RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340994.4

PKHD1-201, Transcript of PKHD1, fibrocystin/polyductin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PKHD1, Length 11,589 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1-201ENST00000340994 ABCC11Q96J66 1382 aa9.48□□□□□ -0.89
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PKHD1-201ENST00000340994 CEP57Q86XR8 500 aa9.48□□□□□ -0.89
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PKHD1-201ENST00000340994 NUP133Q8WUM0 1156 aa9.46□□□□□ -0.9
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PKHD1-201ENST00000340994 ALDH3A1P30838 453 aa9.46□□□□□ -0.9
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PKHD1-201ENST00000340994 TMC6Q7Z403 805 aa9.45□□□□□ -0.9
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PKHD1-201ENST00000340994 STMN2Q93045 179 aa9.44□□□□□ -0.9
PKHD1-201ENST00000340994 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
PKHD1-201ENST00000340994 TRERF1Q96PN7 1200 aa9.44□□□□□ -0.9
PKHD1-201ENST00000340994 FAM114A2Q9NRY5 505 aa9.44□□□□□ -0.9
PKHD1-201ENST00000340994 ERBINQ96RT1 1412 aa9.44□□□□□ -0.9
PKHD1-201ENST00000340994 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa9.44□□□□□ -0.9
PKHD1-201ENST00000340994 AK9Q5TCS8 1911 aa9.44□□□□□ -0.9
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