 MYOM1P52179 1685 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 MPNDQ8N594 471 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 GPATCH3Q96I76 525 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 TAOK3Q9H2K8 898 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 SUPT20HQ8NEM7 779 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 CHRNA5P30532 468 aa5.49□□□□□ -1.53
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PTPRC-201ENST00000348564 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa5.49□□□□□ -1.53
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PTPRC-201ENST00000348564 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 TMPOP42166 694 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
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PTPRC-201ENST00000348564 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 HYPKQ9NX55 129 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 CRB1P82279 1406 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 UFL1O94874 794 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 WASHC4Q2M389 1173 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-201ENST00000348564 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
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