RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 RARSP54136 660 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC102AQ96A19 550 aa26.06■■□□□ 1.76
PTPRM-201ENST00000332175 NGLY1Q96IV0 654 aa26.06■■□□□ 1.76
PTPRM-201ENST00000332175 PPP4R3AQ6IN85 833 aa26.06■■□□□ 1.76
PTPRM-201ENST00000332175 TSG101Q99816 390 aa26.06■■□□□ 1.76
PTPRM-201ENST00000332175 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
PTPRM-201ENST00000332175 POTEJP0CG39 1038 aa26.06■■□□□ 1.76
PTPRM-201ENST00000332175 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
PTPRM-201ENST00000332175 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa26.05■■□□□ 1.76
PTPRM-201ENST00000332175 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
PTPRM-201ENST00000332175 CUL5Q93034 780 aa26.05■■□□□ 1.76
PTPRM-201ENST00000332175 C6orf229H3BNL8 230 aa26.04■■□□□ 1.76
PTPRM-201ENST00000332175 GOLGA8AA7E2F4 631 aa26.04■■□□□ 1.76
PTPRM-201ENST00000332175 GOLGA8BA8MQT2 603 aa26.04■■□□□ 1.76
PTPRM-201ENST00000332175 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
PTPRM-201ENST00000332175 NLRP5P59047 1200 aa26.04■■□□□ 1.76
PTPRM-201ENST00000332175 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
PTPRM-201ENST00000332175 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
PTPRM-201ENST00000332175 ALDH1L2Q3SY69 923 aa26.04■■□□□ 1.76
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
PTPRM-201ENST00000332175 IQCA1Q86XH1 822 aa26.04■■□□□ 1.76
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC148Q8NFR7 591 aa26.04■■□□□ 1.76
PTPRM-201ENST00000332175 DNA2P51530 1060 aa26.03■■□□□ 1.76
PTPRM-201ENST00000332175 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa26.03■■□□□ 1.76
PTPRM-201ENST00000332175 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
PTPRM-201ENST00000332175 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa26.03■■□□□ 1.76
PTPRM-201ENST00000332175 TMX1Q9H3N1 280 aa26.03■■□□□ 1.76
PTPRM-201ENST00000332175 SPA17Q15506 151 aa26.03■■□□□ 1.76
PTPRM-201ENST00000332175 HYPKQ9NX55 129 aa26.03■■□□□ 1.76
PTPRM-201ENST00000332175 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa26.02■■□□□ 1.76
PTPRM-201ENST00000332175 FKBP15Q5T1M5 1219 aa26.02■■□□□ 1.76
PTPRM-201ENST00000332175 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.02■■□□□ 1.76
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa26.02■■□□□ 1.76
PTPRM-201ENST00000332175 EXOC5O00471 708 aa26.02■■□□□ 1.76
PTPRM-201ENST00000332175 CD109Q6YHK3 1445 aa26.02■■□□□ 1.76
PTPRM-201ENST00000332175 VAT1LQ9HCJ6 419 aa26.01■■□□□ 1.75
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.01■■□□□ 1.75
PTPRM-201ENST00000332175 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa26.01■■□□□ 1.75
PTPRM-201ENST00000332175 SNRKQ9NRH2 765 aa26.01■■□□□ 1.75
PTPRM-201ENST00000332175 GOLIM4O00461 696 aa26.01■■□□□ 1.75
PTPRM-201ENST00000332175 PPFIA3O75145 1194 aa26.01■■□□□ 1.75
PTPRM-201ENST00000332175 WASLO00401 505 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
PTPRM-201ENST00000332175 NAIPQ13075 1403 aa26■■□□□ 1.75
PTPRM-201ENST00000332175 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.99■■□□□ 1.75
PTPRM-201ENST00000332175 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa25.99■■□□□ 1.75
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM266Q2M3C6 531 aa25.99■■□□□ 1.75
PTPRM-201ENST00000332175 KRT28Q7Z3Y7 464 aa25.99■■□□□ 1.75
PTPRM-201ENST00000332175 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
PTPRM-201ENST00000332175 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.99■■□□□ 1.75
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa25.98■■□□□ 1.75
PTPRM-201ENST00000332175 EZRP15311 586 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
PTPRM-201ENST00000332175 CPLX3Q8WVH0 158 aa25.98■■□□□ 1.75
PTPRM-201ENST00000332175 CATIPQ7Z7H3 387 aa25.98■■□□□ 1.75
PTPRM-201ENST00000332175 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC178Q5BJE1 867 aa25.97■■□□□ 1.75
PTPRM-201ENST00000332175 TSHZ3Q63HK5 1081 aa25.97■■□□□ 1.75
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC113Q9H0I3 377 aa25.97■■□□□ 1.75
PTPRM-201ENST00000332175 TNNT1P13805 278 aa25.97■■□□□ 1.75
PTPRM-201ENST00000332175 HAND2P61296 217 aa25.97■■□□□ 1.75
PTPRM-201ENST00000332175 ANO10Q9NW15 660 aa25.97■■□□□ 1.75
PTPRM-201ENST00000332175 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
PTPRM-201ENST00000332175 CKAP2LQ8IYA6 745 aa25.97■■□□□ 1.75
PTPRM-201ENST00000332175 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP25.97■■□□□ 1.75
PTPRM-201ENST00000332175 TOP2BQ02880 1626 aa25.96■■□□□ 1.75
PTPRM-201ENST00000332175 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa25.96■■□□□ 1.75
PTPRM-201ENST00000332175 FLIIQ13045 1269 aa25.96■■□□□ 1.75
PTPRM-201ENST00000332175 FAM83GA6ND36 823 aa25.96■■□□□ 1.75
PTPRM-201ENST00000332175 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
PTPRM-201ENST00000332175 CASQ1P31415 396 aa25.95■■□□□ 1.75
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC183Q5T5S1 534 aa25.95■■□□□ 1.75
PTPRM-201ENST00000332175 SLF2Q8IX21 1173 aa25.95■■□□□ 1.75
PTPRM-201ENST00000332175 CNNM3Q8NE01 707 aa25.95■■□□□ 1.75
PTPRM-201ENST00000332175 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.75
PTPRM-201ENST00000332175 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP25.95■■□□□ 1.74
PTPRM-201ENST00000332175 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
PTPRM-201ENST00000332175 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
PTPRM-201ENST00000332175 ANAPC15P60006 121 aa25.95■■□□□ 1.74
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP25.95■■□□□ 1.74
PTPRM-201ENST00000332175 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
PTPRM-201ENST00000332175 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
PTPRM-201ENST00000332175 ADGRL1O94910 1474 aa25.94■■□□□ 1.74
PTPRM-201ENST00000332175 CHRNA2Q15822 529 aa25.94■■□□□ 1.74
PTPRM-201ENST00000332175 RAB34Q9BZG1 259 aa25.94■■□□□ 1.74
PTPRM-201ENST00000332175 TOP1P11387 765 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
PTPRM-201ENST00000332175 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa25.94■■□□□ 1.74
PTPRM-201ENST00000332175 FEZ1Q99689 392 aa25.94■■□□□ 1.74
PTPRM-201ENST00000332175 GOPCQ9HD26 462 aa25.94■■□□□ 1.74
PTPRM-201ENST00000332175 SSFA2P28290 1259 aa25.94■■□□□ 1.74
PTPRM-201ENST00000332175 CETN2P41208 172 aa25.94■■□□□ 1.74
PTPRM-201ENST00000332175 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
PTPRM-201ENST00000332175 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
PTPRM-201ENST00000332175 ERICH4A6NGS2 130 aa25.93■■□□□ 1.74
PTPRM-201ENST00000332175 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM67Q5HYA8 995 aa25.93■■□□□ 1.74
PTPRM-201ENST00000332175 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
PTPRM-201ENST00000332175 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
PTPRM-201ENST00000332175 UBXN4Q92575 508 aa25.93■■□□□ 1.74
PTPRM-201ENST00000332175 PANK2Q9BZ23 570 aa25.93■■□□□ 1.74
PTPRM-201ENST00000332175 ABCC11Q96J66 1382 aa25.92■■□□□ 1.74
PTPRM-201ENST00000332175 MACROD2A1Z1Q3 448 aa25.92■■□□□ 1.74
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